109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1367 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1367  B3/4 domain protein  100 
 
 
221 aa  454  1e-127  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0502  B3/4 domain protein  71.69 
 
 
220 aa  343  1e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0789  hypothetical protein  29.07 
 
 
238 aa  91.3  1e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.995984 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5725  B3/4 domain protein  39.78 
 
 
234 aa  90.1  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf669  hypothetical protein  28.83 
 
 
232 aa  84.7  0.000000000000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5429  phosphoenolpyruvate synthase  31.11 
 
 
230 aa  84  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3065  hypothetical protein  27.39 
 
 
241 aa  77.8  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.570745  normal  0.843466 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0504  B3/4  27.65 
 
 
213 aa  77.4  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.333323  normal  0.47226 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2948  B3/4 domain protein  26.03 
 
 
230 aa  74.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222758  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1717  B3/4 domain protein  25.97 
 
 
224 aa  73.9  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2690  B3/4 domain protein  25.69 
 
 
230 aa  73.9  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.366854  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3672  B3/4 domain protein  23.65 
 
 
249 aa  72  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2205  B3/4 domain protein  26.53 
 
 
221 aa  71.6  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5108  B3/4 domain protein  34.41 
 
 
230 aa  71.6  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.809424 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1040  hypothetical protein  25.22 
 
 
234 aa  68.9  0.00000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0178906  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1602  B3/4 domain-containing protein  29.3 
 
 
221 aa  68.9  0.00000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.172541  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2486  Solo B3/4 domain-containing protein  24.22 
 
 
239 aa  68.2  0.0000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0131  B3/4 domain protein  25.48 
 
 
231 aa  68.2  0.0000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2004  phosphoenolpyruvate synthase  29.61 
 
 
217 aa  67  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1117  B3/4 domain-containing protein  27.27 
 
 
216 aa  65.9  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.871418  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1201  B3/4 domain-containing protein  28.03 
 
 
236 aa  64.3  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.62584  hitchhiker  0.00215136 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0519  B3/4 domain-containing protein  27.13 
 
 
221 aa  62.8  0.000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.015821  normal  0.0554264 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0928  B3/4 domain-containing protein  29.66 
 
 
236 aa  62.8  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.191069  normal  0.0846004 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1790  phosphoenolpyruvate synthase  26.98 
 
 
221 aa  61.2  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0241449 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02780  hypothetical protein  31.25 
 
 
242 aa  58.9  0.00000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.675259  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2162  hypothetical protein  26.17 
 
 
234 aa  58.5  0.00000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01765  hypothetical protein  27.55 
 
 
238 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.73481  normal  0.164289 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3145  B3/4 domain protein  31.37 
 
 
240 aa  57  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1912  B3/4 domain protein  27.91 
 
 
233 aa  55.8  0.0000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1676  B3/4 domain-containing protein  26.56 
 
 
221 aa  55.5  0.0000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4932  B3/4 domain protein  36.11 
 
 
228 aa  54.7  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2428  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  33.02 
 
 
792 aa  53.5  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.153279 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1717  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  31.9 
 
 
795 aa  54.3  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00142202  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1825  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  31.9 
 
 
795 aa  54.3  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.713489  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06500  hypothetical protein  23.44 
 
 
241 aa  53.9  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000280748  normal  0.453475 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1756  B3/4 domain-containing protein  24.85 
 
 
241 aa  52.8  0.000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0178794  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2262  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  30.17 
 
 
795 aa  52.4  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.283733 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14530  hypothetical protein  31.31 
 
 
222 aa  52.4  0.000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.278523  normal  0.107591 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8283  hypothetical protein  26.16 
 
 
235 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.182929  normal  0.669557 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0834  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  30.36 
 
 
818 aa  51.2  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2620  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  30.17 
 
 
795 aa  51.2  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00723547  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5071  B3/4 domain protein  30.69 
 
 
227 aa  51.6  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142893  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1176  B3/4 domain protein  24.34 
 
 
235 aa  51.2  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.185017  normal  0.273713 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1998  phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit  29.23 
 
 
784 aa  50.8  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.109142  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0911  hypothetical protein  25.6 
 
 
239 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5318  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  30.4 
 
 
808 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0273897 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2491  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  28.93 
 
 
805 aa  49.3  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5551  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.72 
 
 
808 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.325824  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2889  B3/4 domain-containing protein  28.32 
 
 
218 aa  49.3  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3247  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.05 
 
 
806 aa  48.5  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1005  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  28.97 
 
 
818 aa  48.5  0.00008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1683  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  24.82 
 
 
803 aa  48.5  0.00008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01730  hypothetical protein  27.27 
 
 
232 aa  47.8  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00581405  hitchhiker  0.00000000634299 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1761  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  27.27 
 
 
805 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1582  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  26.11 
 
 
816 aa  47.4  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0407  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  27.27 
 
 
805 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.70562  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0221  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  27.88 
 
 
812 aa  47.4  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1582  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  27.88 
 
 
809 aa  46.6  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09810  hypothetical protein  25.96 
 
 
239 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3623  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  30.69 
 
 
798 aa  46.2  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.117267 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05640  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  27.87 
 
 
799 aa  45.8  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2185  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  27.59 
 
 
795 aa  45.8  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.861692  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3530  B3/4 domain-containing protein  29.27 
 
 
228 aa  45.1  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.314219 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1449  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  27.68 
 
 
795 aa  45.1  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1466  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  27.68 
 
 
795 aa  45.1  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1433  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  27.68 
 
 
795 aa  45.1  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.030197 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1835  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  27.68 
 
 
795 aa  45.1  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000347523  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1875  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  25.44 
 
 
813 aa  45.1  0.0009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0861  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  22 
 
 
795 aa  44.3  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0924508  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2067  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  26.47 
 
 
795 aa  44.7  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0223695  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1972  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  26.92 
 
 
809 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0672  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  29.73 
 
 
873 aa  44.7  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2007  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  27.68 
 
 
795 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.693647 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1642  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  26.92 
 
 
809 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.39134 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4136  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  27.01 
 
 
845 aa  44.7  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000335113  hitchhiker  0.0000168171 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1280  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  27.88 
 
 
815 aa  44.3  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.477194  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2215  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  26.47 
 
 
795 aa  43.9  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.188862 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0932  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  22.36 
 
 
780 aa  43.5  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4756  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  28.46 
 
 
809 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1893  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  26.72 
 
 
795 aa  43.9  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14900  hypothetical protein  21.24 
 
 
241 aa  43.9  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000192579  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1520  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  27.64 
 
 
801 aa  43.1  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0586149  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2383  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  28.85 
 
 
792 aa  43.5  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295144  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2167  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  28.85 
 
 
792 aa  43.1  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0448  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  27.78 
 
 
818 aa  43.1  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.578489  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1312  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  27.27 
 
 
803 aa  43.1  0.003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3094  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  31.18 
 
 
820 aa  43.5  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.067961 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0444  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  27.62 
 
 
803 aa  43.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.341552  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1165  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  27.88 
 
 
815 aa  43.1  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.827312  normal  0.855752 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1553  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  26.92 
 
 
810 aa  42.7  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0073  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  29.27 
 
 
817 aa  42.4  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.252873  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1729  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  26.79 
 
 
795 aa  42.7  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.404063 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3032  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  25.76 
 
 
820 aa  42.4  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.538673  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1850  B3/4 domain-containing protein  25.74 
 
 
228 aa  42.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0280  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  28.3 
 
 
807 aa  42.4  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1790  B3/4 domain protein  25.74 
 
 
228 aa  42.4  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.23323 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1995  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  24.39 
 
 
801 aa  42.4  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1667  B3/4 domain-containing protein  25.74 
 
 
228 aa  42.4  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0922271 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2638  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  26.13 
 
 
793 aa  42  0.007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0689  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  27.88 
 
 
796 aa  42  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.428867  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>