94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0363 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_0363  C-methyltransferase  100 
 
 
416 aa  843    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0635  methyltransferase, putative  62.72 
 
 
411 aa  521  1e-147  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0067  C-methyltransferase  57.57 
 
 
413 aa  477  1e-133  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0480856  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0438  methyltransferase, putative  49.88 
 
 
433 aa  441  9.999999999999999e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.874295  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3390  C-methyltransferase  50 
 
 
420 aa  440  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0218606  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4987  C-methyltransferase  52 
 
 
431 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0381  putative methyltransferase  49.64 
 
 
433 aa  436  1e-121  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3333  C-methyltransferase  48.53 
 
 
413 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2784  C-methyltransferase  48.04 
 
 
413 aa  424  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.611308 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4217  C-methyltransferase  51.6 
 
 
411 aa  422  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.858444  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4509  C-methyltransferase  50.12 
 
 
411 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.391824  normal  0.0572283 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0807  C-methyltransferase  51.84 
 
 
409 aa  412  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.409336 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4219  methyltransferase type 12  50.37 
 
 
412 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0848  C-methyltransferase  51.6 
 
 
409 aa  410  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.436527  normal  0.303178 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5197  C-methyltransferase  48.28 
 
 
415 aa  408  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1048  putative SAM-dependent methyltransferase  50.61 
 
 
420 aa  404  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195919  normal  0.773577 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0772  C-methyltransferase  51.11 
 
 
409 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0227083 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0776  C-methyltransferase  44.94 
 
 
411 aa  393  1e-108  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3401  methyltransferase  47.16 
 
 
407 aa  392  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3375  methyltransferase  47.16 
 
 
407 aa  395  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3397  methyltransferase, putative  47.41 
 
 
407 aa  392  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3071  methyltransferase  47.16 
 
 
407 aa  388  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3350  C-methyltransferase  47.46 
 
 
400 aa  382  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.295208  normal  0.715465 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1513  hypothetical protein  46.19 
 
 
408 aa  382  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2770  methyltransferase type 12  45.34 
 
 
408 aa  382  1e-105  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3060  C-methyltransferase  46.78 
 
 
406 aa  382  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0594  C-methyltransferase  46.91 
 
 
407 aa  379  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.881628  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0057  putative C-3 methyl transferase  49.87 
 
 
410 aa  380  1e-104  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00760269  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1962  C-methyltransferase  45.43 
 
 
407 aa  370  1e-101  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3716  C-methyltransferase  47.17 
 
 
407 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1871  C-methyltransferase  48.79 
 
 
413 aa  365  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.804572  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0629  hypothetical protein  45.07 
 
 
409 aa  357  1.9999999999999998e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14051  hypothetical protein  43.46 
 
 
402 aa  351  1e-95  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4417  C-methyltransferase  46.57 
 
 
438 aa  348  1e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27750  hypothetical protein  46.63 
 
 
373 aa  332  7.000000000000001e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6562  C-methyltransferase  45.91 
 
 
410 aa  329  6e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3938  methyltransferase type 12  44.55 
 
 
444 aa  308  2.0000000000000002e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.16065  normal  0.145676 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2158  C-methyltransferase  39.05 
 
 
409 aa  297  2e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0790  C-methyltransferase  43.97 
 
 
427 aa  291  2e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00493713  normal  0.231188 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2947  C-methyltransferase  41.9 
 
 
415 aa  285  7e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00433807  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3092  C-methyltransferase  40 
 
 
410 aa  277  2e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.763523  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2386  C-methyltransferase  40.05 
 
 
410 aa  270  2.9999999999999997e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4225  C-methyltransferase  36.59 
 
 
407 aa  270  4e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.791496  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1221  C-methyltransferase  37.19 
 
 
419 aa  257  2e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.38117  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5658  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  33.5 
 
 
421 aa  245  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311747  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07271  hypothetical protein  32.02 
 
 
418 aa  244  3e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.298061  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2759  C-methyltransferase  36.3 
 
 
405 aa  243  6e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.13285  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4712  C-methyltransferase  35.82 
 
 
408 aa  229  8e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.844153 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2118  C-methyltransferase  35.12 
 
 
406 aa  228  1e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.510018  normal  0.0302661 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29890  methyltransferase family protein  35.28 
 
 
408 aa  226  7e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.942698 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2379  C-methyltransferase  32 
 
 
400 aa  216  5.9999999999999996e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2430  C-methyltransferase  31.5 
 
 
400 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3991  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  31.33 
 
 
413 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1758  C-methyltransferase  30.46 
 
 
409 aa  182  8.000000000000001e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.651546  normal  0.587212 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0809  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  29 
 
 
412 aa  172  7.999999999999999e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2122  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  28.42 
 
 
409 aa  172  1e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0486559  normal  0.0722153 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0705  methyltransferase  29 
 
 
412 aa  172  1e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2265  C-methyltransferase  29.06 
 
 
436 aa  171  2e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1599  D-mycarose 3-C-methyltransferase  27.7 
 
 
416 aa  165  1.0000000000000001e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2403  C-methyltransferase  29.78 
 
 
400 aa  126  7e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0365  C-methyltransferase  28.08 
 
 
376 aa  117  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.131067  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0212  C-methyltransferase  33.18 
 
 
359 aa  108  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.821739 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1565  methyltransferase type 12  29.01 
 
 
396 aa  105  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.663655  normal  0.440278 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0071  aminotransferase class-III  28.39 
 
 
817 aa  94.7  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1270  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  35.04 
 
 
178 aa  91.7  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0673649 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6563  C-methyltransferase  26.32 
 
 
396 aa  90.1  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2387  C-methyltransferase  25.88 
 
 
402 aa  90.1  7e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3088  C-methyltransferase  27.53 
 
 
406 aa  89  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2948  C-methyltransferase  24.87 
 
 
391 aa  85.9  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.236256  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3091  C-methyltransferase  25.69 
 
 
406 aa  83.2  0.000000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1566  putative sugar nucleotide processing enzyme  29.02 
 
 
414 aa  78.2  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.445342 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6557  methyltransferase type 12  28.24 
 
 
425 aa  76.6  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2391  methyltransferase type 12  25.06 
 
 
406 aa  73.9  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.044338  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2880  Methyltransferase type 11  25.74 
 
 
383 aa  73.2  0.000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252544  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3347  methyltransferase  26.84 
 
 
390 aa  65.1  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0988027  normal  0.589908 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2166  Methyltransferase type 12  23.42 
 
 
397 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1964  methyltransferase type 11  24.29 
 
 
352 aa  60.8  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3959  C-methyltransferase  25.32 
 
 
414 aa  58.9  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00636655  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0370  methyltransferase type 12  30.63 
 
 
382 aa  57  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2163  C-methyltransferase  20.82 
 
 
421 aa  57  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.615529  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5655  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  26.82 
 
 
392 aa  56.6  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0150  putative methyltransferase  26.51 
 
 
401 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02801  hypothetical protein  19.75 
 
 
411 aa  56.2  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.484397 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3714  methyltransferase type 11  24.79 
 
 
361 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0163  putative methyltransferase  26.17 
 
 
401 aa  53.9  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2994  methyltransferase type 12  24.13 
 
 
401 aa  49.7  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.290652  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14431  hypothetical protein  23.13 
 
 
341 aa  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.131958  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1487  hypothetical protein  29.07 
 
 
300 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.767872 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0535  hypothetical protein  20.98 
 
 
379 aa  47  0.0006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0106  methyltransferase type 12  19.01 
 
 
306 aa  46.2  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000284903 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1809  putative sugar transferase  20.4 
 
 
401 aa  44.3  0.004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0296  Methyltransferase type 12  23.15 
 
 
326 aa  44.3  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3105  methyltransferase type 12  23.17 
 
 
391 aa  43.9  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0453  hypothetical protein  21.13 
 
 
305 aa  43.5  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>