223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0482 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0482  amidohydrolase  100 
 
 		 426 aa  877    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21530  amidohydrolase, imidazolonepropionase  53.58 
 
 		 447 aa  449  1e-125  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0696  amidohydrolase  44.71 
 
 		 444 aa  360  2e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1266  amidohydrolase  44.5 
 
 		 447 aa  359  7e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1727  amidohydrolase  47.87 
 
 		 486 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2450  amidohydrolase  45.24 
 
 		 478 aa  356  5e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0983  amidohydrolase  44.63 
 
 		 445 aa  342  5.999999999999999e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3588  amidohydrolase  46.84 
 
 		 482 aa  340  4e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0761  hypothetical protein  44.71 
 
 		 461 aa  338  9e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3632  amidohydrolase  43.81 
 
 		 447 aa  326  6e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5232  amidohydrolase  44.42 
 
 		 434 aa  323  3e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2074  Xaa-Pro dipeptidase  41.92 
 
 		 433 aa  317  2e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.63699  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1661  hypothetical protein  42.22 
 
 		 436 aa  311  1e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2295  putative amidohydrolase  36.68 
 
 		 490 aa  306  7e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1663  hypothetical protein  40.57 
 
 		 429 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2289  amidohydrolase  40.94 
 
 		 456 aa  276  6e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06184  prolidase  40.14 
 
 		 420 aa  274  2.0000000000000002e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3872  amidohydrolase  40.19 
 
 		 419 aa  269  7e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0060  amidohydrolase  36.78 
 
 		 440 aa  252  8.000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0268  putative Xaa-Pro dipeptidase  35.4 
 
 		 451 aa  248  1e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2801  prolidase, putative  37.5 
 
 		 419 aa  240  4e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00617614  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2529  amidohydrolase  37.33 
 
 		 419 aa  234  3e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.403539  normal  0.929586 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3782  amidohydrolase  38.74 
 
 		 413 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0062486  decreased coverage  0.00131434 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3741  amidohydrolase  38.93 
 
 		 413 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2089  amidohydrolase  36.56 
 
 		 416 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1420  putative prolidase  35.8 
 
 		 411 aa  219  6e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0151921  normal  0.142512 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0436  amidohydrolase  36.34 
 
 		 417 aa  218  1e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4994  amidohydrolase  37.47 
 
 		 413 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.939807 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1549  amidohydrolase  36.08 
 
 		 413 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2354  amidohydrolase  37.23 
 
 		 420 aa  213  7e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2221  hypothetical protein  33.41 
 
 		 412 aa  209  8e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2193  hypothetical protein  33.49 
 
 		 412 aa  209  8e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3014  amidohydrolase  33.41 
 
 		 459 aa  209  1e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1037  amidohydrolase  34.59 
 
 		 405 aa  209  1e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1130  amidohydrolase  34.28 
 
 		 425 aa  206  4e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.474819 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0545  amidohydrolase  34.32 
 
 		 415 aa  206  5e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.472075 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4676  amidohydrolase  34.58 
 
 		 414 aa  205  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0192807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3965  amidohydrolase  34.28 
 
 		 411 aa  203  5e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2362  amidohydrolase  33.56 
 
 		 413 aa  202  7e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3028  putative prolidase (Xaa-Pro dipeptidase)  35.15 
 
 		 436 aa  202  8e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0496396  normal  0.0296694 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3838  amidohydrolase  34.44 
 
 		 411 aa  200  3e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0890  amidohydrolase  36.27 
 
 		 412 aa  201  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.559583  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1717  amidohydrolase  36.96 
 
 		 407 aa  196  5.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01184  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 		 445 aa  196  6e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4503  amidohydrolase  33.1 
 
 		 408 aa  196  7e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3650  amidohydrolase  33.18 
 
 		 428 aa  194  2e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4081  amidohydrolase  36.03 
 
 		 425 aa  194  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3137  amidohydrolase  32.24 
 
 		 411 aa  192  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4622  amidohydrolase  38.71 
 
 		 405 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00030  conserved hypothetical protein  33.94 
 
 		 443 aa  189  1e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.215737 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4208  amidohydrolase  33.74 
 
 		 391 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.309856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2826  amidohydrolase  35.11 
 
 		 461 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00342984  normal  0.0235152 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4194  amidohydrolase  33.72 
 
 		 406 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268221  normal  0.0453774 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3412  amidohydrolase  32.79 
 
 		 409 aa  178  2e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2756  amidohydrolase  34.05 
 
 		 403 aa  173  3.9999999999999995e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0215724  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0420  amidohydrolase  32.08 
 
 		 418 aa  172  7.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5218  amidohydrolase  34.54 
 
 		 393 aa  169  7e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.392557  normal  0.244754 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  30.09 
 
 		 426 aa  158  2e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4304  amidohydrolase  30.89 
 
 		 470 aa  157  4e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  31.7 
 
 		 445 aa  156  8e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1967  amidohydrolase  30.17 
 
 		 405 aa  155  1e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  29.21 
 
 		 430 aa  151  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2368  amidohydrolase  30.32 
 
 		 441 aa  151  3e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  30.25 
 
 		 426 aa  150  4e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  29.4 
 
 		 431 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2093  amidohydrolase  31.66 
 
 		 431 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.885062  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  29.61 
 
 		 440 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  30.89 
 
 		 455 aa  146  8.000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.202717 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  28.37 
 
 		 407 aa  142  9.999999999999999e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  32.49 
 
 		 433 aa  140  6e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2823  amidohydrolase  28.37 
 
 		 422 aa  139  8.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.750141  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1893  amidohydrolase  30.05 
 
 		 409 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.342109 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  29.71 
 
 		 426 aa  138  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  29.22 
 
 		 433 aa  138  2e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1913  amidohydrolase  30.05 
 
 		 409 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.406706  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1959  amidohydrolase  30.05 
 
 		 409 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2139  amidohydrolase  31.27 
 
 		 408 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.018924 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  31.05 
 
 		 430 aa  137  3.0000000000000003e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4292  amidohydrolase  31.6 
 
 		 402 aa  137  4e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  29.43 
 
 		 444 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  29.84 
 
 		 423 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  30.07 
 
 		 412 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  29.04 
 
 		 444 aa  134  5e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2711  amidohydrolase  28.34 
 
 		 400 aa  133  6e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  30.53 
 
 		 433 aa  132  1.0000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  28.5 
 
 		 438 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  28.41 
 
 		 459 aa  130  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0159  amidohydrolase  30.65 
 
 		 415 aa  130  4.0000000000000003e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3749  amidohydrolase  30.41 
 
 		 408 aa  130  6e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3822  amidohydrolase  30.41 
 
 		 408 aa  130  6e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3761  amidohydrolase  30.41 
 
 		 408 aa  130  6e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225154  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2437  amidohydrolase  30.41 
 
 		 411 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3973  amidohydrolase  28.07 
 
 		 409 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  28.54 
 
 		 413 aa  129  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2115  amidohydrolase  28.67 
 
 		 426 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3715  amidohydrolase  29.98 
 
 		 417 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355417  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  29.11 
 
 		 437 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3788  amidohydrolase  29.98 
 
 		 417 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.463322  normal  0.142834 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3728  amidohydrolase  29.98 
 
 		 417 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  28.67 
 
 		 407 aa  127  4.0000000000000003e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>