More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0337 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0337  ABC transporter related  100 
 
 		 263 aa  523  1e-147  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0323374  normal  0.155837 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1673  ABC transporter related  78.28 
 
 		 264 aa  392  1e-108  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0193  ABC transporter related  75.63 
 
 		 267 aa  365  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.572314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0011  ABC transporter component  73.14 
 
 		 288 aa  360  2e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0416  ABC transporter related  70.68 
 
 		 317 aa  345  4e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0050  ABC transporter related  69.96 
 
 		 316 aa  342  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.161692  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0656  ABC transporter related  71.73 
 
 		 314 aa  341  9e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.30871 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0177  ABC transporter related  71.73 
 
 		 317 aa  340  2e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.32716  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0157  ABC transporter, ATP-binding protein  69.62 
 
 		 277 aa  339  2.9999999999999998e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1145  ABC transporter related  72.15 
 
 		 282 aa  338  7e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0734842  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0065  ABC transporter related  69.11 
 
 		 310 aa  338  7e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0169  ABC transporter related  65.25 
 
 		 279 aa  338  7e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0176  ABC transporter related  71.31 
 
 		 333 aa  337  8e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.102512  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0174  ABC transporter, ATPase subunit  70.89 
 
 		 332 aa  337  9.999999999999999e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.645822 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0152  ABC transporter, ATP-binding protein  69.2 
 
 		 254 aa  336  1.9999999999999998e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0336404  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0024  ABC transporter related  66.25 
 
 		 252 aa  336  1.9999999999999998e-91  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00950535  normal  0.420698 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0122  putative ABC transporter ATP-binding protein  71.31 
 
 		 336 aa  336  2.9999999999999997e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.069577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3668  ABC transporter related  69.42 
 
 		 261 aa  333  2e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2183  ABC transporter related  72.15 
 
 		 282 aa  332  3e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0392022  normal  0.686559 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2817  ABC transporter related  66.81 
 
 		 253 aa  332  3e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1156  ABC transporter, ATPase subunit  66.81 
 
 		 253 aa  332  3e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2428  ABC transporter related  71.31 
 
 		 289 aa  332  3e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.047746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0016  ABC transporter related  68.78 
 
 		 270 aa  332  4e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00016595 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2723  ABC transporter related  71.31 
 
 		 290 aa  332  4e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.569692  normal  0.148561 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2500  ABC transporter related  69.76 
 
 		 289 aa  332  4e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0376779  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2771  ABC transporter related  66.39 
 
 		 253 aa  331  8e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0106  ABC transporter related  66.95 
 
 		 253 aa  330  2e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.995719 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5470  ABC transporter related  68.77 
 
 		 283 aa  328  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.279643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0158  ABC transporter related  65.73 
 
 		 321 aa  326  2.0000000000000001e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.44909 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0225  ABC transporter related  63.87 
 
 		 249 aa  323  1e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0568  ABC transporter related  67.93 
 
 		 311 aa  322  3e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0405  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  66.67 
 
 		 268 aa  322  4e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3585  ATPase  61.72 
 
 		 254 aa  322  5e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2605  ABC transporter related  65.55 
 
 		 244 aa  319  3e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.675994 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4957  ABC transporter related  58.43 
 
 		 256 aa  318  6e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1368  ABC transporter, ATP-binding protein  63.64 
 
 		 264 aa  318  7.999999999999999e-86  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.569741  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0047  ABC transporter related  67.09 
 
 		 258 aa  317  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.132774 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0063  ABC transporter related  67.09 
 
 		 258 aa  317  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2906  ABC transporter related  64.34 
 
 		 258 aa  315  4e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.20972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0296  ABC transporter related  64.29 
 
 		 267 aa  314  9.999999999999999e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3000  ABC transporter related  64.85 
 
 		 271 aa  311  1e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.148105 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1911  ABC transporter related  65.04 
 
 		 255 aa  306  2.0000000000000002e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2108  ABC transporter, ATP-binding protein  61.34 
 
 		 241 aa  302  5.000000000000001e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03663  hypothetical protein  61.76 
 
 		 241 aa  301  5.000000000000001e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002404  lipopolysaccharide ABC transporter ATP-binding protein LptB  61.76 
 
 		 241 aa  300  1e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.052444  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1616  ABC transporter related  63.67 
 
 		 255 aa  299  3e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0465  ABC transporter related  59.77 
 
 		 264 aa  299  4e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.15337  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0264  ABC transporter related  61.98 
 
 		 262 aa  298  8e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0291  ABC transporter related  61.98 
 
 		 262 aa  298  8e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.342823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0304  ABC transporter-related protein  62.06 
 
 		 263 aa  297  9e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0409  ABC transporter ATP-binding protein  62.4 
 
 		 262 aa  297  1e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0648772 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4542  ABC transporter, ATP-binding protein  60.42 
 
 		 246 aa  297  1e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.979233  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4486  ABC transporter related  62.14 
 
 		 268 aa  294  1e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.152694 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0567  ABC transporter related  60.08 
 
 		 241 aa  294  1e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.714932  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0898  hypothetical protein  61.44 
 
 		 241 aa  293  2e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0867  hypothetical protein  61.44 
 
 		 241 aa  293  2e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0356  ABC transporter related  62.81 
 
 		 266 aa  292  4e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3709  ABC transporter related  60.91 
 
 		 265 aa  291  5e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.320955  normal  0.158224 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0251  ATPase  58.65 
 
 		 244 aa  292  5e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4150  ABC transporter related  61.6 
 
 		 244 aa  290  1e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4226  ABC transporter-related protein  60.32 
 
 		 268 aa  290  1e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.219808 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03192  ABC-type transport system ATPase component  57.56 
 
 		 241 aa  290  2e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0085  ABC transporter related  60.43 
 
 		 268 aa  290  2e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.329192  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12363  ABC transporter, ATP-binding protein  56.54 
 
 		 246 aa  288  4e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1421  hypothetical protein  59.07 
 
 		 243 aa  288  5.0000000000000004e-77  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.872796 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3684  ABC transporter related  60.34 
 
 		 244 aa  288  9e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1621  ABC transporter related  58.23 
 
 		 247 aa  287  1e-76  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.724922  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2546  ABC transporter related  58.65 
 
 		 244 aa  286  2e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.651086  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3376  ABC transporter related  58.82 
 
 		 243 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.681925  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0955  ABC transporter related  61.34 
 
 		 239 aa  285  5e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.236183 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4452  ABC transporter, ATP-binding protein  60.08 
 
 		 241 aa  285  5e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5034  ABC transporter ATP-binding protein  59.66 
 
 		 241 aa  285  5.999999999999999e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0268647  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57930  putative ATP-binding component of ABC transporter  59.66 
 
 		 241 aa  285  5.999999999999999e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12800  LPS transport protein LptB  59.24 
 
 		 241 aa  285  7e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4262  ABC transporter related  60.08 
 
 		 241 aa  285  7e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2850  ABC transporter related  59.11 
 
 		 258 aa  284  8e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606639  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0595  ABC transporter related protein  59.09 
 
 		 249 aa  284  9e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.63679  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0149  putative ATP-binding ABC transporter protein  60.57 
 
 		 251 aa  284  9e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2891  ABC transporter ATP-binding protein  58.82 
 
 		 241 aa  284  9e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.724805  normal  0.0929005 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4146  ABC transporter  59.66 
 
 		 241 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0487  ABC transporter, ATP-binding protein  58.7 
 
 		 258 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.635199  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17500  ABC transporter related  56.96 
 
 		 239 aa  284  1.0000000000000001e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0533908  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0418  ABC transporter-related protein  61.44 
 
 		 263 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.757416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4121  ABC transporter, ATPase subunit  58.7 
 
 		 261 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0327  ABC transporter related  57.31 
 
 		 260 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.945249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0499  ABC transport protein, ATP-binding component  58.58 
 
 		 241 aa  283  2.0000000000000002e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2117  ABC transporter related  56.54 
 
 		 244 aa  282  3.0000000000000004e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0673  ABC transporter related  60.25 
 
 		 262 aa  283  3.0000000000000004e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.125229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2708  ABC transporter related  57.59 
 
 		 258 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0148157 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0868  ABC transporter related  58.26 
 
 		 254 aa  282  3.0000000000000004e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0141  ABC transporter related  57.38 
 
 		 240 aa  282  4.0000000000000003e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.911941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2801  ABC transporter related  57.89 
 
 		 258 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.312589 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2790  ABC transporter related  57.89 
 
 		 258 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.015078  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0525  ABC transporter related  58.3 
 
 		 258 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0285  ABC transporter related  56.96 
 
 		 246 aa  281  5.000000000000001e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0766  ABC transporter system, ATP-binding protein  58.3 
 
 		 258 aa  281  5.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.857207  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2943  ABC transporter, ATP-binding protein  58.3 
 
 		 258 aa  281  5.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1515  ABC transporter, ATP-binding protein  58.3 
 
 		 258 aa  281  5.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0598  ABC transporter, ATP-binding protein  58.3 
 
 		 258 aa  281  5.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0075  ABC transporter, ATP-binding protein  58.3 
 
 		 258 aa  281  5.000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>