More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0084 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_0087  glutamyl-tRNA synthetase  66.67 
 
 
485 aa  650    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000536948  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0087  glutamyl-tRNA synthetase  66.67 
 
 
485 aa  650    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000457939  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0084  glutamyl-tRNA synthetase  66.67 
 
 
485 aa  650    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000172568  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0083  glutamyl-tRNA synthetase  66.67 
 
 
485 aa  650    Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000937191  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0082  glutamyl-tRNA synthetase  65.23 
 
 
485 aa  643    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000167432  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  87.47 
 
 
486 aa  901    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0086  glutamyl-tRNA synthetase  66.67 
 
 
485 aa  650    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000396162  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5218  glutamyl-tRNA synthetase  66.12 
 
 
491 aa  647    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000214653  unclonable  2.62835e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0108  glutamyl-tRNA synthetase  66.94 
 
 
491 aa  654    Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000769227  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0082  glutamyl-tRNA synthetase  66.26 
 
 
485 aa  666    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000052897  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0118  glutamyl-tRNA synthetase  66.67 
 
 
485 aa  650    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000768632  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0098  glutamyl-tRNA synthetase  66.32 
 
 
491 aa  664    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.11563e-60 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0084  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 
491 aa  1013    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0550  glutamyl-tRNA synthetase  60.95 
 
 
484 aa  615  1e-175  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0564  glutamyl-tRNA synthetase  60.95 
 
 
484 aa  615  1e-175  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0168  glutamyl-tRNA synthetase  60.66 
 
 
484 aa  612  9.999999999999999e-175  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0337  glutamyl-tRNA synthetase  54.66 
 
 
499 aa  550  1e-155  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000120471  hitchhiker  0.00000000382568 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2346  glutamyl-tRNA synthetase  53.64 
 
 
483 aa  523  1e-147  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0066812  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1793  glutamyl-tRNA synthetase  55.67 
 
 
484 aa  525  1e-147  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0101164  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0113  glutamyl-tRNA synthetase  54.56 
 
 
484 aa  519  1e-146  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000311302  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  50.83 
 
 
482 aa  511  1e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  51.98 
 
 
485 aa  509  1e-143  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  49.69 
 
 
485 aa  497  1e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  48.65 
 
 
485 aa  494  9.999999999999999e-139  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  48.67 
 
 
488 aa  483  1e-135  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  49.79 
 
 
488 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000204549  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0161  glutamyl-tRNA synthetase  49.4 
 
 
498 aa  470  1.0000000000000001e-131  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0361508  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2733  glutamyl-tRNA synthetase  47.33 
 
 
494 aa  470  1.0000000000000001e-131  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0694392  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0321  glutamyl-tRNA synthetase  49.3 
 
 
498 aa  463  1e-129  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl651  glutamyl-tRNA synthetase  47.2 
 
 
482 aa  461  9.999999999999999e-129  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0130  glutamyl-tRNA synthetase  48.66 
 
 
483 aa  458  1e-127  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 
490 aa  454  1.0000000000000001e-126  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000392193  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  48.15 
 
 
494 aa  450  1e-125  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  46.39 
 
 
490 aa  447  1.0000000000000001e-124  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2357  glutamyl-tRNA synthetase  47.23 
 
 
490 aa  442  1e-123  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf641  glutamyl-tRNA synthetase  48.46 
 
 
464 aa  444  1e-123  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  46.28 
 
 
477 aa  441  9.999999999999999e-123  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2538  glutamyl-tRNA synthetase  44.93 
 
 
481 aa  434  1e-120  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1201  glutamyl-tRNA synthetase  46.02 
 
 
501 aa  427  1e-118  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000196599  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1646  glutamyl-tRNA synthetase  43.47 
 
 
493 aa  422  1e-117  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.875023  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0083  glutamyl-tRNA synthetase  45.29 
 
 
488 aa  422  1e-117  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.452446  hitchhiker  0.000158184 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  44.06 
 
 
479 aa  419  1e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1289  glutamyl-tRNA synthetase  43.99 
 
 
500 aa  419  1e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1325  glutamyl-tRNA synthetase  47.11 
 
 
478 aa  414  1e-114  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  44.51 
 
 
495 aa  413  1e-114  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  42.47 
 
 
501 aa  404  1e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1866  glutamyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 
495 aa  400  9.999999999999999e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0953769  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4861  glutamyl-tRNA synthetase  43.7 
 
 
481 aa  398  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000702508  unclonable  0.000000180865 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  42.65 
 
 
491 aa  398  1e-109  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257278  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1721  glutamyl-tRNA synthetase  41.87 
 
 
504 aa  392  1e-108  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.730284  normal  0.139822 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0077  glutamyl-tRNA synthetase  40.61 
 
 
492 aa  392  1e-108  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0065  glutamyl-tRNA synthetase  43.44 
 
 
473 aa  390  1e-107  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0249226  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0392  glutamyl-tRNA synthetase  42.38 
 
 
502 aa  387  1e-106  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00651757  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0941  glutamyl-tRNA synthetase  42.65 
 
 
480 aa  388  1e-106  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0704  glutamyl-tRNA synthetase  42.18 
 
 
482 aa  388  1e-106  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.574846  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0670  glutamyl-tRNA synthetase  42.47 
 
 
464 aa  382  1e-105  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.418683  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0678  glutamyl-tRNA synthetase  43.79 
 
 
469 aa  384  1e-105  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0260841  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3060  glutamyl-tRNA synthetase  43.19 
 
 
481 aa  379  1e-104  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000448328  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4302  glutamyl-tRNA synthetase  42.22 
 
 
481 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1783  glutamyl-tRNA synthetase  41.72 
 
 
503 aa  382  1e-104  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0500613 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0464  glutamyl-tRNA synthetase  41.45 
 
 
502 aa  381  1e-104  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.295765  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2320  glutamyl-tRNA synthetase  41.96 
 
 
507 aa  380  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.687985  normal  0.453675 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1432  glutamyl-tRNA synthetase  44.15 
 
 
469 aa  380  1e-104  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0359  glutamyl-tRNA synthetase  41.11 
 
 
502 aa  378  1e-103  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1478  glutamyl-tRNA synthetase  43.94 
 
 
469 aa  378  1e-103  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2361  glutamyl-tRNA synthetase  41.33 
 
 
483 aa  376  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000183639  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0427  glutamyl-tRNA synthetase  40.72 
 
 
502 aa  378  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0347123  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2393  glutamyl-tRNA synthetase  43.28 
 
 
481 aa  372  1e-102  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0156972  hitchhiker  0.00526056 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1695  glutamyl-tRNA synthetase  42.63 
 
 
506 aa  374  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0714  glutamyl-tRNA synthetase  42.02 
 
 
504 aa  374  1e-102  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.724966  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09840  glutamyl-tRNA synthetase  41 
 
 
492 aa  371  1e-101  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.224887 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08460  glutamyl-tRNA synthetase  42.14 
 
 
498 aa  369  1e-101  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.842364  normal  0.487414 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3196  glutamyl-tRNA synthetase  42.09 
 
 
482 aa  371  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0504  glutamyl-tRNA synthetase  41.21 
 
 
512 aa  369  1e-101  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1989  glutamyl-tRNA synthetase  41.5 
 
 
503 aa  372  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.16917  normal  0.165816 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0584  glutamyl-tRNA synthetase  39.54 
 
 
466 aa  369  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0242919  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49888  predicted protein  42.08 
 
 
546 aa  369  1e-101  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.757825  normal  0.413505 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3484  glutamyl-tRNA synthetase  39.46 
 
 
469 aa  370  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1365  glutamyl-tRNA synthetase  41.53 
 
 
484 aa  367  1e-100  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1650  glutamyl-tRNA synthetase  38.84 
 
 
466 aa  368  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.93151e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2309  glutamyl-tRNA synthetase  40.73 
 
 
483 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0211  glutamyl-tRNA synthetase  40.76 
 
 
492 aa  365  1e-99  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2856  glutamyl-tRNA synthetase  40.61 
 
 
496 aa  362  8e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0051  glutamyl-tRNA synthetase / glutamate--tRNA(Gln) ligase  41 
 
 
518 aa  361  2e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0504  glutamyl-tRNA synthetase  39.01 
 
 
504 aa  361  2e-98  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0630842  normal  0.758869 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1176  glutamyl-tRNA synthetase  40.9 
 
 
487 aa  359  7e-98  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1566  glutamyl-tRNA synthetase  39.77 
 
 
505 aa  358  9.999999999999999e-98  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0204  glutamyl-tRNA synthetase  37.8 
 
 
506 aa  358  9.999999999999999e-98  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000464542  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4262  glutamyl-tRNA synthetase  40.08 
 
 
516 aa  358  1.9999999999999998e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.145165 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1604  glutamyl-tRNA synthetase  40.82 
 
 
465 aa  358  1.9999999999999998e-97  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161822  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1146  glutamyl-tRNA synthetase  41.01 
 
 
484 aa  357  2.9999999999999997e-97  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3355  glutamyl-tRNA synthetase  39.37 
 
 
504 aa  357  2.9999999999999997e-97  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000992039  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1830  glutamyl-tRNA synthetase  40 
 
 
488 aa  356  5e-97  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.462923  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0922  glutamyl-tRNA synthetase  41.65 
 
 
464 aa  356  5.999999999999999e-97  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000416745  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2273  glutamyl-tRNA synthetase  42.07 
 
 
503 aa  355  1e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0229263 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0188  glutamate--tRNA(Gln) ligase / glutamyl-tRNA synthetase  40.17 
 
 
881 aa  354  2e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0814  glutamyl-tRNA synthetase  39.46 
 
 
468 aa  355  2e-96  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.407873  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0944  glutamyl-tRNA synthetase  40.91 
 
 
464 aa  353  5e-96  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000402314  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0221  glutamyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 
490 aa  351  1e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0268033  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4891  glutamyl-tRNA synthetase  39.26 
 
 
509 aa  351  2e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>