66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0502 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0502  B3/4 domain protein  100 
 
 		 220 aa  456  1e-127  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1367  B3/4 domain protein  71.69 
 
 		 221 aa  343  1e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0789  hypothetical protein  30.46 
 
 		 238 aa  93.6  2e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.995984 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5725  B3/4 domain protein  39.56 
 
 		 234 aa  86.3  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5429  phosphoenolpyruvate synthase  31.11 
 
 		 230 aa  85.9  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2690  B3/4 domain protein  26.62 
 
 		 230 aa  79.3  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.366854  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2948  B3/4 domain protein  26.71 
 
 		 230 aa  79  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf669  hypothetical protein  27.78 
 
 		 232 aa  78.2  0.00000000000008  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3065  hypothetical protein  31.25 
 
 		 241 aa  76.3  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.570745  normal  0.843466 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5108  B3/4 domain protein  35.35 
 
 		 230 aa  76.3  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.809424 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2205  B3/4 domain protein  26.02 
 
 		 221 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3672  B3/4 domain protein  22.92 
 
 		 249 aa  73.6  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0131  B3/4 domain protein  25.96 
 
 		 231 aa  71.2  0.00000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0504  B3/4  26.95 
 
 		 213 aa  71.2  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.333323  normal  0.47226 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1717  B3/4 domain protein  25.77 
 
 		 224 aa  70.1  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2486  Solo B3/4 domain-containing protein  25.58 
 
 		 239 aa  69.3  0.00000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0928  B3/4 domain-containing protein  28.86 
 
 		 236 aa  68.6  0.00000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.191069  normal  0.0846004 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1040  hypothetical protein  25.11 
 
 		 234 aa  67.8  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0178906  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2004  phosphoenolpyruvate synthase  28.11 
 
 		 217 aa  67.8  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1602  B3/4 domain-containing protein  26 
 
 		 221 aa  68.2  0.0000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.172541  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01765  hypothetical protein  32.99 
 
 		 238 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.73481  normal  0.164289 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1201  B3/4 domain-containing protein  26.17 
 
 		 236 aa  65.9  0.0000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.62584  hitchhiker  0.00215136 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1117  B3/4 domain-containing protein  32.58 
 
 		 216 aa  63.5  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.871418  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0519  B3/4 domain-containing protein  28.24 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.015821  normal  0.0554264 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3145  B3/4 domain protein  22.43 
 
 		 240 aa  62.4  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1790  phosphoenolpyruvate synthase  24.49 
 
 		 221 aa  62  0.000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0241449 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1676  B3/4 domain-containing protein  30.68 
 
 		 221 aa  61.6  0.000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2162  hypothetical protein  28.14 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8283  hypothetical protein  25.23 
 
 		 235 aa  58.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.182929  normal  0.669557 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14530  hypothetical protein  27.38 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.278523  normal  0.107591 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02780  hypothetical protein  28.43 
 
 		 242 aa  57  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.675259  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1912  B3/4 domain protein  24.31 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2889  B3/4 domain-containing protein  29.13 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06500  hypothetical protein  24.85 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000280748  normal  0.453475 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4932  B3/4 domain protein  24.17 
 
 		 228 aa  54.7  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0592  B3/4 domain protein  27.78 
 
 		 232 aa  53.1  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.557641  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5071  B3/4 domain protein  24.39 
 
 		 227 aa  53.5  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09810  hypothetical protein  29.67 
 
 		 239 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2428  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  28.46 
 
 		 792 aa  48.5  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.153279 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1176  B3/4 domain protein  24.63 
 
 		 235 aa  46.2  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.185017  normal  0.273713 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3530  B3/4 domain-containing protein  25.6 
 
 		 228 aa  46.2  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.314219 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1998  phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit  28.83 
 
 		 784 aa  45.8  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.109142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1605  B3/4 domain protein  22.31 
 
 		 235 aa  45.8  0.0005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000125396  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4136  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  28.95 
 
 		 845 aa  45.8  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000335113  hitchhiker  0.0000168171 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5318  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  30.23 
 
 		 808 aa  45.4  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0273897 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3247  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  26.85 
 
 		 806 aa  44.3  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0834  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  29.23 
 
 		 818 aa  44.7  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14900  hypothetical protein  24.82 
 
 		 241 aa  44.3  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000192579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01730  hypothetical protein  27.27 
 
 		 232 aa  44.3  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00581405  hitchhiker  0.00000000634299 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2262  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  26.74 
 
 		 795 aa  43.5  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.283733 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1005  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  29.52 
 
 		 818 aa  42.7  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1667  B3/4 domain-containing protein  33.33 
 
 		 228 aa  42.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0922271 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1790  B3/4 domain protein  33.33 
 
 		 228 aa  42.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.23323 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1486  B3/4 domain protein  33.33 
 
 		 228 aa  42.7  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.275004  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1761  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  24.27 
 
 		 805 aa  42.4  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3163  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  30.77 
 
 		 854 aa  42.4  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.467401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0818  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  27.82 
 
 		 867 aa  42.4  0.006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1788  B3/4 domain protein  33.33 
 
 		 228 aa  42  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00972614  normal  0.283564 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1850  B3/4 domain-containing protein  33.33 
 
 		 228 aa  42.4  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0407  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  24.27 
 
 		 805 aa  42.4  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.70562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5551  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  27.91 
 
 		 808 aa  42  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.325824  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0911  hypothetical protein  31.82 
 
 		 239 aa  42.4  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1825  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  27.78 
 
 		 795 aa  41.6  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.713489  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2620  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  27.78 
 
 		 795 aa  42  0.008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00723547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1717  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  27.78 
 
 		 795 aa  41.6  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00142202  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0073  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  29.85 
 
 		 817 aa  41.6  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.252873  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>