187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1749 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1749  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  323  5e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.116925 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1233  phosphoesterase, putative  54.55 
 
 		 161 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2286  phosphodiesterase  47.1 
 
 		 156 aa  157  4e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3113  phosphodiesterase, MJ0936 family  47.1 
 
 		 154 aa  140  5e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2552  phosphodiesterase  48.25 
 
 		 156 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0760667  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1149  phosphodiesterase, MJ0936 family  46.45 
 
 		 154 aa  138  3e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2498  phosphodiesterase, MJ0936 family  42.95 
 
 		 157 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0714523  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0455  hypothetical protein  41.29 
 
 		 157 aa  109  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2682  phosphodiesterase  37.01 
 
 		 162 aa  108  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0319017  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0553  phosphodiesterase  38.06 
 
 		 166 aa  107  7.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.279938  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2238  Ser/Thr protein phosphatase family protein  39.84 
 
 		 156 aa  99  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000739352  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0370  phosphodiesterase  38.26 
 
 		 164 aa  98.6  3e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000132589  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2534  Ser/Thr protein phosphatase family protein  36.84 
 
 		 156 aa  95.9  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000590014  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2598  phosphodiesterase, MJ0936 family  37.97 
 
 		 169 aa  94.7  5e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3620  phosphodiesterase, MJ0936 family  36.13 
 
 		 162 aa  93.2  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.626533  normal  0.471048 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1949  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.54 
 
 		 178 aa  92.4  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0118303  normal  0.874816 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1354  phosphodiesterase, MJ0936 family  36.05 
 
 		 159 aa  89.7  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000205974  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0839  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.16 
 
 		 158 aa  87.8  6e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0437301  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3200  phosphodiesterase  32.47 
 
 		 168 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000491487  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1477  phosphodiesterase  35.76 
 
 		 148 aa  80.5  0.000000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4584  phosphoesterase, putative  34.64 
 
 		 167 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000507537  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4232  phosphoesterase  34.64 
 
 		 167 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122501  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4375  phosphoesterase  33.99 
 
 		 167 aa  78.6  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000541697  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4216  phosphoesterase  33.99 
 
 		 167 aa  78.6  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.40819e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4713  phosphoesterase  33.99 
 
 		 167 aa  78.6  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000214333  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4569  putative phosphoesterase  33.99 
 
 		 167 aa  78.6  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4619  putative phosphoesterase  33.99 
 
 		 167 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000289782  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4599  putative phosphoesterase  33.99 
 
 		 167 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000119915  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0852  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.54 
 
 		 163 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4323  phosphodiesterase  34.64 
 
 		 167 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000918011  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0735  phosphoesterase, putative  33.78 
 
 		 169 aa  75.5  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0636  putative phosphoesterase  33.33 
 
 		 167 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000610703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1715  phosphodiesterase  31.29 
 
 		 187 aa  73.6  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1642  phosphodiesterase  30.67 
 
 		 187 aa  73.6  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1211  phosphodiesterase  30.19 
 
 		 167 aa  71.6  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1233  phosphodiesterase  30.19 
 
 		 167 aa  71.6  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.23844  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0899  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.47 
 
 		 156 aa  70.1  0.00000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1401  hypothetical protein  36.44 
 
 		 167 aa  69.3  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0810  phosphodiesterase  30.95 
 
 		 164 aa  69.7  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0304  hypothetical protein  30.83 
 
 		 173 aa  68.6  0.00000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.251513  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0745  phosphodiesterase  30.54 
 
 		 163 aa  68.9  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.751272  normal  0.75862 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0011  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.84 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00169497  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03780  phosphoesterase, MJ0936 family  31.79 
 
 		 157 aa  68.9  0.00000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00356209  normal  0.195847 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1173  phosphodiesterase  29.34 
 
 		 163 aa  68.6  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.111939  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2580  phosphodiesterase  34.38 
 
 		 161 aa  68.2  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1510  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.57 
 
 		 159 aa  67.8  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0681  phosphoesterase  35.04 
 
 		 177 aa  66.6  0.0000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1420  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.12 
 
 		 181 aa  65.9  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.856818  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0524  phosphodiesterase  31.93 
 
 		 182 aa  66.2  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0250808  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1240  phosphodiesterase  30.38 
 
 		 184 aa  64.7  0.0000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1793  phosphodiesterase, MJ0936 family  35.14 
 
 		 172 aa  64.3  0.0000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.696685  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0076  phosphodiesterase  28.74 
 
 		 163 aa  63.9  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1257  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.46 
 
 		 150 aa  63.5  0.000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0289  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.03 
 
 		 170 aa  62  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0338  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.56 
 
 		 175 aa  61.2  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0641  phosphodiesterase  29.52 
 
 		 185 aa  61.6  0.000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.558734  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1598  hypothetical protein  28.79 
 
 		 173 aa  60.1  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1164  putative phosphodiesterase (yfcE)  32.9 
 
 		 154 aa  60.1  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1287  phosphodiesterase  33.81 
 
 		 168 aa  60.1  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1836  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.12 
 
 		 170 aa  60.1  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0825  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.83 
 
 		 167 aa  60.1  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1391  phosphodiesterase  30.72 
 
 		 171 aa  59.3  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2257  phosphodiesterase  27.84 
 
 		 184 aa  58.9  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1503  phosphoesterase  28.83 
 
 		 168 aa  58.9  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.802300000000002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0943  phosphodiesterase  27.01 
 
 		 254 aa  58.9  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.461834  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04590  hypothetical protein  29.11 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4206  phosphodiesterase  28.48 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0921  phosphodiesterase  26.54 
 
 		 254 aa  57.8  0.00000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00301571  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0444  hypothetical protein  29.11 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1245  phosphodiesterase  30.63 
 
 		 171 aa  57.4  0.00000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0738  phosphodiesterase  31.08 
 
 		 181 aa  57.4  0.00000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0517  phosphodiesterase  30.63 
 
 		 171 aa  57.4  0.00000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.745546  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3565  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.95 
 
 		 169 aa  57.4  0.00000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2626  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.3 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.655099 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1628  phosphodiesterase  27.11 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1638  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.7 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2607  phosphodiesterase  29.09 
 
 		 168 aa  55.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000199018  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1000  hypothetical protein  32.14 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0102337 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3036  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.28 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0611  phosphoesterase  31.39 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08250  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.75 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3196  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.09 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.352937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2256  phosphodiesterase  28.57 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2127  phosphodiesterase  31.45 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.214713 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3191  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.31 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1668  phosphodiesterase  31.78 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1741  phosphodiesterase  31.78 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0456  phosphodiesterase  31.33 
 
 		 181 aa  54.3  0.0000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19410  phosphoesterase, MJ0936 family  28.99 
 
 		 195 aa  53.9  0.0000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000114035 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0543  phosphodiesterase  30.28 
 
 		 172 aa  53.9  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.10472  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0919  phosphodiesterase  27.85 
 
 		 188 aa  52.8  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000234313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2849  phosphodiesterase  33.98 
 
 		 183 aa  52.8  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000408209  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6302  phosphodiesterase  26.95 
 
 		 177 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.317374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0395  phosphodiesterase, MJ0936 family  35.59 
 
 		 176 aa  52.4  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2058  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.67 
 
 		 168 aa  52.4  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000252538 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1492  phosphodiesterase  28.83 
 
 		 160 aa  52.4  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0345  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.33 
 
 		 162 aa  52  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.24583 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0437  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.53 
 
 		 167 aa  51.6  0.000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1578  phosphoesterase, putative  35.21 
 
 		 219 aa  51.2  0.000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1389  phosphodiesterase  27.65 
 
 		 178 aa  51.2  0.000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>