More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0104 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0104  SsrA-binding protein  100 
 
 		 162 aa  327  4e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.283448  normal  0.241767 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1907  SsrA-binding protein  74.84 
 
 		 159 aa  255  1e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.45258  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1864  SsrA-binding protein  54.19 
 
 		 160 aa  176  1e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4692  SsrA-binding protein  54.37 
 
 		 157 aa  176  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0948548 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3832  SsrA-binding protein  56.46 
 
 		 158 aa  171  2.9999999999999996e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1927  SsrA-binding protein  53.75 
 
 		 157 aa  170  6.999999999999999e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.289169 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2260  SsrA-binding protein  53.12 
 
 		 157 aa  170  7.999999999999999e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2604  SsrA-binding protein  52.5 
 
 		 157 aa  167  5e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0711734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2963  SsrA-binding protein  51.88 
 
 		 157 aa  167  7e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2631  SsrA-binding protein  51.88 
 
 		 157 aa  167  8e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0750238  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2642  SsrA-binding protein  53.74 
 
 		 157 aa  166  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.122546  hitchhiker  0.0029074 
 
 
-
 
NC_004310  BR0647  SsrA-binding protein  53.74 
 
 		 158 aa  165  2.9999999999999998e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.49338  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2863  SsrA-binding protein  54.73 
 
 		 165 aa  164  4e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.643018  normal  0.0844663 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2640  SsrA-binding protein  53.06 
 
 		 158 aa  164  4e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.506414  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0641  SsrA-binding protein  53.74 
 
 		 158 aa  162  1.0000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0942  SsrA-binding protein  52.26 
 
 		 155 aa  161  3e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0373189  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1730  SsrA-binding protein  51.02 
 
 		 161 aa  160  5.0000000000000005e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal  0.795485 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0990  SsrA-binding protein  51.28 
 
 		 159 aa  160  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.910775  normal  0.605905 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1485  SsrA-binding protein  59.86 
 
 		 157 aa  160  7e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1143  SsrA-binding protein  51.28 
 
 		 159 aa  159  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1444  SsrA-binding protein  51.02 
 
 		 160 aa  159  1e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0696  SsrA-binding protein  58.5 
 
 		 157 aa  159  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.311551 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0516  SsrA-binding protein  45 
 
 		 160 aa  154  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.760363 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1891  SsrA-binding protein  56.46 
 
 		 157 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340867  hitchhiker  0.000798962 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1434  SsrA-binding protein  51.39 
 
 		 158 aa  154  7e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373269  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1869  SsrA-binding protein  50.62 
 
 		 158 aa  152  1e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.155972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0674  SsrA-binding protein  55.78 
 
 		 159 aa  153  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.27244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3085  SsrA-binding protein  54.05 
 
 		 152 aa  152  2.9999999999999998e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0708876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3388  SsrA-binding protein  54.42 
 
 		 157 aa  151  4e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2482  SsrA-binding protein  49.66 
 
 		 158 aa  151  4e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.082086 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0465  SsrA-binding protein  46.5 
 
 		 158 aa  151  5e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.174489  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0847  SsrA-binding protein  48.45 
 
 		 158 aa  149  1e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.744704 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3192  SsrA-binding protein  53.74 
 
 		 157 aa  148  3e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393321  normal  0.919701 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3516  SsrA-binding protein  53.74 
 
 		 157 aa  148  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.830489  normal  0.0847481 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0031  SsrA-binding protein  45.51 
 
 		 158 aa  145  3e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.891709 
 
 
-
 
NC_002978  WD0767  SsrA-binding protein  45.52 
 
 		 149 aa  144  4.0000000000000006e-34  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0632  SsrA-binding protein  51.03 
 
 		 156 aa  144  5e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.160357  normal  0.270611 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0147  SsrA-binding protein  47.77 
 
 		 160 aa  143  8.000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.972615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0920  SsrA-binding protein  50.35 
 
 		 159 aa  142  3e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.624021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0947  SsrA-binding protein  48.34 
 
 		 161 aa  140  5e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0883  SsrA-binding protein  45.95 
 
 		 157 aa  140  7e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2543  SsrA-binding protein  45.95 
 
 		 157 aa  140  7e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.829865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0086  SsrA-binding protein  45.83 
 
 		 148 aa  140  9.999999999999999e-33  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0984  SsrA-binding protein  47.97 
 
 		 159 aa  140  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.458725  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0795  SsrA-binding protein  48.28 
 
 		 160 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.387755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1455  SmpB protein  47.97 
 
 		 155 aa  139  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.773196 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13117  SsrA-binding protein  48.65 
 
 		 160 aa  138  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3721  SsrA-binding protein  47.95 
 
 		 154 aa  137  4.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.516097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1582  SsrA-binding protein  48.68 
 
 		 156 aa  137  6e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0563704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1728  SsrA-binding protein  49.65 
 
 		 159 aa  137  7e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07720  SsrA-binding protein  47.55 
 
 		 160 aa  136  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0694  SsrA-binding protein  45.99 
 
 		 150 aa  136  1e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000543524  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0670  SsrA-binding protein  45.99 
 
 		 150 aa  136  1e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000585556  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1916  SsrA-binding protein  47.13 
 
 		 165 aa  136  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0329726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0801  SsrA-binding protein  47.33 
 
 		 159 aa  135  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4446  SsrA-binding protein  47.77 
 
 		 165 aa  136  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0811  SsrA-binding protein  47.22 
 
 		 147 aa  135  3.0000000000000003e-31  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4003  SsrA-binding protein  46.81 
 
 		 162 aa  134  5e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1351  SsrA-binding protein  46.53 
 
 		 153 aa  134  6.0000000000000005e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1584  SsrA-binding protein  48.25 
 
 		 168 aa  133  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.687182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0275  SsrA-binding protein  46.58 
 
 		 155 aa  133  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000343962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1613  SsrA-binding protein  48.25 
 
 		 168 aa  133  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1638  SsrA-binding protein  48.25 
 
 		 168 aa  133  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1409  SsrA-binding protein  43.67 
 
 		 158 aa  132  3e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0135  SsrA-binding protein  47.92 
 
 		 149 aa  131  5e-30  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.554782  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2476  SsrA-binding protein  45.96 
 
 		 160 aa  130  6e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.472283  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1236  SsrA-binding protein  46.1 
 
 		 158 aa  130  6.999999999999999e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.114649  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0707  SsrA-binding protein  43.79 
 
 		 157 aa  130  1.0000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1909  SsrA-binding protein  44.38 
 
 		 160 aa  129  1.0000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2325  SsrA-binding protein  45.64 
 
 		 155 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.595693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1869  SsrA-binding protein  44.72 
 
 		 159 aa  128  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0315571  normal  0.12343 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10450  SsrA-binding protein  44.16 
 
 		 167 aa  128  4.0000000000000003e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.668094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0244  SsrA-binding protein  43.8 
 
 		 147 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.750258  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3451  SsrA-binding protein  47.52 
 
 		 157 aa  127  6e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1443  SsrA-binding protein  44.38 
 
 		 158 aa  127  7.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000666048  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0962  SsrA-binding protein  44.81 
 
 		 157 aa  127  8.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1807  SsrA-binding protein  44.37 
 
 		 157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3020  SsrA-binding protein  47.55 
 
 		 159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.631512  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2748  SsrA-binding protein  42.57 
 
 		 154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000119247  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0815  SsrA-binding protein  44.68 
 
 		 157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0017945  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1464  SsrA-binding protein  43.24 
 
 		 154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0395  SsrA-binding protein  40.65 
 
 		 157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2984  SsrA-binding protein  42.25 
 
 		 161 aa  125  3e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000114855  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0123  SsrA-binding protein  46.26 
 
 		 157 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.357206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0256  SsrA-binding protein  44.83 
 
 		 153 aa  124  5e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00851918  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0281  SsrA-binding protein  44.9 
 
 		 157 aa  124  6e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000135529  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0655  SsrA-binding protein  45.7 
 
 		 158 aa  124  7e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00271498 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0529  SsrA-binding protein  42.65 
 
 		 157 aa  123  9e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.41549  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2045  SsrA-binding protein  44.9 
 
 		 155 aa  123  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.524843 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1508  SsrA-binding protein  42.34 
 
 		 149 aa  122  2e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1424  SsrA-binding protein  44.52 
 
 		 148 aa  122  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0442544  hitchhiker  0.00854817 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5231  SsrA-binding protein  41.61 
 
 		 155 aa  122  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2342  SsrA-binding protein  44.16 
 
 		 156 aa  122  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0903697 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4712  SsrA-binding protein  41.94 
 
 		 156 aa  122  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000106723  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3476  SsrA-binding protein  42.07 
 
 		 150 aa  122  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0920584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5277  SsrA-binding protein  41.61 
 
 		 155 aa  122  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000417052  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0002  SsrA-binding protein  41.78 
 
 		 155 aa  121  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.185549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1646  SsrA-binding protein  41.89 
 
 		 172 aa  121  4e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.281559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4582  SsrA-binding protein  42.59 
 
 		 160 aa  121  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.307442 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2055  SsrA-binding protein  42.77 
 
 		 159 aa  121  4e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>