More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3433 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0084  hypothetical protein  83.38 
 
 		 391 aa  666    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.928121  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3433  hypothetical protein  100 
 
 		 391 aa  795    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3621  hypothetical protein  74.1 
 
 		 389 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0085  hypothetical protein  66.93 
 
 		 389 aa  523  1e-147  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0068  hypothetical protein  67.18 
 
 		 389 aa  518  1e-146  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.19832e-26 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0455  hypothetical protein  63.85 
 
 		 387 aa  502  1e-141  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1884  hypothetical protein  39.75 
 
 		 395 aa  273  5.000000000000001e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.228041  normal  0.262576 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2134  hypothetical protein  41.73 
 
 		 391 aa  261  1e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.452249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4642  hypothetical protein  39.11 
 
 		 387 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6440  hypothetical protein  39.53 
 
 		 387 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0145661 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0772  hypothetical protein  36.88 
 
 		 389 aa  248  1e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1048  hypothetical protein  40.4 
 
 		 392 aa  246  6e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2474  hypothetical protein  36.62 
 
 		 393 aa  240  2.9999999999999997e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.651343  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1016  hypothetical protein  39.03 
 
 		 392 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2341  hypothetical protein  39.34 
 
 		 392 aa  233  5e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1145  hypothetical protein  37.14 
 
 		 391 aa  228  1e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0013509  normal  0.0789492 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2412  hypothetical protein  36.13 
 
 		 392 aa  227  3e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.190966 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3457  hypothetical protein  38.52 
 
 		 390 aa  224  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171276  hitchhiker  0.0000085327 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1794  hypothetical protein  37.4 
 
 		 393 aa  218  2e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000759831  normal  0.944472 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01830  arylformamidase, putative  32.87 
 
 		 451 aa  196  7e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0513  aminotransferase  33.71 
 
 		 392 aa  177  3e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1564  aminotransferase class I and II  34.54 
 
 		 400 aa  176  7e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3898  aminotransferase, class I and II  32.2 
 
 		 409 aa  173  3.9999999999999995e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.157846 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2542  aminotransferase, class I and II  33.05 
 
 		 399 aa  173  5e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.17642 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0236  aminotransferase, class I and II  29.53 
 
 		 388 aa  159  8e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4126  aromatic amino acid aminotransferase  28.41 
 
 		 394 aa  157  4e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0542  aminotransferase, class I and II  30.4 
 
 		 367 aa  154  2e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0515807  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1153  aminotransferase  34.66 
 
 		 398 aa  154  4e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1196  aspartate aminotransferase  27.49 
 
 		 388 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1546  aspartate aminotransferase  28.77 
 
 		 398 aa  149  6e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.623747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1225  aspartate aminotransferase  26.58 
 
 		 391 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1144  aspartate aminotransferase  29.17 
 
 		 381 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.859107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1578  aspartate aminotransferase  27.42 
 
 		 387 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.776902  hitchhiker  0.00064422 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1124  aspartate aminotransferase  33.44 
 
 		 398 aa  146  5e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0292  aspartate aminotransferase  30.73 
 
 		 400 aa  146  7.0000000000000006e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1664  aminotransferase, class I and II  30.81 
 
 		 403 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1684  aspartate aminotransferase  29.97 
 
 		 396 aa  145  9e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.121725  normal  0.0684909 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0185  aminotransferase, class I and II  27.35 
 
 		 388 aa  145  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603276  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1877  aminotransferase class I and II  26.5 
 
 		 402 aa  145  2e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1342  aspartate aminotransferase  32.82 
 
 		 398 aa  144  2e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3695  aspartate aminotransferase  27.49 
 
 		 391 aa  144  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3007  hypothetical protein  28.87 
 
 		 390 aa  144  4e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10411  aspartate aminotransferase  28.93 
 
 		 401 aa  143  6e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0081  aminotransferase, class I and II  27.9 
 
 		 398 aa  143  6e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0436  aspartate aminotransferase  26.58 
 
 		 381 aa  142  8e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4527  aminotransferase class I and II  29.33 
 
 		 415 aa  140  3e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10418  predicted protein  30.54 
 
 		 375 aa  140  3e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00425999  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3240  aminotransferase, class I and II  30.4 
 
 		 388 aa  139  7.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3512  hypothetical protein  27.22 
 
 		 396 aa  138  1e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2619  aminotransferase class I and II  31.29 
 
 		 366 aa  138  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28200  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  30.61 
 
 		 379 aa  137  3.0000000000000003e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000110278  normal  0.621857 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4358  aminotransferase class I and II  30.4 
 
 		 406 aa  136  5e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6643  aspartate aminotransferase  30.67 
 
 		 413 aa  136  6.0000000000000005e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0535  aminotransferase class I and II  30.61 
 
 		 401 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.169316  normal  0.0112885 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2664  aminotransferase class I and II  29.51 
 
 		 393 aa  136  8e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0937488  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17330  aspartate aminotransferase  30.91 
 
 		 402 aa  136  8e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1423  aminotransferase  27.89 
 
 		 384 aa  135  9e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1119  aminotransferase class I and II  30.53 
 
 		 368 aa  135  9.999999999999999e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.650754  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3740  aminotransferase class I and II  28.62 
 
 		 397 aa  135  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0346922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3192  aminotransferase, class I and II  29.97 
 
 		 399 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.593441  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5107  aminotransferase class I and II  28.11 
 
 		 405 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.294065  normal  0.505049 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3728  aminotransferase class I and II  29.32 
 
 		 387 aa  135  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181067 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0363  aminotransferase  29.32 
 
 		 390 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0300  aspartate aminotransferase  32.19 
 
 		 427 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0401102 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4633  hypothetical protein  27.86 
 
 		 396 aa  134  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  26.55 
 
 		 390 aa  134  3e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1888  aminotransferase  26.51 
 
 		 370 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2182  aminotransferase, class I and II  29.21 
 
 		 405 aa  133  5e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100524  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1627  aminotransferase, class I and II  30.89 
 
 		 393 aa  133  5e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.703964 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5012  hypothetical protein  27.55 
 
 		 396 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4771  hypothetical protein  27.55 
 
 		 396 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4611  hypothetical protein  27.55 
 
 		 396 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5133  hypothetical protein  27.55 
 
 		 396 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4723  hypothetical protein  27.55 
 
 		 396 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5045  hypothetical protein  27.55 
 
 		 396 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5040  hypothetical protein  27.55 
 
 		 396 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5033  hypothetical protein  27.73 
 
 		 396 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.145667  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2679  aminotransferase class I and II  27.64 
 
 		 411 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2674  aminotransferase  30.17 
 
 		 393 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2564  aminotransferase class I and II  31.6 
 
 		 386 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0568  L-aspartate aminotransferase  26.8 
 
 		 399 aa  131  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0641673 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1431  aminotransferase class I and II  27.73 
 
 		 391 aa  131  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000143032 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2218  aminotransferase class I and II  33.24 
 
 		 382 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.156784  normal  0.455276 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2661  aspartate aminotransferase  28.38 
 
 		 402 aa  130  3e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.975518  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2709  aspartate aminotransferase  28.88 
 
 		 405 aa  130  3e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0229127 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0201  hypothetical protein  27.3 
 
 		 396 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.39659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3209  aspartate aminotransferase  33.73 
 
 		 410 aa  130  5.0000000000000004e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.053672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2192  aspartate aminotransferase  28.17 
 
 		 385 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1200  aminotransferase, class I and II  27.86 
 
 		 371 aa  129  7.000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.162477  normal  0.0266801 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1677  aminotransferase class I and II  30.62 
 
 		 392 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.206654  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0165  aminotransferase, class I and II  28.78 
 
 		 390 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3474  aminotransferase class I and II  30.06 
 
 		 393 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.151006 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3837  aminotransferase A  26.14 
 
 		 387 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.995763  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6569  aminotransferase, classes I and II  30.66 
 
 		 394 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00706713  hitchhiker  0.00702095 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0323  aspartate aminotransferase  28.14 
 
 		 417 aa  128  2.0000000000000002e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00219132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0003  aminotransferase  27.32 
 
 		 387 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1295  aminotransferase class I and II  32.11 
 
 		 398 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.768016 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1955  aminotransferase  28.41 
 
 		 392 aa  127  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0276062 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0958  aspartate aminotransferase  28.73 
 
 		 381 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0801  aminotransferase, class I and II  28.72 
 
 		 384 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>