84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2948 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2948  B3/4 domain protein  100 
 
 		 230 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2690  B3/4 domain protein  80.43 
 
 		 230 aa  380  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.366854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5429  phosphoenolpyruvate synthase  66.96 
 
 		 230 aa  312  2.9999999999999996e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5108  B3/4 domain protein  60.53 
 
 		 230 aa  266  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.809424 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5725  B3/4 domain protein  58.08 
 
 		 234 aa  264  7e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3065  hypothetical protein  57.67 
 
 		 241 aa  249  2e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.570745  normal  0.843466 
 
 
-
 
NC_003296  RS01765  hypothetical protein  47.83 
 
 		 238 aa  208  6e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.73481  normal  0.164289 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3672  B3/4 domain protein  41.18 
 
 		 249 aa  126  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1912  B3/4 domain protein  22.67 
 
 		 233 aa  95.1  8e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02780  hypothetical protein  34.07 
 
 		 242 aa  93.6  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.675259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1040  hypothetical protein  25.78 
 
 		 234 aa  87.8  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0178906  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0928  B3/4 domain-containing protein  29.32 
 
 		 236 aa  87  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.191069  normal  0.0846004 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3145  B3/4 domain protein  34.62 
 
 		 240 aa  85.5  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1756  B3/4 domain-containing protein  30.1 
 
 		 241 aa  84  0.000000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0178794  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1717  B3/4 domain protein  30.63 
 
 		 224 aa  82  0.000000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4932  B3/4 domain protein  33.96 
 
 		 228 aa  81.6  0.000000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14530  hypothetical protein  32.73 
 
 		 222 aa  81.6  0.000000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.278523  normal  0.107591 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2486  Solo B3/4 domain-containing protein  23.21 
 
 		 239 aa  80.5  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1602  B3/4 domain-containing protein  33.33 
 
 		 221 aa  80.1  0.00000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.172541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf669  hypothetical protein  24.68 
 
 		 232 aa  80.1  0.00000000000003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0502  B3/4 domain protein  26.71 
 
 		 220 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0131  B3/4 domain protein  24.02 
 
 		 231 aa  78.2  0.00000000000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1201  B3/4 domain-containing protein  30.77 
 
 		 236 aa  77  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.62584  hitchhiker  0.00215136 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1486  B3/4 domain protein  29.81 
 
 		 228 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.275004  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1788  B3/4 domain protein  29.81 
 
 		 228 aa  76.6  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00972614  normal  0.283564 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1790  B3/4 domain protein  29.81 
 
 		 228 aa  76.6  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.23323 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1667  B3/4 domain-containing protein  29.81 
 
 		 228 aa  76.6  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0922271 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1605  B3/4 domain protein  31.33 
 
 		 235 aa  76.3  0.0000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000125396  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09810  hypothetical protein  33.33 
 
 		 239 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1367  B3/4 domain protein  26.03 
 
 		 221 aa  75.9  0.0000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1850  B3/4 domain-containing protein  29.81 
 
 		 228 aa  75.1  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0911  hypothetical protein  34.07 
 
 		 239 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2162  hypothetical protein  25.99 
 
 		 234 aa  73.2  0.000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1790  phosphoenolpyruvate synthase  31.33 
 
 		 221 aa  73.2  0.000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0241449 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0519  B3/4 domain-containing protein  32.06 
 
 		 221 aa  72.8  0.000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.015821  normal  0.0554264 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5071  B3/4 domain protein  28.37 
 
 		 227 aa  71.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8283  hypothetical protein  34.03 
 
 		 235 aa  71.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.182929  normal  0.669557 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1676  B3/4 domain-containing protein  33.88 
 
 		 221 aa  70.1  0.00000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3530  B3/4 domain-containing protein  29.59 
 
 		 228 aa  69.7  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.314219 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1176  B3/4 domain protein  27.46 
 
 		 235 aa  69.3  0.00000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.185017  normal  0.273713 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2004  phosphoenolpyruvate synthase  29.55 
 
 		 217 aa  68.9  0.00000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1117  B3/4 domain-containing protein  36.64 
 
 		 216 aa  68.2  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.871418  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2889  B3/4 domain-containing protein  31.85 
 
 		 218 aa  64.7  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0504  B3/4  27.85 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.333323  normal  0.47226 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06500  hypothetical protein  21.08 
 
 		 241 aa  62.4  0.000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000280748  normal  0.453475 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14900  hypothetical protein  21.52 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000192579  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0789  hypothetical protein  28.26 
 
 		 238 aa  54.7  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.995984 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2205  B3/4 domain protein  37.04 
 
 		 221 aa  53.5  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1829  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  27.59 
 
 		 795 aa  51.2  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000186413  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0047  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  40.32 
 
 		 802 aa  50.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0073  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  30.56 
 
 		 817 aa  49.7  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.252873  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2086  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  26.72 
 
 		 795 aa  49.3  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1874  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  31.87 
 
 		 795 aa  48.5  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000755096  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2418  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  31.87 
 
 		 795 aa  48.5  0.00008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000318266  hitchhiker  0.0000890505 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1901  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  31.87 
 
 		 795 aa  48.5  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00294003  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1908  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  31.87 
 
 		 795 aa  48.5  0.00008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00255913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1604  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  29.91 
 
 		 807 aa  48.5  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.140835  normal  0.0323303 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1809  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  26.36 
 
 		 795 aa  48.5  0.00009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2168  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  26.36 
 
 		 795 aa  48.5  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0570245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1952  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  32.97 
 
 		 795 aa  48.1  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0212  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  31.78 
 
 		 802 aa  47.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0036  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  29.82 
 
 		 803 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.393053  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2469  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  26.76 
 
 		 795 aa  47  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.228112  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1630  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  28.97 
 
 		 807 aa  47  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0126985 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5318  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  35.44 
 
 		 808 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0273897 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0065  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  28.47 
 
 		 812 aa  46.2  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.145265 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0361  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  29.55 
 
 		 827 aa  45.8  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.996315  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0444  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  28.95 
 
 		 803 aa  45.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.341552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0162  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  27.54 
 
 		 824 aa  45.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.676244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1864  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  25 
 
 		 795 aa  45.4  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2597  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  28.57 
 
 		 795 aa  45.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0200655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3487  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  31.13 
 
 		 808 aa  43.9  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1315  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  30.3 
 
 		 799 aa  43.5  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1893  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  25.2 
 
 		 795 aa  43.5  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0698  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  31.51 
 
 		 791 aa  43.1  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.155841  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5551  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.88 
 
 		 808 aa  42.7  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.325824  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0592  B3/4 domain protein  26.83 
 
 		 232 aa  42.7  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.557641  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0722  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  30.77 
 
 		 800 aa  42.7  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.898313  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1838  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.88 
 
 		 810 aa  42.4  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0684561 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3155  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  33.33 
 
 		 806 aa  42  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1410  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  28.07 
 
 		 792 aa  42  0.008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0168176  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1473  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  28.57 
 
 		 792 aa  42  0.008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000187632  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2315  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  33.85 
 
 		 803 aa  42  0.008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000507205  normal  0.531848 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0763  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  25.84 
 
 		 797 aa  41.6  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>