48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1756 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1756  B3/4 domain-containing protein  100 
 
 		 241 aa  499  1e-140  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0178794  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2486  Solo B3/4 domain-containing protein  49.79 
 
 		 239 aa  229  4e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1040  hypothetical protein  47.95 
 
 		 234 aa  218  6e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0178906  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1176  B3/4 domain protein  50.5 
 
 		 235 aa  207  1e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.185017  normal  0.273713 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14900  hypothetical protein  42.13 
 
 		 241 aa  207  1e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000192579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0131  B3/4 domain protein  41.33 
 
 		 231 aa  201  8e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf669  hypothetical protein  42.79 
 
 		 232 aa  201  9e-51  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06500  hypothetical protein  39.15 
 
 		 241 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000280748  normal  0.453475 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2162  hypothetical protein  40.27 
 
 		 234 aa  193  2e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3145  B3/4 domain protein  32.61 
 
 		 240 aa  109  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8283  hypothetical protein  33.95 
 
 		 235 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.182929  normal  0.669557 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0928  B3/4 domain-containing protein  30.58 
 
 		 236 aa  110  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.191069  normal  0.0846004 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02780  hypothetical protein  34 
 
 		 242 aa  109  3e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.675259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4932  B3/4 domain protein  30.56 
 
 		 228 aa  102  6e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14530  hypothetical protein  33.33 
 
 		 222 aa  101  1e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.278523  normal  0.107591 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1788  B3/4 domain protein  37.5 
 
 		 228 aa  89.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00972614  normal  0.283564 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1912  B3/4 domain protein  26.61 
 
 		 233 aa  89.7  3e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1486  B3/4 domain protein  37.5 
 
 		 228 aa  89.7  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.275004  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1602  B3/4 domain-containing protein  30.54 
 
 		 221 aa  88.2  1e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.172541  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2889  B3/4 domain-containing protein  30.54 
 
 		 218 aa  88.2  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1667  B3/4 domain-containing protein  36.76 
 
 		 228 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0922271 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1850  B3/4 domain-containing protein  36.76 
 
 		 228 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1790  B3/4 domain protein  36.76 
 
 		 228 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.23323 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09810  hypothetical protein  36.62 
 
 		 239 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3530  B3/4 domain-containing protein  33.97 
 
 		 228 aa  85.1  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.314219 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5725  B3/4 domain protein  24.79 
 
 		 234 aa  82.8  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5071  B3/4 domain protein  34.81 
 
 		 227 aa  82.4  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142893  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2948  B3/4 domain protein  31.12 
 
 		 230 aa  80.5  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0911  hypothetical protein  35.97 
 
 		 239 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1790  phosphoenolpyruvate synthase  27.8 
 
 		 221 aa  78.6  0.00000000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0241449 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1717  B3/4 domain protein  36.76 
 
 		 224 aa  78.2  0.0000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1605  B3/4 domain protein  27.36 
 
 		 235 aa  78.2  0.0000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000125396  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2690  B3/4 domain protein  28.37 
 
 		 230 aa  75.1  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.366854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5108  B3/4 domain protein  30.11 
 
 		 230 aa  71.6  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.809424 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5429  phosphoenolpyruvate synthase  27.51 
 
 		 230 aa  68.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1676  B3/4 domain-containing protein  27.54 
 
 		 221 aa  66.6  0.0000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3065  hypothetical protein  26.02 
 
 		 241 aa  67  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.570745  normal  0.843466 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3672  B3/4 domain protein  31.43 
 
 		 249 aa  65.9  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01765  hypothetical protein  29.94 
 
 		 238 aa  66.2  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.73481  normal  0.164289 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0519  B3/4 domain-containing protein  25.56 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.015821  normal  0.0554264 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1201  B3/4 domain-containing protein  25.43 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.62584  hitchhiker  0.00215136 
 
 
-
 
NC_002950  PG0789  hypothetical protein  25.22 
 
 		 238 aa  57  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.995984 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2004  phosphoenolpyruvate synthase  28.99 
 
 		 217 aa  57  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0504  B3/4  28.57 
 
 		 213 aa  54.3  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.333323  normal  0.47226 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1117  B3/4 domain-containing protein  25.68 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.871418  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1367  B3/4 domain protein  24.85 
 
 		 221 aa  52.8  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01730  hypothetical protein  22.15 
 
 		 232 aa  44.3  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00581405  hitchhiker  0.00000000634299 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0237  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  24.18 
 
 		 798 aa  42  0.01  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>