More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1474 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_1474  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
703 aa  1355  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00326365  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1396  sodium/hydrogen exchanger  51.99 
 
 
689 aa  516  1e-145  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0052164  normal  0.118619 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5898  Kef-type K+ transport systems membrane components-like protein  50.57 
 
 
683 aa  405  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103243  normal  0.0297868 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2552  sodium/hydrogen exchanger  46.08 
 
 
747 aa  343  7e-93  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.803467  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4342  sodium/hydrogen exchanger  50.96 
 
 
416 aa  337  4e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.322852  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3878  sodium/hydrogen exchanger  44.36 
 
 
715 aa  333  7e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.267583  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3828  sodium/hydrogen exchanger  44.36 
 
 
715 aa  332  1e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3562  sodium/hydrogen exchanger  49.34 
 
 
429 aa  331  2e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0546  Na+/H+ antiporter  38.63 
 
 
715 aa  328  2e-88  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0578  sodium/hydrogen exchanger  41.89 
 
 
756 aa  328  2e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1632  Sodium/hydrogen exchanger  44.87 
 
 
723 aa  318  2e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.531828 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3520  Na+/H+-exchanging protein (Na+/H+ antiporter)  45.16 
 
 
764 aa  303  6e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1335  sodium/hydrogen exchanger  44.62 
 
 
482 aa  300  8e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3445  sodium/hydrogen exchanger  45.48 
 
 
427 aa  296  8e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00243488 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1107  sodium/hydrogen exchanger  44.14 
 
 
775 aa  279  1e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.112633  normal  0.12903 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0736  sodium/hydrogen exchanger  40.67 
 
 
495 aa  276  1e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.67035  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1792  sodium/hydrogen antiporter  39.25 
 
 
767 aa  259  1e-67  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1281  sodium/hydrogen exchanger  41.49 
 
 
460 aa  258  3e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.345739  normal  0.428465 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3561  sodium/hydrogen exchanger  40.54 
 
 
420 aa  251  3e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.41273  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01670  potassium:hydrogen antiporter, putative  37.59 
 
 
951 aa  247  6e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0791  Na+/H+ antiporter, putative  37.99 
 
 
448 aa  247  6e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0935  sodium/hydrogen exchanger  37.99 
 
 
448 aa  247  6e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3175  sodium/hydrogen exchanger  46.54 
 
 
416 aa  247  6e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3558  sodium/hydrogen exchanger  37.66 
 
 
455 aa  244  5e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.790544  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1098  sodium/hydrogen exchanger  38.72 
 
 
419 aa  236  1e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.000276702  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04834  transporter, monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family  38.27 
 
 
421 aa  234  6e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2302  sodium/hydrogen exchanger  38.08 
 
 
423 aa  233  1e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.113166  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43795  K(+)/H(+) antiporter  36.45 
 
 
816 aa  230  5e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  4.515e-05  normal  0.344688 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4109  sodium/hydrogen exchanger  40.5 
 
 
425 aa  225  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.478962 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01290  potassium ion/proton antiporter (Eurofung)  35.61 
 
 
883 aa  216  1e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.721044  normal  0.960342 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0928  sodium/hydrogen exchanger family protein  38.2 
 
 
430 aa  216  1e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.501208  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2714  sodium/hydrogen exchanger  40.21 
 
 
439 aa  215  3e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4036  sodium/hydrogen exchanger  39.43 
 
 
422 aa  213  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554914  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5813  sodium/hydrogen exchanger  36.14 
 
 
414 aa  186  2e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2757  sodium/hydrogen exchanger family protein  36.76 
 
 
442 aa  186  2e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.224799  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6043  sodium/hydrogen exchanger  36.63 
 
 
414 aa  185  2e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2193  sodium/hydrogen exchanger  34.11 
 
 
460 aa  184  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1229  sodium/hydrogen exchanger  33.82 
 
 
410 aa  184  6e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.440766  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4159  sodium/hydrogen exchanger  34.38 
 
 
446 aa  180  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.286241 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2667  sodium/hydrogen exchanger  36.83 
 
 
435 aa  177  6e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1572  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  33.5 
 
 
410 aa  177  7e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0143  sodium/hydrogen exchanger  33.59 
 
 
410 aa  175  2e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.144087  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1654  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  33.33 
 
 
410 aa  173  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.148564  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3462  sodium/hydrogen exchanger  30.72 
 
 
750 aa  172  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0330875 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3112  sodium/hydrogen exchanger  32.36 
 
 
748 aa  172  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2825  sodium/hydrogen exchanger  33.5 
 
 
749 aa  171  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0995  sodium/hydrogen exchanger  35.75 
 
 
452 aa  166  2e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4038  sodium/hydrogen exchanger  32.26 
 
 
406 aa  165  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3484  sodium/hydrogen exchanger  32.18 
 
 
406 aa  165  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.861174  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6352  sodium/hydrogen exchanger  31.18 
 
 
436 aa  164  8e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105497 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2132  sodium/hydrogen exchanger  39.75 
 
 
425 aa  161  4e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3440  sodium/hydrogen exchanger  32.37 
 
 
573 aa  160  8e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1332  potassium efflux system protein  28.25 
 
 
385 aa  154  7e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2332  sodium/hydrogen exchanger  33.25 
 
 
444 aa  151  4e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2633  Na(+)/H(+) antiporter  30.34 
 
 
414 aa  149  2e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1675  germination protein gerN  26.62 
 
 
387 aa  147  5e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  3.02392e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1526  potassium efflux system protein  26.87 
 
 
387 aa  147  6e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.848534  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3669  germination protein gerN  26.86 
 
 
387 aa  146  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  4.27463e-08  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1493  Na+/H+ exchanger family protein  26.62 
 
 
387 aa  145  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.35632e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1780  germination protein gerN  26.87 
 
 
387 aa  145  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00295662  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1483  Na+/H+ exchanger family protein  26.87 
 
 
387 aa  145  3e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  4.97564e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1729  germination protein gerN  26.62 
 
 
387 aa  144  5e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1521  germination protein gerN  26.91 
 
 
387 aa  144  6e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  6.01236e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1706  germination protein gerN  26.62 
 
 
387 aa  144  6e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1639  germination protein gern  26.91 
 
 
387 aa  144  6e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481694  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1476  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  33.78 
 
 
547 aa  143  1e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0269203  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0450  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  34.22 
 
 
625 aa  143  1e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.26198  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2617  sodium/hydrogen exchanger  34.22 
 
 
592 aa  142  2e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.129932  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1391  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  33.78 
 
 
547 aa  142  2e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1782  sodium/hydrogen exchanger  30.35 
 
 
389 aa  141  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0667  potassium efflux system protein  27.92 
 
 
375 aa  141  4e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2104  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  29.87 
 
 
444 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.134319  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2049  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  29.87 
 
 
444 aa  139  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2241  sodium/hydrogen exchanger  29.87 
 
 
444 aa  139  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.310432  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0729  potassium efflux system protein  27.78 
 
 
375 aa  139  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4462  germination protein gerN  27.53 
 
 
375 aa  139  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.765663 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1004  sodium/hydrogen exchanger  29.87 
 
 
444 aa  139  3e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0864919  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2444  sodium/hydrogen exchanger  26.67 
 
 
396 aa  139  3e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00360852  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0873  germination protein gerN  27.78 
 
 
375 aa  138  4e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0913  sodium/hydrogen exchanger  32.04 
 
 
413 aa  138  4e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.714733 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0173  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  34.22 
 
 
410 aa  137  9e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.661692  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1126  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  34.22 
 
 
410 aa  137  9e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.251778  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1208  sodium/hydrogen exchanger  34.22 
 
 
410 aa  137  9e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0581239  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0915  germination protein gerN  27.53 
 
 
375 aa  135  2e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42795e-41 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0780  germination protein gerN  27.53 
 
 
375 aa  135  2e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0819  germination protein gern  27.53 
 
 
375 aa  135  2e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0729  Na+/H+ antiporter (NapA)  27.53 
 
 
375 aa  135  2e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0722  sodium/hydrogen exchanger family protein  29.02 
 
 
427 aa  134  4e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.313467  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_628  Kef-type K+ transport systems membrane component  29.42 
 
 
424 aa  133  1e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0655  sodium/hydrogen exchanger  29.73 
 
 
424 aa  133  1e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3439  sodium/hydrogen exchanger  26.88 
 
 
445 aa  131  6e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1320  sodium/hydrogen exchanger  28.78 
 
 
382 aa  130  8e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0910  germination protein gerN  27.78 
 
 
375 aa  130  9e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0984  germination protein gerN  27.78 
 
 
375 aa  130  9e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0715  Na+/H+ antiporter (NapA)  27.53 
 
 
375 aa  127  5e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1412  sodium/hydrogen exchanger  27.02 
 
 
424 aa  125  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2265  sodium/hydrogen exchanger  30.07 
 
 
400 aa  122  2e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000115576 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1937  sodium/hydrogen exchanger  29.43 
 
 
412 aa  119  1e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3203  sodium/hydrogen exchanger  28.04 
 
 
404 aa  119  2e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3950  sodium/hydrogen exchanger  28.64 
 
 
414 aa  117  6e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.387419 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>