13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0592 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0592  B3/4 domain protein  100 
 
 		 232 aa  476  1e-133  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.557641  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0519  B3/4 domain-containing protein  34.07 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.015821  normal  0.0554264 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1602  B3/4 domain-containing protein  32.45 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.172541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1676  B3/4 domain-containing protein  34.51 
 
 		 221 aa  53.5  0.000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0502  B3/4 domain protein  27.78 
 
 		 220 aa  53.1  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1790  phosphoenolpyruvate synthase  30.15 
 
 		 221 aa  51.6  0.000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0241449 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2004  phosphoenolpyruvate synthase  26.38 
 
 		 217 aa  50.1  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0504  B3/4  30.6 
 
 		 213 aa  45.8  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.333323  normal  0.47226 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1117  B3/4 domain-containing protein  30.37 
 
 		 216 aa  44.7  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.871418  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1201  B3/4 domain-containing protein  32.41 
 
 		 236 aa  44.3  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.62584  hitchhiker  0.00215136 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02780  hypothetical protein  35.71 
 
 		 242 aa  42.7  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.675259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3145  B3/4 domain protein  36.78 
 
 		 240 aa  42.4  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5725  B3/4 domain protein  31.5 
 
 		 234 aa  42  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>