249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1777 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_1777  phosphoserine phosphatase SerB  100 
 
 
298 aa  587  1e-166  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2835  phosphoserine phosphatase SerB  58.02 
 
 
332 aa  312  4.999999999999999e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.978803  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0465  phosphoserine phosphatase  53.26 
 
 
299 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.67766  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2462  phosphoserine phosphatase SerB  50 
 
 
296 aa  239  5e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.228127 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0008  phosphoserine phosphatase SerB  48.04 
 
 
291 aa  235  6e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00197314 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0018  phosphoserine phosphatase SerB  46.15 
 
 
291 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.395606  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3316  phosphoserine phosphatase  47.62 
 
 
292 aa  232  6e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.979977  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1350  phosphoserine phosphatase  45.45 
 
 
291 aa  228  9e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2777  phosphoserine phosphatase SerB  47.3 
 
 
298 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.64316  normal  0.211606 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2655  phosphoserine phosphatase SerB  46.8 
 
 
298 aa  225  8e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.607459 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3347  phosphoserine phosphatase SerB  52.85 
 
 
289 aa  224  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6089  phosphoserine phosphatase  47.33 
 
 
296 aa  224  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.562071  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2882  phosphoserine phosphatase SerB  46.8 
 
 
298 aa  224  2e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3347  phosphoserine phosphatase SerB  45.42 
 
 
297 aa  219  3e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0178674 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1744  phosphoserine phosphatase  53.54 
 
 
295 aa  218  8.999999999999998e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.121425  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0812  phosphoserine phosphatase SerB  46.21 
 
 
291 aa  218  1e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1756  phosphoserine phosphatase SerB  46.51 
 
 
309 aa  216  4e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3257  phosphoserine phosphatase SerB  45.12 
 
 
297 aa  215  7e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.230695 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2345  phosphoserine phosphatase SerB  45.27 
 
 
297 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.419363  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0252  phosphoserine phosphatase  46.21 
 
 
291 aa  213  1.9999999999999998e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3019  phosphoserine phosphatase  44.07 
 
 
291 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.426286 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2096  phosphoserine phosphatase SerB  54.84 
 
 
226 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.646648  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2538  phosphoserine phosphatase SerB  44.59 
 
 
296 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84987  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2797  phosphoserine phosphatase SerB  44.41 
 
 
296 aa  212  7e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.538623 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1348  phosphoserine phosphatase SerB  45.27 
 
 
299 aa  209  4e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.561677  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1660  phosphoserine phosphatase SerB  44.48 
 
 
299 aa  209  5e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.922143  normal  0.466601 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2809  phosphoserine phosphatase  44.07 
 
 
296 aa  207  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.117358  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6188  phosphoserine phosphatase SerB  46.46 
 
 
298 aa  207  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2240  phosphoserine phosphatase SerB  45.42 
 
 
297 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.110047  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1391  phosphoserine phosphatase  44.93 
 
 
299 aa  206  3e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.115011  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2012  phosphoserine phosphatase SerB  51.1 
 
 
295 aa  207  3e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6707  phosphoserine phosphatase SerB  45.79 
 
 
298 aa  206  4e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.572271  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2724  phosphoserine phosphatase SerB  49.37 
 
 
241 aa  202  5e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3139  phosphoserine phosphatase SerB  45.02 
 
 
325 aa  202  8e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.598874  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4531  phosphoserine phosphatase SerB  45.92 
 
 
297 aa  199  3e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.545382 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1800  phosphoserine phosphatase SerB  44.26 
 
 
299 aa  200  3e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695243  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0607  phosphoserine phosphatase  49.32 
 
 
292 aa  195  8.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122548  normal  0.443205 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1468  phosphoserine phosphatase SerB  51.6 
 
 
294 aa  192  6e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07410  Phosphoserine phosphatase  45.25 
 
 
404 aa  179  4.999999999999999e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.403165  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2184  phosphoserine phosphatase SerB  42.99 
 
 
435 aa  175  7e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0738013  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0136  phosphoserine phosphatase  45.45 
 
 
432 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.357065  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0500  Phosphoserine phosphatase  43.1 
 
 
407 aa  172  5.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4701  phosphoserine phosphatase SerB  43.54 
 
 
404 aa  172  9e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0225  phosphoserine phosphatase SerB  46.43 
 
 
406 aa  171  1e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65560  phosphoserine phosphatase  44.29 
 
 
429 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2283  3-phosphoserine phosphatase  43.06 
 
 
398 aa  170  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000752134  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4962  phosphoserine phosphatase SerB  43.54 
 
 
404 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.414119 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4957  ACT domain protein/phosphoserine phosphatase SerB  41.55 
 
 
418 aa  169  4e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5689  phosphoserine phosphatase SerB  43.81 
 
 
404 aa  169  4e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0506  phosphoserine phosphatase  41.55 
 
 
404 aa  169  5e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.138167  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0618  phosphoserine phosphatase  42.38 
 
 
429 aa  169  7e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4909  phosphoserine phosphatase SerB  43.54 
 
 
415 aa  168  8e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45946  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4785  phosphoserine phosphatase SerB  43.54 
 
 
404 aa  168  9e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2542  phosphoserine phosphatase  39.68 
 
 
411 aa  168  1e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0557  phosphoserine phosphatase SerB  41.74 
 
 
418 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4820  phosphoserine phosphatase SerB  44.5 
 
 
403 aa  167  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0409  phosphoserine phosphatase SerB  42.86 
 
 
438 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5336  phosphoserine phosphatase SerB  44.5 
 
 
419 aa  166  4e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.414905  normal  0.119609 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0264  phosphoserine phosphatase SerB  43.06 
 
 
404 aa  166  5e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3017  phosphoserine phosphatase SerB  43.81 
 
 
411 aa  165  8e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2041  phosphoserine phosphatase  42.11 
 
 
404 aa  165  8e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.143406  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2786  phosphoserine phosphatase SerB  39.18 
 
 
410 aa  165  1.0000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1478  phosphoserine phosphatase  47.59 
 
 
215 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1890  phosphoserine phosphatase  39.74 
 
 
302 aa  163  3e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1857  phosphoserine phosphatase  42.06 
 
 
400 aa  162  4.0000000000000004e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.982407 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1598  phosphoserine phosphatase SerB  44.29 
 
 
408 aa  162  5.0000000000000005e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0341  phosphoserine phosphatase SerB  41.9 
 
 
412 aa  162  6e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2504  phosphoserine phosphatase SerB  40.61 
 
 
278 aa  162  6e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000000707909  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2146  phosphoserine phosphatase SerB  42.13 
 
 
400 aa  162  7e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2310  phosphoserine phosphatase SerB  47.14 
 
 
429 aa  162  9e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1492  phosphoserine phosphatase SerB  45.89 
 
 
281 aa  161  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.806128  normal  0.053472 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2240  phosphoserine phosphatase SerB  44.66 
 
 
281 aa  161  1e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00113806  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0314  phosphoserine phosphatase SerB  40.48 
 
 
410 aa  160  2e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0906615 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1712  phosphoserine phosphatase SerB  40.09 
 
 
410 aa  159  4e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2803  phosphoserine phosphatase SerB  40 
 
 
398 aa  158  9e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.749544  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1948  phosphoserine phosphatase SerB  40.48 
 
 
406 aa  158  1e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.656763 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0826  phosphoserine phosphatase  41.95 
 
 
326 aa  157  2e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3493  phosphoserine phosphatase  41.95 
 
 
326 aa  157  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3622  phosphoserine phosphatase  41.95 
 
 
326 aa  157  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1803  phosphoserine phosphatase SerB  45.59 
 
 
281 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0615896  normal  0.554721 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6301  phosphoserine phosphatase SerB  45.59 
 
 
316 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463475  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1350  phosphoserine phosphatase SerB  44.76 
 
 
419 aa  157  3e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1778  phosphoserine phosphatase SerB  45.59 
 
 
316 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.685999  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2574  phosphoserine phosphatase  44.55 
 
 
420 aa  156  4e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.335719  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0653  phosphoserine phosphatase  39.91 
 
 
413 aa  154  2e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184974 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1874  phosphoserine phosphatase SerB  44.83 
 
 
297 aa  154  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.058047 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1107  phosphoserine phosphatase  40.1 
 
 
306 aa  153  2.9999999999999998e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2322  phosphoserine phosphatase  44.12 
 
 
454 aa  153  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1802  phosphoserine phosphatase  44.12 
 
 
281 aa  153  4e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0094  phosphoserine phosphatase  44.12 
 
 
281 aa  153  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.188283  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2157  phosphoserine phosphatase  44.12 
 
 
281 aa  153  4e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.752004  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2194  phosphoserine phosphatase  44.12 
 
 
281 aa  153  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1073  phosphoserine phosphatase  44.12 
 
 
281 aa  153  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0450  phosphoserine phosphatase  41.46 
 
 
325 aa  152  7e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0421726  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1313  phosphoserine phosphatase  44.12 
 
 
568 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1310  phosphoserine phosphatase SerB  41.4 
 
 
303 aa  151  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193327  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5077  phosphoserine phosphatase  44.12 
 
 
281 aa  152  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3361  phosphoserine phosphatase SerB  39.42 
 
 
326 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0476733 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1107  phosphoserine phosphatase  37.17 
 
 
330 aa  150  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00829453 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1690  phosphoserine phosphatase SerB  43.63 
 
 
281 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.656788  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>