60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5108 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5108  B3/4 domain protein  100 
 
 		 230 aa  465  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.809424 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5429  phosphoenolpyruvate synthase  64.04 
 
 		 230 aa  291  4e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2690  B3/4 domain protein  61.4 
 
 		 230 aa  274  8e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.366854  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2948  B3/4 domain protein  60.53 
 
 		 230 aa  266  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222758  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5725  B3/4 domain protein  56.09 
 
 		 234 aa  257  1e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3065  hypothetical protein  54.25 
 
 		 241 aa  236  3e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.570745  normal  0.843466 
 
 
-
 
NC_003296  RS01765  hypothetical protein  47.6 
 
 		 238 aa  207  1e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.73481  normal  0.164289 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3672  B3/4 domain protein  43.65 
 
 		 249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0928  B3/4 domain-containing protein  33.33 
 
 		 236 aa  114  8.999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.191069  normal  0.0846004 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02780  hypothetical protein  35.52 
 
 		 242 aa  100  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.675259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09810  hypothetical protein  35.58 
 
 		 239 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5071  B3/4 domain protein  31.28 
 
 		 227 aa  92.8  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142893  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1912  B3/4 domain protein  32.33 
 
 		 233 aa  91.3  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1667  B3/4 domain-containing protein  31.1 
 
 		 228 aa  90.1  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0922271 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1486  B3/4 domain protein  33.33 
 
 		 228 aa  89.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.275004  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1850  B3/4 domain-containing protein  32.7 
 
 		 228 aa  89.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1790  B3/4 domain protein  31.1 
 
 		 228 aa  90.1  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.23323 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1788  B3/4 domain protein  33.33 
 
 		 228 aa  89.7  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00972614  normal  0.283564 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4932  B3/4 domain protein  31.58 
 
 		 228 aa  89.4  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3530  B3/4 domain-containing protein  33.97 
 
 		 228 aa  89.7  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.314219 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0911  hypothetical protein  33.97 
 
 		 239 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14530  hypothetical protein  32.29 
 
 		 222 aa  89.4  4e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.278523  normal  0.107591 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1605  B3/4 domain protein  35.25 
 
 		 235 aa  88.2  9e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000125396  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3145  B3/4 domain protein  31.36 
 
 		 240 aa  87.4  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1040  hypothetical protein  31.76 
 
 		 234 aa  84  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0178906  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8283  hypothetical protein  31.25 
 
 		 235 aa  79.3  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.182929  normal  0.669557 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0519  B3/4 domain-containing protein  30.19 
 
 		 221 aa  79  0.00000000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.015821  normal  0.0554264 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2004  phosphoenolpyruvate synthase  31.61 
 
 		 217 aa  79  0.00000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0502  B3/4 domain protein  35.35 
 
 		 220 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1717  B3/4 domain protein  31.54 
 
 		 224 aa  74.3  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1201  B3/4 domain-containing protein  30.32 
 
 		 236 aa  73.6  0.000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.62584  hitchhiker  0.00215136 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1676  B3/4 domain-containing protein  34.38 
 
 		 221 aa  72.8  0.000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1756  B3/4 domain-containing protein  30.11 
 
 		 241 aa  71.6  0.00000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0178794  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1367  B3/4 domain protein  34.41 
 
 		 221 aa  71.6  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2889  B3/4 domain-containing protein  31.55 
 
 		 218 aa  70.1  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1602  B3/4 domain-containing protein  33.08 
 
 		 221 aa  69.7  0.00000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.172541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf669  hypothetical protein  29.14 
 
 		 232 aa  68.6  0.00000000008  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14900  hypothetical protein  24.12 
 
 		 241 aa  67.4  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000192579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1790  phosphoenolpyruvate synthase  30.97 
 
 		 221 aa  67  0.0000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0241449 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2486  Solo B3/4 domain-containing protein  23.56 
 
 		 239 aa  66.6  0.0000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1176  B3/4 domain protein  28.57 
 
 		 235 aa  65.9  0.0000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.185017  normal  0.273713 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0131  B3/4 domain protein  23.81 
 
 		 231 aa  65.5  0.0000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2162  hypothetical protein  33.33 
 
 		 234 aa  62.4  0.000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1117  B3/4 domain-containing protein  31.47 
 
 		 216 aa  60.8  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.871418  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0504  B3/4  33.66 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.333323  normal  0.47226 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06500  hypothetical protein  24.71 
 
 		 241 aa  58.2  0.0000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000280748  normal  0.453475 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2205  B3/4 domain protein  34.44 
 
 		 221 aa  51.6  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2597  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  32.88 
 
 		 795 aa  46.2  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0200655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1829  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  33.33 
 
 		 795 aa  45.8  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000186413  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1952  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  32.47 
 
 		 795 aa  44.7  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2418  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  31.11 
 
 		 795 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000318266  hitchhiker  0.0000890505 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2086  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  32.22 
 
 		 795 aa  43.5  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1809  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  32.22 
 
 		 795 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2168  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  32.22 
 
 		 795 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0570245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1864  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  31.94 
 
 		 795 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1874  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  31.11 
 
 		 795 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000755096  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1901  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  31.11 
 
 		 795 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00294003  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1908  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  31.11 
 
 		 795 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00255913  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0789  hypothetical protein  24.42 
 
 		 238 aa  43.1  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.995984 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2842  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  35.14 
 
 		 824 aa  42.4  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.150751  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>