47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_14530 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_14530  hypothetical protein  100 
 
 
222 aa  446  1.0000000000000001e-124  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.278523  normal  0.107591 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3145  B3/4 domain protein  66.36 
 
 
240 aa  268  4e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02780  hypothetical protein  60.73 
 
 
242 aa  258  6e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.675259  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4932  B3/4 domain protein  51.36 
 
 
228 aa  202  4e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8283  hypothetical protein  49.77 
 
 
235 aa  197  7e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.182929  normal  0.669557 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09810  hypothetical protein  46.22 
 
 
239 aa  178  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0911  hypothetical protein  47.09 
 
 
239 aa  178  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5071  B3/4 domain protein  43.58 
 
 
227 aa  169  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142893  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3530  B3/4 domain-containing protein  41.26 
 
 
228 aa  168  7e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.314219 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2889  B3/4 domain-containing protein  45.45 
 
 
218 aa  161  6e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1667  B3/4 domain-containing protein  40 
 
 
228 aa  156  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0922271 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1790  B3/4 domain protein  40 
 
 
228 aa  156  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.23323 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1850  B3/4 domain-containing protein  40 
 
 
228 aa  155  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1788  B3/4 domain protein  39.09 
 
 
228 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00972614  normal  0.283564 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1486  B3/4 domain protein  39.09 
 
 
228 aa  152  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.275004  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2486  Solo B3/4 domain-containing protein  36.42 
 
 
239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1040  hypothetical protein  31.84 
 
 
234 aa  113  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0178906  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf669  hypothetical protein  32.38 
 
 
232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0928  B3/4 domain-containing protein  42.58 
 
 
236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.191069  normal  0.0846004 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1176  B3/4 domain protein  42.03 
 
 
235 aa  110  3e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.185017  normal  0.273713 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1756  B3/4 domain-containing protein  33.33 
 
 
241 aa  101  9e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0178794  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06500  hypothetical protein  36.52 
 
 
241 aa  100  2e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000280748  normal  0.453475 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0131  B3/4 domain protein  28.78 
 
 
231 aa  99.4  4e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3672  B3/4 domain protein  38.69 
 
 
249 aa  94.7  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2162  hypothetical protein  32.08 
 
 
234 aa  91.3  1e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14900  hypothetical protein  32.98 
 
 
241 aa  90.5  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000192579  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5108  B3/4 domain protein  31.72 
 
 
230 aa  87  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.809424 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1912  B3/4 domain protein  27.56 
 
 
233 aa  85.5  5e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2690  B3/4 domain protein  31.86 
 
 
230 aa  85.5  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.366854  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01765  hypothetical protein  32.38 
 
 
238 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.73481  normal  0.164289 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3065  hypothetical protein  36.05 
 
 
241 aa  82  0.000000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.570745  normal  0.843466 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2948  B3/4 domain protein  32.73 
 
 
230 aa  81.3  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222758  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5429  phosphoenolpyruvate synthase  34.01 
 
 
230 aa  80.5  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1605  B3/4 domain protein  30.77 
 
 
235 aa  76.3  0.0000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000125396  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5725  B3/4 domain protein  32.41 
 
 
234 aa  74.7  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2004  phosphoenolpyruvate synthase  31.85 
 
 
217 aa  61.6  0.000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1717  B3/4 domain protein  30.97 
 
 
224 aa  61.2  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1201  B3/4 domain-containing protein  26.23 
 
 
236 aa  59.7  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.62584  hitchhiker  0.00215136 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0502  B3/4 domain protein  27.38 
 
 
220 aa  57.8  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1676  B3/4 domain-containing protein  37.61 
 
 
221 aa  56.2  0.0000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1367  B3/4 domain protein  31.31 
 
 
221 aa  52.4  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2205  B3/4 domain protein  33.33 
 
 
221 aa  51.6  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0504  B3/4  36.9 
 
 
213 aa  49.7  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.333323  normal  0.47226 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1602  B3/4 domain-containing protein  24.19 
 
 
221 aa  47.8  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.172541  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1117  B3/4 domain-containing protein  27.45 
 
 
216 aa  47.4  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.871418  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0519  B3/4 domain-containing protein  37.21 
 
 
221 aa  45.4  0.0006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.015821  normal  0.0554264 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1790  phosphoenolpyruvate synthase  34.86 
 
 
221 aa  44.7  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0241449 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>