144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1068 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1068  hypothetical protein  100 
 
 		 611 aa  1226    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0561  amino acid permease-associated region  47.58 
 
 		 614 aa  543  1e-153  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0441544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3857  amino acid permease-associated region  46.29 
 
 		 614 aa  540  9.999999999999999e-153  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000427762  unclonable  0.0000151298 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2018  hypothetical protein  45.17 
 
 		 609 aa  527  1e-148  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0010431  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1880  hypothetical protein  45.69 
 
 		 608 aa  523  1e-147  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000195786  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2466  hypothetical protein  43.88 
 
 		 609 aa  520  1e-146  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000341492  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2515  hypothetical protein  43.88 
 
 		 609 aa  520  1e-146  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000264968  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3464  hypothetical protein  45.85 
 
 		 608 aa  521  1e-146  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000852812  decreased coverage  4.4181400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4627  amino acid permease  46.83 
 
 		 608 aa  521  1e-146  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.486141  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1201  amino acid permease-associated region  46.61 
 
 		 615 aa  520  1e-146  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0215506 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1113  hypothetical protein  46.2 
 
 		 608 aa  512  1e-144  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1210  amino acid permease  47.88 
 
 		 585 aa  513  1e-144  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.177071  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1112  hypothetical protein  46.83 
 
 		 612 aa  514  1e-144  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0727554  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4342  amino acid permease-associated region  45.26 
 
 		 611 aa  510  1e-143  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.676732  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1966  hypothetical protein  44.88 
 
 		 608 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000121839  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1191  amino acid permease-associated region  43.81 
 
 		 627 aa  494  9.999999999999999e-139  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000300657  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1740  amino acid permease  45.04 
 
 		 608 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000902487  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1994  hypothetical protein  45.45 
 
 		 608 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000355688  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1921  hypothetical protein  45.13 
 
 		 608 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0058200000000004e-24 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1697  amino acid permease  45.29 
 
 		 608 aa  491  1e-137  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000377076  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2069  hypothetical protein  44.79 
 
 		 672 aa  489  1e-137  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000284344  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2022  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  44.01 
 
 		 781 aa  484  1e-135  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8083  normal  0.142802 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1601  amino acid transporter  41.35 
 
 		 636 aa  470  1.0000000000000001e-131  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.654948  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0032  hypothetical protein  39.6 
 
 		 693 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0357  amino acid permease-associated region  43.07 
 
 		 612 aa  460  9.999999999999999e-129  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000770343  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0699  amino acid transporter-like protein  41.42 
 
 		 627 aa  457  1e-127  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000494308  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5190  hypothetical protein  40.75 
 
 		 731 aa  449  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.01905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1714  putative aminoacid/polyamine transporter, permease protein  40.47 
 
 		 683 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.553207  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1638  amino acid transporter  41.2 
 
 		 615 aa  440  9.999999999999999e-123  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1324  hypothetical protein  41.39 
 
 		 668 aa  436  1e-121  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.112475  normal  0.347698 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2243  amino acid transporter-like protein  39.35 
 
 		 629 aa  436  1e-121  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1878  amino acid transporter  41.65 
 
 		 677 aa  436  1e-121  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.148156  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1522  hypothetical protein  41.94 
 
 		 674 aa  435  1e-120  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.579036  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1635  putative transporter  40.68 
 
 		 658 aa  433  1e-120  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000053335 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2198  amino acid permease-associated region  40.69 
 
 		 664 aa  430  1e-119  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1503  amino acid transporter  39.02 
 
 		 614 aa  430  1e-119  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0415343  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2902  putative transporter  40.09 
 
 		 685 aa  431  1e-119  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2244  amino acid permease-associated region  40.69 
 
 		 664 aa  430  1e-119  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2474  amino acid permease-associated region  40.22 
 
 		 664 aa  430  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0436881  normal  0.698819 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2187  amino acid permease-associated region  40.85 
 
 		 664 aa  429  1e-119  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798252 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1642  putative transporter  40.12 
 
 		 654 aa  428  1e-118  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.05725  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2258  amino acid transporter  39.43 
 
 		 672 aa  427  1e-118  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.186562  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1487  hypothetical protein  41.63 
 
 		 696 aa  428  1e-118  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.479036  normal  0.671369 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1190  amino acid permease-associated region  40.09 
 
 		 653 aa  426  1e-118  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000537417  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2284  hypothetical protein  39.07 
 
 		 681 aa  424  1e-117  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.225884 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1791  amino acid transporter  42.21 
 
 		 614 aa  422  1e-116  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0243869  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1974  amino acid transporter-like protein  38.51 
 
 		 629 aa  421  1e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3755  amino acid transporter  40.35 
 
 		 682 aa  419  1e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000328435  normal  0.279832 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12705  alanine, valine and leucine rich integral membrane protein  40.91 
 
 		 657 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16180  hypothetical protein  41.37 
 
 		 672 aa  417  9.999999999999999e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.24522 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4526  amino acid transporter  39.21 
 
 		 655 aa  416  9.999999999999999e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0966094  normal  0.421958 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21241  amino acid transporter  39.44 
 
 		 615 aa  412  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.97289 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3926  amino acid permease-associated region  41.19 
 
 		 664 aa  415  1e-114  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.036267  normal  0.618812 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1452  hypothetical protein  42.1 
 
 		 691 aa  415  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.000394394  normal  0.0118097 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6758  hypothetical protein  40.46 
 
 		 704 aa  412  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0797924 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1397  hypothetical protein  41.59 
 
 		 674 aa  409  1.0000000000000001e-112  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1709  hypothetical protein  39.41 
 
 		 667 aa  404  1e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.71467  normal  0.0434218 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1943  putative transporter  40.69 
 
 		 678 aa  393  1e-108  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.630635  normal  0.0235121 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1916  hypothetical protein  39.13 
 
 		 667 aa  390  1e-107  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.635201  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1404  amino acid permease  38.18 
 
 		 678 aa  385  1e-105  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.943899 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1563  putative transporter  39.69 
 
 		 677 aa  376  1e-103  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.117047  normal  0.694586 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3408  amino acid permease-associated region  36.94 
 
 		 750 aa  367  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.492526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1503  putative aminoacid/polyamine transporter, permease protein  38.08 
 
 		 619 aa  358  9.999999999999999e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7673  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  37.34 
 
 		 815 aa  348  1e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.803412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1194  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  35.14 
 
 		 774 aa  342  2e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.701127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0002  hypothetical protein  35.67 
 
 		 622 aa  341  2e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000285538  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1747  hypothetical protein  49.72 
 
 		 365 aa  331  2e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.119292  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1922  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  35.63 
 
 		 777 aa  326  8.000000000000001e-88  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4183  putative aminoacid/polyamine transporter, permease protein  33.88 
 
 		 647 aa  318  2e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1443  amino acid permease-associated region  40.99 
 
 		 470 aa  259  8e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.839992  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13060  amino acid transporter  29.77 
 
 		 650 aa  226  1e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0101784  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1593  amino acid transporter-like protein  32.18 
 
 		 657 aa  187  4e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2571  amino acid transporter-like  27.44 
 
 		 656 aa  182  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.715012 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3101  amino acid transporter-like protein  30.88 
 
 		 685 aa  176  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1726  amino acid permease, C-terminal  40.66 
 
 		 272 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0922786  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2448  amino acid permease-associated region  31.08 
 
 		 713 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0321394 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2826  hypothetical protein  31.08 
 
 		 713 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3262  amino acid permease-associated region  32.09 
 
 		 657 aa  174  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1725  amino acid permease, central region  44.65 
 
 		 253 aa  173  7.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.759722  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0942  amino acid transporter-like protein  31.5 
 
 		 680 aa  166  9e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.589203  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0945  amino acid transporter-like protein  31.36 
 
 		 680 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0024  lysine-specific permease  31.84 
 
 		 647 aa  159  2e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1995  hypothetical protein  31.84 
 
 		 647 aa  159  2e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1748  hypothetical protein  36.7 
 
 		 218 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0151353  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1041  amino acid permease-associated region  31.1 
 
 		 657 aa  106  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1038  amino acid permease-associated region  31.1 
 
 		 657 aa  105  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1724  amino acid permease, N-terminal  54.95 
 
 		 101 aa  103  7e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0979  amino acid permease-associated region  31.05 
 
 		 655 aa  87.4  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.696975  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3899  hypothetical protein  28.82 
 
 		 448 aa  68.2  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.823757  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3973  hypothetical protein  28.82 
 
 		 448 aa  68.2  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.460443  normal  0.984313 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3914  hypothetical protein  28.82 
 
 		 448 aa  68.2  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2796  amino acid permease-associated region  25.37 
 
 		 580 aa  67  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2055  amino acid permease-associated region  26.67 
 
 		 449 aa  65.1  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01917  predicted amino-acid transporter  24.93 
 
 		 452 aa  57.8  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1643  amino acid permease-associated region  24.93 
 
 		 452 aa  57.8  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.121061  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01903  hypothetical protein  24.93 
 
 		 452 aa  57.8  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2305  amino acid permease  24.93 
 
 		 452 aa  57.8  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1626  amino acid permease-associated region  24.93 
 
 		 452 aa  57.8  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.287278 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1045  amino acid permease  24.93 
 
 		 452 aa  57.8  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0835245 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1218  amino acid permease  24.93 
 
 		 452 aa  57.8  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>