More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2054 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2054  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 		 151 aa  307  2.9999999999999997e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2377  3-dehydroquinate dehydratase  70.95 
 
 		 149 aa  210  7e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2058  3-dehydroquinate dehydratase  55.63 
 
 		 193 aa  184  3e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2433  3-dehydroquinate dehydratase  61.15 
 
 		 149 aa  182  1.0000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.587468  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0883  3-dehydroquinate dehydratase  57.14 
 
 		 160 aa  179  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.893545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1913  3-dehydroquinate dehydratase  55.1 
 
 		 152 aa  179  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.643127  normal  0.307548 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4568  3-dehydroquinate dehydratase  56.43 
 
 		 151 aa  177  4e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03030  3-dehydroquinate dehydratase  57.34 
 
 		 148 aa  176  7e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.343672  hitchhiker  0.0000797805 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0579  3-dehydroquinate dehydratase  52.98 
 
 		 193 aa  176  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0849  3-dehydroquinate dehydratase  52.32 
 
 		 151 aa  175  2e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5193  3-dehydroquinate dehydratase  55.17 
 
 		 151 aa  175  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2207  3-dehydroquinate dehydratase  52.32 
 
 		 151 aa  175  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2041  3-dehydroquinate dehydratase  56.25 
 
 		 149 aa  175  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.775923 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1896  3-dehydroquinate dehydratase  52.32 
 
 		 193 aa  175  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0344  3-dehydroquinate dehydratase  55.86 
 
 		 151 aa  175  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960001  normal  0.658958 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0482  3-dehydroquinate dehydratase  52.32 
 
 		 193 aa  175  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.644593  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0892  3-dehydroquinate dehydratase  52.32 
 
 		 151 aa  175  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.396481  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1753  3-dehydroquinate dehydratase  52.32 
 
 		 151 aa  175  2e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.111772  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3419  3-dehydroquinate dehydratase  55.86 
 
 		 151 aa  174  4e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0105986  normal  0.197082 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4665  3-dehydroquinate dehydratase  55.17 
 
 		 151 aa  174  4e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560222  normal  0.542393 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38070  3-dehydroquinate dehydratase  55 
 
 		 147 aa  174  5e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.633165  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4902  3-dehydroquinate dehydratase  53.52 
 
 		 146 aa  173  6e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2407  3-dehydroquinate dehydratase  54.86 
 
 		 149 aa  173  7e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0668809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3288  3-dehydroquinate dehydratase  54.48 
 
 		 152 aa  173  7e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.796587 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3063  3-dehydroquinate dehydratase  55.17 
 
 		 151 aa  173  8e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.816098  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4964  3-dehydroquinate dehydratase  55.17 
 
 		 151 aa  173  8e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0222066 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5304  3-dehydroquinate dehydratase  55.17 
 
 		 151 aa  173  8e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0349681 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3290  3-dehydroquinate dehydratase  53.85 
 
 		 152 aa  173  9e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267239  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21280  3-dehydroquinate dehydratase  60.74 
 
 		 150 aa  172  9.999999999999999e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.775201  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2094  3-dehydroquinate dehydratase, type II  56.39 
 
 		 142 aa  172  9.999999999999999e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.641417  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0908  3-dehydroquinate dehydratase  53.1 
 
 		 157 aa  170  5e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.286667  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0904  3-dehydroquinate dehydratase  53.1 
 
 		 176 aa  170  5.999999999999999e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.92679  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2272  3-dehydroquinate dehydratase  51.72 
 
 		 176 aa  169  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156045  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0330  3-dehydroquinate dehydratase  55.17 
 
 		 148 aa  169  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.7522  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2187  3-dehydroquinate dehydratase  55.32 
 
 		 156 aa  169  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.379626  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0954  3-dehydroquinate dehydratase  56.12 
 
 		 148 aa  167  5e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0330586 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5453  3-dehydroquinate dehydratase  56.03 
 
 		 147 aa  167  5e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.747889  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0045  3-dehydroquinate dehydratase, type II  53.52 
 
 		 144 aa  166  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.152368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5950  3-dehydroquinate dehydratase  56.83 
 
 		 149 aa  166  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0375239  normal  0.0174964 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5319  3-dehydroquinate dehydratase  55.4 
 
 		 149 aa  164  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1751  3-dehydroquinate dehydratase  53.9 
 
 		 156 aa  164  4e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0911231  normal  0.235606 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2104  3-dehydroquinate dehydratase  53.85 
 
 		 148 aa  163  5.9999999999999996e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2867  3-dehydroquinate dehydratase  51.06 
 
 		 151 aa  163  8e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0668  3-dehydroquinate dehydratase  59.26 
 
 		 156 aa  163  9e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1276  3-dehydroquinate dehydratase  52.48 
 
 		 158 aa  163  9e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000824277  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1610  3-dehydroquinate dehydratase  53.85 
 
 		 148 aa  163  1.0000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0468975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2566  3-dehydroquinate dehydratase  53.79 
 
 		 147 aa  162  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3467  3-dehydroquinate dehydratase  52.48 
 
 		 149 aa  161  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4214  3-dehydroquinate dehydratase  53.9 
 
 		 163 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1538  3-dehydroquinate dehydratase  54.68 
 
 		 145 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5387  3-dehydroquinate dehydratase  54.11 
 
 		 153 aa  161  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.878433  normal  0.435849 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2491  3-dehydroquinate dehydratase  53.15 
 
 		 147 aa  160  4.0000000000000004e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.254685  normal  0.906535 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1551  3-dehydroquinate dehydratase  52.21 
 
 		 150 aa  160  4.0000000000000004e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.961806  normal  0.25542 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0337  3-dehydroquinate dehydratase  53.68 
 
 		 146 aa  160  6e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1732  3-dehydroquinate dehydratase  54.68 
 
 		 145 aa  160  7e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676815  normal  0.0717581 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1707  3-dehydroquinate dehydratase  54.61 
 
 		 146 aa  160  7e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0599881  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1789  3-dehydroquinate dehydratase  53.96 
 
 		 145 aa  159  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3145  3-dehydroquinate dehydratase  56.12 
 
 		 146 aa  158  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.35351  normal  0.502836 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2715  3-dehydroquinate dehydratase  50.36 
 
 		 151 aa  157  6e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3500  3-dehydroquinate dehydratase  53.96 
 
 		 155 aa  157  7e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.651593 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2302  3-dehydroquinate dehydratase  53.19 
 
 		 177 aa  156  8e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.708414  hitchhiker  0.00337586 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7090  3-dehydroquinate dehydratase  52.41 
 
 		 147 aa  156  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3121  3-dehydroquinate dehydratase, type II  53.38 
 
 		 149 aa  155  1e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3022  3-dehydroquinate dehydratase  52.52 
 
 		 147 aa  155  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00285164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3376  3-dehydroquinate dehydratase  53.24 
 
 		 147 aa  154  4e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2433  3-dehydroquinate dehydratase  49.65 
 
 		 156 aa  154  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1595  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.43 
 
 		 144 aa  152  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0364  3-dehydroquinate dehydratase  54.41 
 
 		 159 aa  153  1e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0718569  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5704  3-dehydroquinate dehydratase  51.75 
 
 		 146 aa  151  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.858708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3174  3-dehydroquinate dehydratase  52.45 
 
 		 153 aa  151  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.715681 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3018  3-dehydroquinate dehydratase  48.23 
 
 		 151 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.572032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0570  3-dehydroquinate dehydratase  50.71 
 
 		 150 aa  151  2.9999999999999998e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1714  3-dehydroquinate dehydratase  56.15 
 
 		 145 aa  150  5e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.011115  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3392  3-dehydroquinate dehydratase  51.41 
 
 		 158 aa  150  5e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4097  3-dehydroquinate dehydratase, type II  46.62 
 
 		 165 aa  150  5.9999999999999996e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.517045  normal  0.0424658 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5032  3-dehydroquinate dehydratase  50.34 
 
 		 151 aa  150  5.9999999999999996e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1456  3-dehydroquinate dehydratase  47.79 
 
 		 145 aa  150  7e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.903143  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3692  3-dehydroquinate dehydratase  52.24 
 
 		 150 aa  150  7e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.526895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0088  3-dehydroquinate dehydratase  50.37 
 
 		 161 aa  150  8e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2275  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0370  3-dehydroquinate dehydratase  53.68 
 
 		 159 aa  149  8.999999999999999e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00140278  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1397  3-dehydroquinate dehydratase  53.19 
 
 		 154 aa  149  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000192408  normal  0.601404 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3940  3-dehydroquinate dehydratase  52.9 
 
 		 141 aa  149  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000739911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3063  3-dehydroquinate dehydratase  52.99 
 
 		 162 aa  149  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0246  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50.71 
 
 		 156 aa  149  1e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1164  3-dehydroquinate dehydratase  52.05 
 
 		 207 aa  149  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3916  3-dehydroquinate dehydratase  49.65 
 
 		 150 aa  149  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.491166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2834  3-dehydroquinate dehydratase  51.85 
 
 		 149 aa  147  3e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0506337  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4106  3-dehydroquinate dehydratase  48.91 
 
 		 151 aa  147  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3499  3-dehydroquinate dehydratase  51.37 
 
 		 207 aa  147  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1721  3-dehydroquinate dehydratase  46.38 
 
 		 145 aa  147  5e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2690  3-dehydroquinate dehydratase  50.37 
 
 		 150 aa  147  5e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000775969  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0421  3-dehydroquinate dehydratase  51.37 
 
 		 207 aa  147  5e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0981  3-dehydroquinate dehydratase  49.65 
 
 		 150 aa  147  5e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00261283  normal  0.0932644 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0294  3-dehydroquinate dehydratase  54.35 
 
 		 143 aa  147  5e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2299  3-dehydroquinate dehydratase  47.65 
 
 		 159 aa  147  6e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.926726  normal  0.99105 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2077  3-dehydroquinate dehydratase  48.91 
 
 		 150 aa  147  7e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.556948  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2664  3-dehydroquinate dehydratase  44.83 
 
 		 150 aa  146  7e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1094  3-dehydroquinate dehydratase  51.43 
 
 		 191 aa  146  8e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1223  3-dehydroquinate dehydratase  51.43 
 
 		 151 aa  146  8e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3464  3-dehydroquinate dehydratase  52.52 
 
 		 150 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>