More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2685 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2685  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  100 
 
 		 346 aa  708    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000061721  normal  0.591184 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1111  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  83.19 
 
 		 360 aa  595  1e-169  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000337587  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1581  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  76.4 
 
 		 343 aa  555  1e-157  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000011547  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0427  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  73.53 
 
 		 347 aa  522  1e-147  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.273579  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3610  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  73.24 
 
 		 351 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2558  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  72.4 
 
 		 351 aa  507  1e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  8.150479999999999e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1655  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  72.11 
 
 		 351 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0167472  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2022  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  61.9 
 
 		 371 aa  435  1e-121  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2311  radical SAM protein  54.41 
 
 		 371 aa  369  1e-101  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4057  radical SAM domain-containing protein  50.6 
 
 		 342 aa  356  3.9999999999999996e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.291969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1631  hypothetical protein  50.58 
 
 		 372 aa  355  8.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.212269  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2317  radical SAM enzyme, Cfr family  50.29 
 
 		 372 aa  353  2.9999999999999997e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.144753  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2229  radical SAM enzyme, Cfr family  50.29 
 
 		 372 aa  352  4e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.225702  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2180  radical SAM protein  50.15 
 
 		 377 aa  334  1e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0041  radical SAM protein  47.49 
 
 		 392 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0269  hypothetical protein  47.92 
 
 		 410 aa  327  1.0000000000000001e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.169274 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2806  hypothetical protein  48.55 
 
 		 427 aa  325  6e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1382  radical SAM superfamily protein  46.93 
 
 		 392 aa  325  6e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0050  radical SAM protein  46.93 
 
 		 392 aa  325  6e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.890909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0093  hypothetical protein  48.55 
 
 		 399 aa  324  1e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.82991  normal  0.435247 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3626  hypothetical protein  48.27 
 
 		 397 aa  324  1e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.674584  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0709  hypothetical protein  48.52 
 
 		 398 aa  322  6e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0035  hypothetical protein  48.17 
 
 		 399 aa  322  7e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0401  radical SAM enzyme, Cfr family  48.66 
 
 		 399 aa  322  8e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.213699  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2700  radical SAM protein  46.89 
 
 		 390 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.83245  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3329  hypothetical protein  47.81 
 
 		 428 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2993  radical SAM protein  47.55 
 
 		 356 aa  320  1.9999999999999998e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00523882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0241  putative pyruvate formate lyase activating enzyme 2 (yfgB)  46.96 
 
 		 403 aa  317  1e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.283575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0591  hypothetical protein  45.89 
 
 		 372 aa  317  2e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.196855  normal  0.247417 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2505  radical SAM protein  47.89 
 
 		 391 aa  315  8e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.282858  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2051  radical SAM protein  47.14 
 
 		 376 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0429585  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1336  radical SAM family enzyme  45.19 
 
 		 370 aa  313  1.9999999999999998e-84  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1397  radical SAM protein  45.19 
 
 		 370 aa  313  1.9999999999999998e-84  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.724249  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5856  radical SAM enzyme, Cfr family  44.93 
 
 		 378 aa  313  2.9999999999999996e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1592  radical SAM enzyme, Cfr family  46.05 
 
 		 425 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.368814  normal  0.725987 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1816  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  45.66 
 
 		 354 aa  312  3.9999999999999997e-84  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1124  radical SAM protein  44.51 
 
 		 369 aa  312  4.999999999999999e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.371918  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1892  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  47.95 
 
 		 381 aa  311  7.999999999999999e-84  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1431  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  46.76 
 
 		 367 aa  311  1e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1640  radical SAM protein  45.78 
 
 		 425 aa  311  1e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.100638  normal  0.136917 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0850  radical SAM enzyme, Cfr family  43.39 
 
 		 381 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0893  radical SAM protein  43.39 
 
 		 381 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000355307 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0880  radical SAM protein  43.39 
 
 		 381 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.588351  normal  0.297118 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4328  radical SAM protein  43.39 
 
 		 381 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000214748 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3311  radical SAM enzyme  48.94 
 
 		 406 aa  310  2.9999999999999997e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.853243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1922  radical SAM enzyme, Cfr family  45.5 
 
 		 425 aa  309  5e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0056484 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1479  hypothetical protein  45.35 
 
 		 382 aa  308  8e-83  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2851  hypothetical protein  45.4 
 
 		 375 aa  308  8e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1791  radical SAM protein  47.37 
 
 		 359 aa  307  1.0000000000000001e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3014  hypothetical protein  46.52 
 
 		 397 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.327469 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1119  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  46.15 
 
 		 371 aa  306  3e-82  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1504  hypothetical protein  45.07 
 
 		 382 aa  306  4.0000000000000004e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2962  radical SAM protein  46.78 
 
 		 402 aa  306  4.0000000000000004e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.161045 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0461  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  47.25 
 
 		 364 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.745055  normal  0.162604 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2967  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  47.97 
 
 		 358 aa  305  5.0000000000000004e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0788473  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1380  radical SAM protein  47.88 
 
 		 399 aa  305  7e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2859  radical SAM protein  47.45 
 
 		 408 aa  305  9.000000000000001e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1122  radical SAM protein  46.03 
 
 		 430 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09940  radical SAM enzyme, Cfr family  43.77 
 
 		 349 aa  305  1.0000000000000001e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0185  radical SAM protein  45.89 
 
 		 404 aa  303  3.0000000000000004e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.582725 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1623  hypothetical protein  44.02 
 
 		 362 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00271207 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0059  radical SAM enzyme, Cfr family  45.7 
 
 		 358 aa  302  5.000000000000001e-81  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.955574  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0398  radical SAM protein  46.49 
 
 		 414 aa  301  1e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0578367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3068  radical SAM protein  45.43 
 
 		 413 aa  301  1e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4556  radical SAM protein  44.12 
 
 		 431 aa  300  2e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.15006  decreased coverage  0.00152892 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2087  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  46.65 
 
 		 356 aa  300  2e-80  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.122222  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1602  radical SAM enzyme, Cfr family  50.3 
 
 		 363 aa  300  2e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.113295 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1930  radical SAM enzyme, Cfr family  50.3 
 
 		 362 aa  300  2e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4488  radical SAM enzyme, Cfr family  43.94 
 
 		 431 aa  301  2e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3724  radical SAM enzyme, Cfr family  46.76 
 
 		 408 aa  300  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4047  radical SAM enzyme, Cfr family  45.08 
 
 		 409 aa  300  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0076  hypothetical protein  44.17 
 
 		 411 aa  299  5e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.525724  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2379  hypothetical protein  45.14 
 
 		 365 aa  299  5e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.444977  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1353  radical SAM protein  44.22 
 
 		 371 aa  299  5e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000160208 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0900  hypothetical protein  45.69 
 
 		 372 aa  298  6e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3503  radical SAM protein  42.94 
 
 		 382 aa  298  6e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0090  radical SAM protein  46.47 
 
 		 411 aa  298  7e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1743  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  43.91 
 
 		 358 aa  298  8e-80  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.499617  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0085  radical SAM enzyme, Cfr family  41.81 
 
 		 404 aa  298  1e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.176991  normal  0.136088 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14830  hypothetical protein  42.65 
 
 		 379 aa  297  1e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4168  Fe-S-cluster redox protein  47.06 
 
 		 410 aa  298  1e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.433493  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0077  hypothetical protein  43.9 
 
 		 411 aa  297  2e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0445  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  44.48 
 
 		 386 aa  297  2e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0759  radical SAM protein  44.54 
 
 		 391 aa  296  2e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3393  radical SAM enzyme, Cfr family  43.85 
 
 		 382 aa  297  2e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2243  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  45.1 
 
 		 359 aa  297  2e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.726084 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1616  hypothetical protein  45.94 
 
 		 339 aa  297  2e-79  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.787812 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1882  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  45.77 
 
 		 356 aa  296  4e-79  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.461219  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1308  hypothetical protein  42.65 
 
 		 378 aa  296  4e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141756  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0007  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  46.06 
 
 		 356 aa  296  4e-79  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0937459  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1253  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  45.01 
 
 		 373 aa  296  5e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.405878  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1245  hypothetical protein  41.5 
 
 		 382 aa  295  7e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01368  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  44.51 
 
 		 372 aa  295  9e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000522962  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1087  radical SAM enzyme, Cfr family  44.99 
 
 		 383 aa  295  1e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.486861  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1167  radical SAM protein  44.99 
 
 		 374 aa  295  1e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0732  radical SAM enzyme, Cfr family  43.77 
 
 		 377 aa  295  1e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1292  radical SAM protein  43.77 
 
 		 402 aa  293  2e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000206153  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1431  radical SAM enzyme, Cfr family  41.5 
 
 		 382 aa  294  2e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2988  hypothetical protein  43.73 
 
 		 364 aa  293  2e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.45923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1721  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  44.67 
 
 		 354 aa  294  2e-78  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.428537  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>