More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1972 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1642  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  97.03 
 
 
809 aa  1580    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.39134 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2149  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  43.37 
 
 
795 aa  657    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.625217  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1825  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  43.24 
 
 
795 aa  656    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.713489  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0698  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  44.65 
 
 
791 aa  669    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.155841  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1582  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  93.07 
 
 
809 aa  1519    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1005  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  57.96 
 
 
818 aa  930    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1717  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  43.24 
 
 
795 aa  656    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00142202  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1091  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  68.31 
 
 
810 aa  1120    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.39692  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2672  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  53.51 
 
 
794 aa  855    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2849  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  58.87 
 
 
808 aa  985    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0102687 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1280  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  75.21 
 
 
815 aa  1248    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.477194  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0432  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  43.19 
 
 
792 aa  644    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1012  phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit  47.22 
 
 
781 aa  719    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0141167 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1896  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  68.43 
 
 
810 aa  1123    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.963354  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1145  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  41.42 
 
 
793 aa  641    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.158362  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1457  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  68.8 
 
 
809 aa  1128    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4620  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  68.8 
 
 
809 aa  1117    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.52188  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1717  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  68.31 
 
 
810 aa  1123    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1883  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  61.06 
 
 
806 aa  1009    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0428661 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1875  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  61.03 
 
 
813 aa  1010    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1740  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  68.31 
 
 
810 aa  1120    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.218671  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1404  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  68.93 
 
 
809 aa  1118    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4611  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  60.51 
 
 
815 aa  984    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.16834  normal  0.0519802 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1972  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  100 
 
 
809 aa  1639    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0492  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  46.13 
 
 
792 aa  759    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.229173  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1553  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  67.82 
 
 
810 aa  1123    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1774  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  69.05 
 
 
809 aa  1131    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.35718 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2590  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  68.31 
 
 
810 aa  1123    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1750  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  59.83 
 
 
816 aa  1001    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0199771 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0968  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  68.31 
 
 
810 aa  1120    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1534  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  68.31 
 
 
810 aa  1120    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.540635  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1341  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  59.9 
 
 
810 aa  991    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1582  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  42.67 
 
 
816 aa  658    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3020  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  52.77 
 
 
796 aa  790    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1998  phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit  49.13 
 
 
784 aa  768    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.109142  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2107  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  59.61 
 
 
808 aa  989    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.123782  normal  0.168772 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1376  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  68.6 
 
 
811 aa  1134    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.44726 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1603  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  41.65 
 
 
795 aa  639    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.643795  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0834  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  58.81 
 
 
818 aa  960    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1165  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  73.96 
 
 
815 aa  1229    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.827312  normal  0.855752 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1455  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  44.02 
 
 
789 aa  657    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105434  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0998  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  68.8 
 
 
809 aa  1128    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2751  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  68.72 
 
 
811 aa  1138    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0848577  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0198  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  68.31 
 
 
810 aa  1120    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0148461  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1453  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  60.51 
 
 
814 aa  1011    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0763  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  43.96 
 
 
797 aa  652    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1709  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  42.01 
 
 
795 aa  642    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.739174  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1364  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  68.93 
 
 
809 aa  1117    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2620  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  43.12 
 
 
795 aa  652    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00723547  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2395  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  60.39 
 
 
814 aa  1011    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.990048  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1480  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  68.8 
 
 
809 aa  1128    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2854  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  58.58 
 
 
812 aa  947    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.440462  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3094  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  56.97 
 
 
821 aa  941    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.102742 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02445  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  42.63 
 
 
795 aa  633  1e-180  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.202536  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2215  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  41.52 
 
 
795 aa  632  1e-180  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.188862 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2597  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  41.89 
 
 
795 aa  634  1e-180  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0200655  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003705  phenylalanyl-tRNA synthetase beta chain  42.02 
 
 
801 aa  630  1e-179  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.374236  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2592  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  41.72 
 
 
794 aa  630  1e-179  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0126631 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1952  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  42.51 
 
 
795 aa  629  1e-179  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0844  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  41.96 
 
 
795 aa  629  1e-179  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000714216  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20470  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  43.14 
 
 
792 aa  630  1e-179  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2509  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  43.8 
 
 
792 aa  628  1e-178  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1732  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  41.65 
 
 
795 aa  627  1e-178  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00878056  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1404  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  41.23 
 
 
795 aa  627  1e-178  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1804  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  42.94 
 
 
793 aa  626  1e-178  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2067  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  41.89 
 
 
795 aa  628  1e-178  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0223695  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28710  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  43.56 
 
 
792 aa  626  1e-178  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.458463  decreased coverage  0.000000000220958 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1433  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  42.58 
 
 
795 aa  625  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.030197 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2007  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  42.45 
 
 
795 aa  624  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.693647 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1835  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  42.58 
 
 
795 aa  625  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000347523  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2167  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  42.09 
 
 
792 aa  623  1e-177  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02093  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  41.94 
 
 
806 aa  622  1e-177  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1956  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  43.37 
 
 
795 aa  623  1e-177  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.186913  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1893  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  42.75 
 
 
795 aa  624  1e-177  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1466  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  42.58 
 
 
795 aa  625  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1449  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  42.45 
 
 
795 aa  623  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01682  phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit  42.16 
 
 
795 aa  620  1e-176  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0961927  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1929  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  42.16 
 
 
795 aa  620  1e-176  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000518334  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2185  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  42.82 
 
 
795 aa  621  1e-176  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.861692  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2383  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  41.72 
 
 
792 aa  619  1e-176  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295144  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1918  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  42.16 
 
 
795 aa  620  1e-176  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.333448  normal  0.421493 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1793  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  42.16 
 
 
795 aa  620  1e-176  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000955232  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2431  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  42.16 
 
 
795 aa  620  1e-176  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.175376  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01671  hypothetical protein  42.16 
 
 
795 aa  620  1e-176  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0686641  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1932  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  42.16 
 
 
795 aa  619  1e-176  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000047761  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1936  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  42.09 
 
 
792 aa  616  1e-175  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0927196  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1477  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  42.03 
 
 
795 aa  618  1e-175  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.020093  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1981  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  42.09 
 
 
792 aa  615  1e-175  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.134276  normal  0.20776 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1955  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  42.03 
 
 
795 aa  616  1e-175  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.111711  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1972  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  42.35 
 
 
793 aa  615  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.025038 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2048  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  42.94 
 
 
795 aa  613  9.999999999999999e-175  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.424555  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2469  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  41.77 
 
 
795 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.228112  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2494  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  42.03 
 
 
795 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0476201  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1874  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  40.79 
 
 
795 aa  611  1e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000755096  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1908  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  40.66 
 
 
795 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00255913  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3476  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  42.23 
 
 
793 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00698698 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1864  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  40.54 
 
 
795 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2995  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  39.47 
 
 
807 aa  603  1.0000000000000001e-171  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0870176  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2086  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  40.29 
 
 
795 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1901  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  40.54 
 
 
795 aa  605  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00294003  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>