More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1479 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1479  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 
196 aa  411  1e-114  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0663  electron transport protein SCO1/SenC  64.29 
 
 
197 aa  276  2e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000146035  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2583  electron transport protein SCO1/SenC  37.79 
 
 
190 aa  90.9  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1650  electron transport protein SCO1/SenC  33.72 
 
 
194 aa  87  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000270735  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1588  electron transport protein SCO1/SenC  35.26 
 
 
188 aa  86.7  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000473469  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0048  electron transport protein SCO1/SenC  35.29 
 
 
208 aa  85.9  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2737  electron transport protein SCO1/SenC  31.93 
 
 
193 aa  85.9  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.032026  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3093  SCO1/SenC family lipoprotein  32.95 
 
 
195 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000903349  decreased coverage  9.893850000000001e-24 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2278  lipoprotein  32.95 
 
 
195 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000821147  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2031  cytochrome c oxidase Cu(A) center assembly protein  32.95 
 
 
195 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0152904  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2231  SCO1/SenC family lipoprotein  32.95 
 
 
195 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00820303  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2359  SCO1/SenC family lipoprotein  32.95 
 
 
195 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369081  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2072  electron transport protein SCO1/SenC  31.49 
 
 
195 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0311949  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2274  SCO1/SenC family lipoprotein  32.37 
 
 
195 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.19701e-47 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2093  lipoprotein  32.37 
 
 
195 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0265968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2033  cytochrome c oxidase Cu(A) center assembly protein  32.37 
 
 
195 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000016443  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2249  lipoprotein  32.37 
 
 
195 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00171522  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  33.56 
 
 
206 aa  79  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1172  electron transport protein SCO1/SenC  32.52 
 
 
283 aa  77.8  0.00000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1034  electron transport protein SCO1/SenC  35.29 
 
 
217 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.240451  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1038  electron transport protein SCO1/SenC  35.29 
 
 
217 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.303988 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  33.1 
 
 
198 aa  75.1  0.0000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1433  SCO1/SenC family protein  30.41 
 
 
205 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0500  SCO1/SenC family protein  30.41 
 
 
205 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2860  SCO1/SenC family protein  30.41 
 
 
205 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0518  SCO1/SenC family protein  30.41 
 
 
205 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.83409  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0159  SCO1/SenC family protein  30.41 
 
 
205 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.477348  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2149  electron transport protein SCO1/SenC  35.25 
 
 
275 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1998  electron transport protein SCO1/SenC  32.14 
 
 
221 aa  74.3  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3187  SCO1/SenC family protein  33.57 
 
 
181 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0683  SCO1/SenC family protein  33.57 
 
 
181 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.744521  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4268  electron transport protein SCO1/SenC  35.29 
 
 
226 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0517  electron transport protein SCO1/SenC  28.77 
 
 
228 aa  72.8  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.576409  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2882  electron transport protein SCO1/SenC  37.7 
 
 
204 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.288207 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1132  electron transport protein SCO1/SenC  34.45 
 
 
211 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1156  electron transport protein SCO1/SenC  34.45 
 
 
211 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0857  electron transport protein SCO1/SenC  37.5 
 
 
208 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2982  electron transport protein SCO1/SenC  31.91 
 
 
197 aa  72.4  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0335697  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0677  electron transport protein SCO1/SenC  34.45 
 
 
211 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.606062  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0111  electron transport protein SCO1/SenC  32.14 
 
 
210 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00321796  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0436  SCO1/SenC family protein  33.57 
 
 
181 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1240  electron transport protein SCO1/SenC  32.43 
 
 
219 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.637304 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0126  electron transport protein SCO1/SenC  34.51 
 
 
210 aa  71.6  0.000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12558  normal  0.034967 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0131  electron transport protein SCO1/SenC  31.43 
 
 
210 aa  71.6  0.000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801805  normal  0.912872 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0128  electron transport protein SCO1/SenC  32.14 
 
 
210 aa  71.2  0.000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2912  electron transport protein SCO1/SenC  31.21 
 
 
197 aa  71.2  0.000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4381  electron transport protein SCO1/SenC  30.5 
 
 
209 aa  71.2  0.000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2893  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 
205 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.945666  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6166  electron transport protein SCO1/SenC  32.64 
 
 
205 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.527334  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1255  electron transport protein SCO1/SenC  32.37 
 
 
209 aa  70.1  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1683  electron transport protein SCO1/SenC  29.94 
 
 
204 aa  69.7  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1635  electron transport protein SCO1/SenC  32.45 
 
 
194 aa  69.3  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.132888  normal  0.682458 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2836  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 
205 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2426  electron transport protein SCO1/SenC  29.24 
 
 
221 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3829  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 
211 aa  69.7  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.707437 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2223  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 
205 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2847  electron transport protein SCO1/SenC  32.68 
 
 
191 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287465  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2665  electron transport protein SCO1/SenC  30.66 
 
 
204 aa  68.9  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000706149  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1063  electron transport protein SCO1/SenC  31.88 
 
 
198 aa  68.9  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0524387 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3898  electron transport protein SCO1/SenC  29.11 
 
 
207 aa  68.6  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.88916  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2753  electron transport protein SCO1/SenC  32.68 
 
 
205 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453026  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1482  electron transport protein SCO1/SenC  29.94 
 
 
193 aa  68.2  0.00000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1521  electron transport protein SCO1/SenC  26.72 
 
 
202 aa  67.8  0.00000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0135  electron transport protein SCO1/SenC  30 
 
 
197 aa  67.8  0.00000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5990  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 
240 aa  67.8  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2933  electron transport protein SCO1/SenC  27.15 
 
 
195 aa  67.8  0.00000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.768061 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  30.72 
 
 
219 aa  67.4  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0271  electron transport protein SCO1/SenC  30.99 
 
 
204 aa  67.4  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.777659 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  26.78 
 
 
210 aa  67.8  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1472  electron transport protein SCO1/SenC  32.33 
 
 
192 aa  67  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0144  electron transport protein SCO1/SenC  27.78 
 
 
197 aa  66.6  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.962644  normal  0.838775 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0070  hypothetical protein  28.03 
 
 
198 aa  66.6  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3360  electron transport protein SCO1/SenC  30.77 
 
 
210 aa  67  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0248  electron transport protein SCO1/SenC  31.79 
 
 
203 aa  66.2  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0520152 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0869  electron transport protein SCO1/SenC  30.25 
 
 
229 aa  66.2  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.179143  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3662  electron transport protein SCO1/SenC  33.12 
 
 
209 aa  66.2  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.392982  normal  0.146749 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1599  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC-like protein  31.03 
 
 
276 aa  65.9  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.613564  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2077  electron transport protein SCO1/SenC  30.08 
 
 
296 aa  65.9  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0831544  normal  0.489667 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0229  electron transport protein SCO1/SenC  31.79 
 
 
203 aa  65.5  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2416  electron transport protein SCO1/SenC  28.14 
 
 
199 aa  65.5  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.516349  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  31.08 
 
 
203 aa  65.5  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0467  electron transport protein SCO1/SenC  32.03 
 
 
205 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2758  SCO1/SenC family protein  31.97 
 
 
219 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2817  SCO1/SenC family protein  31.97 
 
 
219 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.172118  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0287  electron transport protein SCO1/SenC  31.61 
 
 
205 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1768  SCO1/SenC family protein  31.97 
 
 
232 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2836  SCO1/SenC family protein  31.97 
 
 
232 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.683043  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0564  SCO1/SenC family protein  31.97 
 
 
232 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2445  SCO1/SenC family protein  31.97 
 
 
232 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  28.14 
 
 
203 aa  64.7  0.0000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  28.14 
 
 
187 aa  64.7  0.0000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0879  SCO1/SenC family protein  31.3 
 
 
209 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2969  electron transport protein SCO1/SenC  37.5 
 
 
241 aa  64.7  0.0000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000412315 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3891  electron transport protein SCO1/SenC  35.56 
 
 
222 aa  64.3  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2458  electron transport protein SCO1/SenC  39.73 
 
 
218 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.657864  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0070  electron transport protein SCO1/SenC  32.33 
 
 
211 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_007614  Nmul_A0192  electron transport protein SCO1/SenC  32.06 
 
 
205 aa  63.9  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007794  Saro_2853  electron transport protein SCO1/SenC  34.72 
 
 
204 aa  63.9  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.500235  n/a   
 
 
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NC_010172  Mext_3935  electron transport protein SCO1/SenC  32.62 
 
 
206 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.7944  normal  0.089928 
 
 
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NC_010524  Lcho_1995  electron transport protein SCO1/SenC  29.41 
 
 
197 aa  64.3  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000392946 
 
 
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