78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1201 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1201  B3/4 domain-containing protein  100 
 
 		 236 aa  472  1e-132  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.62584  hitchhiker  0.00215136 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1602  B3/4 domain-containing protein  51.16 
 
 		 221 aa  204  9e-52  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.172541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0519  B3/4 domain-containing protein  50.99 
 
 		 221 aa  186  4e-46  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.015821  normal  0.0554264 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1790  phosphoenolpyruvate synthase  48.15 
 
 		 221 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0241449 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1676  B3/4 domain-containing protein  53.33 
 
 		 221 aa  181  7e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1717  B3/4 domain protein  39.35 
 
 		 224 aa  154  2e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1117  B3/4 domain-containing protein  39.47 
 
 		 216 aa  136  2e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.871418  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2004  phosphoenolpyruvate synthase  39.89 
 
 		 217 aa  129  4.0000000000000003e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0504  B3/4  38.64 
 
 		 213 aa  123  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.333323  normal  0.47226 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1912  B3/4 domain protein  32.09 
 
 		 233 aa  103  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0928  B3/4 domain-containing protein  30.3 
 
 		 236 aa  87.4  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.191069  normal  0.0846004 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1040  hypothetical protein  28.76 
 
 		 234 aa  82.8  0.000000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0178906  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3672  B3/4 domain protein  29.22 
 
 		 249 aa  79.3  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5725  B3/4 domain protein  34.38 
 
 		 234 aa  79  0.00000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1605  B3/4 domain protein  30.32 
 
 		 235 aa  78.6  0.00000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000125396  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2948  B3/4 domain protein  31.85 
 
 		 230 aa  77  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2690  B3/4 domain protein  32.35 
 
 		 230 aa  76.6  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.366854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5108  B3/4 domain protein  30.32 
 
 		 230 aa  73.2  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.809424 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2486  Solo B3/4 domain-containing protein  25.11 
 
 		 239 aa  73.2  0.000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0789  hypothetical protein  30.1 
 
 		 238 aa  72.4  0.000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.995984 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3065  hypothetical protein  28.48 
 
 		 241 aa  72  0.000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.570745  normal  0.843466 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0131  B3/4 domain protein  26.58 
 
 		 231 aa  70.1  0.00000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5429  phosphoenolpyruvate synthase  30.94 
 
 		 230 aa  68.9  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0502  B3/4 domain protein  26.17 
 
 		 220 aa  65.9  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1367  B3/4 domain protein  28.03 
 
 		 221 aa  64.3  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3145  B3/4 domain protein  26.7 
 
 		 240 aa  64.7  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01765  hypothetical protein  29.41 
 
 		 238 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.73481  normal  0.164289 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14900  hypothetical protein  25.33 
 
 		 241 aa  64.7  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000192579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02780  hypothetical protein  26.32 
 
 		 242 aa  65.1  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.675259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf669  hypothetical protein  26.42 
 
 		 232 aa  63.5  0.000000003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2162  hypothetical protein  23.89 
 
 		 234 aa  60.8  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06500  hypothetical protein  22.59 
 
 		 241 aa  60.8  0.00000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000280748  normal  0.453475 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1756  B3/4 domain-containing protein  25.43 
 
 		 241 aa  60.1  0.00000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0178794  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14530  hypothetical protein  26.23 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.278523  normal  0.107591 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2889  B3/4 domain-containing protein  29.1 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2205  B3/4 domain protein  33.1 
 
 		 221 aa  57  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8283  hypothetical protein  25.76 
 
 		 235 aa  55.5  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.182929  normal  0.669557 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01730  hypothetical protein  24.4 
 
 		 232 aa  52.8  0.000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00581405  hitchhiker  0.00000000634299 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21840  phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit  31.01 
 
 		 866 aa  51.2  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.310654  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1109  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.87 
 
 		 854 aa  51.2  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.387585 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5071  B3/4 domain protein  23.78 
 
 		 227 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0763  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  27.67 
 
 		 797 aa  50.8  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3530  B3/4 domain-containing protein  26.35 
 
 		 228 aa  49.7  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.314219 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4932  B3/4 domain protein  30.88 
 
 		 228 aa  49.7  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1604  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.14 
 
 		 807 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.140835  normal  0.0323303 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1306  phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit  32.54 
 
 		 810 aa  48.5  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.927981  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0065  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  28.99 
 
 		 812 aa  47.8  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.145265 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0209  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  30.71 
 
 		 807 aa  47.4  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.212777  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1176  B3/4 domain protein  27.48 
 
 		 235 aa  47  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.185017  normal  0.273713 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0212  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  28.4 
 
 		 802 aa  46.6  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1455  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  28.85 
 
 		 789 aa  47  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105434  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09810  hypothetical protein  34.67 
 
 		 239 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1630  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  31.19 
 
 		 807 aa  45.4  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0126985 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2303  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  27.59 
 
 		 814 aa  45.4  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.978211  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0138  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.22 
 
 		 791 aa  44.7  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4136  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  30.77 
 
 		 845 aa  45.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000335113  hitchhiker  0.0000168171 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3487  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  32.38 
 
 		 808 aa  44.7  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0592  B3/4 domain protein  32.41 
 
 		 232 aa  44.3  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.557641  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0210  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  28.79 
 
 		 810 aa  44.3  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0911  hypothetical protein  26.9 
 
 		 239 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1220  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  28.87 
 
 		 800 aa  44.3  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1198  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  28.87 
 
 		 800 aa  44.3  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0215  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  28.57 
 
 		 795 aa  43.9  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.468133  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0036  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  32.06 
 
 		 803 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.393053  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5477  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  32.98 
 
 		 834 aa  43.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.879135 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4271  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  32.04 
 
 		 810 aa  43.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02093  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  28.49 
 
 		 806 aa  42.7  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4536  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  30.71 
 
 		 807 aa  43.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.140615 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1054  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  28.88 
 
 		 819 aa  42.7  0.005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2358  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  36.25 
 
 		 818 aa  42.7  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0780657  normal  0.246211 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1095  phenylalanine--tRNA ligase  28.48 
 
 		 683 aa  42.7  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0227274  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3155  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  31.31 
 
 		 806 aa  42.4  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1490  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  31.75 
 
 		 847 aa  42.4  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.35538  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0073  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  32.2 
 
 		 817 aa  42  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.252873  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4096  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  30.65 
 
 		 799 aa  42  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1520  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  34.18 
 
 		 801 aa  42  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0586149  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1788  B3/4 domain protein  25.6 
 
 		 228 aa  41.6  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00972614  normal  0.283564 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1486  B3/4 domain protein  25.6 
 
 		 228 aa  41.6  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.275004  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>