50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1040 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1040  hypothetical protein  100 
 
 		 234 aa  477  1e-134  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0178906  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2486  Solo B3/4 domain-containing protein  53.25 
 
 		 239 aa  257  8e-68  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0131  B3/4 domain protein  51.09 
 
 		 231 aa  246  2e-64  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1176  B3/4 domain protein  52.89 
 
 		 235 aa  237  1e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.185017  normal  0.273713 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14900  hypothetical protein  49.79 
 
 		 241 aa  236  2e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000192579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf669  hypothetical protein  48.47 
 
 		 232 aa  225  5.0000000000000005e-58  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2162  hypothetical protein  46.67 
 
 		 234 aa  218  6e-56  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1756  B3/4 domain-containing protein  47.95 
 
 		 241 aa  218  6e-56  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0178794  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06500  hypothetical protein  41.84 
 
 		 241 aa  211  7.999999999999999e-54  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000280748  normal  0.453475 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02780  hypothetical protein  31.75 
 
 		 242 aa  136  3.0000000000000003e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.675259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4932  B3/4 domain protein  33.96 
 
 		 228 aa  124  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3145  B3/4 domain protein  31.8 
 
 		 240 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0928  B3/4 domain-containing protein  31.7 
 
 		 236 aa  118  7e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.191069  normal  0.0846004 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1486  B3/4 domain protein  38.99 
 
 		 228 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.275004  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1788  B3/4 domain protein  38.99 
 
 		 228 aa  116  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00972614  normal  0.283564 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1667  B3/4 domain-containing protein  38.99 
 
 		 228 aa  115  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0922271 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1790  B3/4 domain protein  38.99 
 
 		 228 aa  115  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.23323 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8283  hypothetical protein  31.65 
 
 		 235 aa  115  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.182929  normal  0.669557 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1850  B3/4 domain-containing protein  38.99 
 
 		 228 aa  114  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09810  hypothetical protein  41.91 
 
 		 239 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14530  hypothetical protein  31.84 
 
 		 222 aa  113  2.0000000000000002e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.278523  normal  0.107591 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2889  B3/4 domain-containing protein  31.77 
 
 		 218 aa  113  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3530  B3/4 domain-containing protein  40.25 
 
 		 228 aa  113  3e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.314219 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5071  B3/4 domain protein  40.41 
 
 		 227 aa  112  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0925  hypothetical protein  94.74 
 
 		 57 aa  108  5e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000509221  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0911  hypothetical protein  40.44 
 
 		 239 aa  108  6e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1912  B3/4 domain protein  30.74 
 
 		 233 aa  103  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1605  B3/4 domain protein  23.85 
 
 		 235 aa  99.8  4e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000125396  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3672  B3/4 domain protein  26.09 
 
 		 249 aa  91.7  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2690  B3/4 domain protein  24.89 
 
 		 230 aa  90.5  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.366854  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2948  B3/4 domain protein  25.78 
 
 		 230 aa  87  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5108  B3/4 domain protein  31.76 
 
 		 230 aa  84  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.809424 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5725  B3/4 domain protein  25.89 
 
 		 234 aa  83.2  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1602  B3/4 domain-containing protein  32.2 
 
 		 221 aa  82.8  0.000000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.172541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1201  B3/4 domain-containing protein  28.76 
 
 		 236 aa  82.8  0.000000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.62584  hitchhiker  0.00215136 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1717  B3/4 domain protein  31.64 
 
 		 224 aa  80.5  0.00000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3065  hypothetical protein  27.41 
 
 		 241 aa  78.6  0.00000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.570745  normal  0.843466 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5429  phosphoenolpyruvate synthase  31.43 
 
 		 230 aa  73.2  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1676  B3/4 domain-containing protein  31.55 
 
 		 221 aa  72  0.000000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01765  hypothetical protein  25.12 
 
 		 238 aa  70.9  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.73481  normal  0.164289 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0519  B3/4 domain-containing protein  29.95 
 
 		 221 aa  70.9  0.00000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.015821  normal  0.0554264 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1790  phosphoenolpyruvate synthase  28.5 
 
 		 221 aa  69.3  0.00000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0241449 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1367  B3/4 domain protein  25.22 
 
 		 221 aa  68.9  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0502  B3/4 domain protein  25.11 
 
 		 220 aa  67.8  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0789  hypothetical protein  29.82 
 
 		 238 aa  62.4  0.000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.995984 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0504  B3/4  27.21 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.333323  normal  0.47226 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2004  phosphoenolpyruvate synthase  31.14 
 
 		 217 aa  54.7  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1117  B3/4 domain-containing protein  27.21 
 
 		 216 aa  52.8  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.871418  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2205  B3/4 domain protein  31.48 
 
 		 221 aa  45.8  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01730  hypothetical protein  25.95 
 
 		 232 aa  43.9  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00581405  hitchhiker  0.00000000634299 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>