63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_2004 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_2004  phosphoenolpyruvate synthase  100 
 
 		 217 aa  433  1e-121  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1717  B3/4 domain protein  57.42 
 
 		 224 aa  237  1e-61  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1602  B3/4 domain-containing protein  45.07 
 
 		 221 aa  159  4e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.172541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1790  phosphoenolpyruvate synthase  47.83 
 
 		 221 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0241449 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0519  B3/4 domain-containing protein  44.04 
 
 		 221 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.015821  normal  0.0554264 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1676  B3/4 domain-containing protein  44.2 
 
 		 221 aa  137  1e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1201  B3/4 domain-containing protein  39.89 
 
 		 236 aa  129  3e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.62584  hitchhiker  0.00215136 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0504  B3/4  41.46 
 
 		 213 aa  122  4e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.333323  normal  0.47226 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1117  B3/4 domain-containing protein  41.51 
 
 		 216 aa  122  4e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.871418  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0789  hypothetical protein  38.41 
 
 		 238 aa  86.3  3e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.995984 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3065  hypothetical protein  32.61 
 
 		 241 aa  80.1  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.570745  normal  0.843466 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5108  B3/4 domain protein  31.82 
 
 		 230 aa  79  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.809424 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0928  B3/4 domain-containing protein  34.35 
 
 		 236 aa  77.8  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.191069  normal  0.0846004 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5725  B3/4 domain protein  30.71 
 
 		 234 aa  76.3  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4932  B3/4 domain protein  38.64 
 
 		 228 aa  76.6  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2690  B3/4 domain protein  31.58 
 
 		 230 aa  72  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.366854  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2948  B3/4 domain protein  29.55 
 
 		 230 aa  68.9  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222758  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0502  B3/4 domain protein  28.11 
 
 		 220 aa  67.8  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf669  hypothetical protein  33.74 
 
 		 232 aa  67.8  0.0000000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1367  B3/4 domain protein  29.61 
 
 		 221 aa  67  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5429  phosphoenolpyruvate synthase  27.27 
 
 		 230 aa  67  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3145  B3/4 domain protein  29.45 
 
 		 240 aa  65.5  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2889  B3/4 domain-containing protein  33.79 
 
 		 218 aa  65.1  0.0000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0911  hypothetical protein  30 
 
 		 239 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02780  hypothetical protein  30.06 
 
 		 242 aa  64.7  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.675259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09810  hypothetical protein  29.23 
 
 		 239 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3672  B3/4 domain protein  33.64 
 
 		 249 aa  62.4  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14530  hypothetical protein  31.85 
 
 		 222 aa  61.6  0.000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.278523  normal  0.107591 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5071  B3/4 domain protein  34.48 
 
 		 227 aa  61.6  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8283  hypothetical protein  32.88 
 
 		 235 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.182929  normal  0.669557 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1912  B3/4 domain protein  37.65 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1788  B3/4 domain protein  28.46 
 
 		 228 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00972614  normal  0.283564 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1790  B3/4 domain protein  30 
 
 		 228 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.23323 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1486  B3/4 domain protein  28.46 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.275004  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1667  B3/4 domain-containing protein  30 
 
 		 228 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0922271 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1756  B3/4 domain-containing protein  28.99 
 
 		 241 aa  57  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0178794  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1850  B3/4 domain-containing protein  30 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3530  B3/4 domain-containing protein  25.15 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.314219 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1630  hypothetical protein  29.48 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.270951 
 
 
-
 
NC_003296  RS01765  hypothetical protein  24.34 
 
 		 238 aa  55.5  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.73481  normal  0.164289 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1176  B3/4 domain protein  29.1 
 
 		 235 aa  55.1  0.0000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.185017  normal  0.273713 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1040  hypothetical protein  31.14 
 
 		 234 aa  54.7  0.0000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0178906  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0131  B3/4 domain protein  31.88 
 
 		 231 aa  54.3  0.000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2162  hypothetical protein  32.81 
 
 		 234 aa  52.4  0.000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2205  B3/4 domain protein  36.7 
 
 		 221 aa  52  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01730  hypothetical protein  39.71 
 
 		 232 aa  51.6  0.000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00581405  hitchhiker  0.00000000634299 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06500  hypothetical protein  27.44 
 
 		 241 aa  50.8  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000280748  normal  0.453475 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0592  B3/4 domain protein  26.38 
 
 		 232 aa  50.1  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.557641  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14900  hypothetical protein  26.52 
 
 		 241 aa  49.3  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000192579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2486  Solo B3/4 domain-containing protein  26.71 
 
 		 239 aa  48.5  0.00007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0426  putative phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  28.19 
 
 		 876 aa  47.8  0.0001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.333075  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1492  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  31.67 
 
 		 847 aa  46.6  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000329891 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1605  B3/4 domain protein  32 
 
 		 235 aa  45.4  0.0006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000125396  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2358  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  29.29 
 
 		 818 aa  44.7  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0780657  normal  0.246211 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1371  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  27.42 
 
 		 540 aa  43.5  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000104238 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0336  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  29.37 
 
 		 554 aa  43.1  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0812381  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0932  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  34.09 
 
 		 780 aa  42.7  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3039  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  28.3 
 
 		 803 aa  42.4  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0321898  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0237  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  31.58 
 
 		 798 aa  42.4  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0771  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  27.35 
 
 		 809 aa  42  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1312  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  22.6 
 
 		 803 aa  42  0.007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0065  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  25.88 
 
 		 812 aa  42  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.145265 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0501  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  30.95 
 
 		 554 aa  41.6  0.01  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.885587  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>