63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1126 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1126  Protein of unknown function DUF2029  100 
 
 		 425 aa  835    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5433  hypothetical protein  36.77 
 
 		 420 aa  200  5e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.393195 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2502  Protein of unknown function DUF2029  36 
 
 		 414 aa  180  4.999999999999999e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.567821  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3543  putative integral membrane protein  34.82 
 
 		 428 aa  159  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2968  putative integral membrane protein  34.78 
 
 		 430 aa  158  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3276  putative integral membrane protein  32.73 
 
 		 418 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3338  putative integral membrane protein  32.73 
 
 		 418 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.153127 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2282  Protein of unknown function DUF2029  32.4 
 
 		 469 aa  156  5.0000000000000005e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.291881  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12209  integral membrane protein  31 
 
 		 427 aa  151  2e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4020  Protein of unknown function DUF2029  34.1 
 
 		 426 aa  151  3e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.643753  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3224  hypothetical protein  36.2 
 
 		 378 aa  150  4e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3287  putative integral membrane protein  32.47 
 
 		 418 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.505534  normal  0.641522 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21610  Protein of unknown function (DUF2029)  35.6 
 
 		 421 aa  147  4.0000000000000006e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0338543  normal  0.0110628 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5506  hypothetical protein  34.18 
 
 		 395 aa  145  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.344164  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3057  hypothetical protein  31.47 
 
 		 494 aa  141  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0743  mannosyltransferase  34.17 
 
 		 398 aa  139  7.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.186012  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4322  mannosyltransferase  36.14 
 
 		 417 aa  139  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06020  Protein of unknown function (DUF2029)  33.07 
 
 		 444 aa  138  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.179625 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0243  putative integral membrane protein  33.71 
 
 		 417 aa  133  6e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155978 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21600  Protein of unknown function (DUF2029)  30.53 
 
 		 467 aa  131  3e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0988113  hitchhiker  0.00696231 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3057  Protein of unknown function DUF2029  35.57 
 
 		 455 aa  131  3e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0888832  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2198  hypothetical protein  34.04 
 
 		 408 aa  130  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11183  mannosyltransferase  33.54 
 
 		 431 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000655823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6115  hypothetical protein  31.85 
 
 		 479 aa  126  8.000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.112096  normal  0.027736 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4234  sugar transporter superfamily protein  31.49 
 
 		 402 aa  125  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.350034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0467  mannosyltransferase  32.73 
 
 		 428 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0478  mannosyltransferase  32.73 
 
 		 428 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0454  mannosyltransferase  32.73 
 
 		 428 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3039  Protein of unknown function DUF2029  35.62 
 
 		 570 aa  120  3e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2153  mannosyltransferase  32.14 
 
 		 369 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0955915  normal  0.0100871 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4545  hypothetical protein  30.15 
 
 		 477 aa  119  7e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.186558 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0139  hypothetical protein  33.62 
 
 		 437 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0479  mannosyltransferase  35.19 
 
 		 422 aa  117  5e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0468  mannosyltransferase  35.19 
 
 		 422 aa  117  5e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0455  mannosyltransferase  35.19 
 
 		 422 aa  117  5e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5329  hypothetical protein  30.38 
 
 		 478 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0425  hypothetical protein  32.33 
 
 		 417 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0435  hypothetical protein  32.33 
 
 		 417 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.199454  normal  0.0441383 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4274  mannosyltransferase  32.26 
 
 		 443 aa  113  5e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4045  mannosyltransferase  32.26 
 
 		 443 aa  113  5e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265907  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4120  mannosyltransferase  32.26 
 
 		 443 aa  113  5e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.703888 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1385  hypothetical protein  30.11 
 
 		 412 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.488241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0993  hypothetical protein  36.03 
 
 		 411 aa  110  5e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3060  hypothetical protein  30.95 
 
 		 434 aa  107  5e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.647331  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1016  hypothetical protein  35.44 
 
 		 419 aa  105  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1343  hypothetical protein  31.48 
 
 		 410 aa  105  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000546373 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5055  hypothetical protein  29.69 
 
 		 477 aa  102  9e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.020472 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2916  hypothetical protein  35.47 
 
 		 470 aa  101  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.189824  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3685  hypothetical protein  31.34 
 
 		 420 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4550  mannosyltransferase  30.1 
 
 		 406 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637141  normal  0.185586 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0453  mannosyltransferase  25.2 
 
 		 438 aa  98.2  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.355546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0477  mannosyltransferase  25.2 
 
 		 438 aa  98.2  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0466  mannosyltransferase  25.2 
 
 		 438 aa  98.2  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1125  hypothetical protein  30.75 
 
 		 408 aa  95.5  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.51418  normal  0.62159 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0070  hypothetical protein  30.62 
 
 		 455 aa  95.5  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4089  hypothetical protein  29.23 
 
 		 408 aa  91.3  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0942983  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2285  Protein of unknown function DUF2029  31.31 
 
 		 463 aa  85.1  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.467092  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0119  hypothetical protein  34.02 
 
 		 429 aa  81.6  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3880  putative conserved membrane protein  29.24 
 
 		 375 aa  65.9  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00561968 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3867  hypothetical protein  26.88 
 
 		 734 aa  65.5  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0838155  normal  0.221167 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2230  hypothetical protein  29.13 
 
 		 430 aa  55.8  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.615453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2630  hypothetical protein  27.6 
 
 		 454 aa  54.7  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.31513  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0205  hypothetical protein  27.3 
 
 		 734 aa  54.3  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.746079  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>