More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0671 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0671  recombination helicase AddA  100 
 
 		 1244 aa  2557    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2039  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  41.78 
 
 		 1251 aa  952    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0967  recombination helicase AddA  36.66 
 
 		 1217 aa  742    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0555  exonuclease RexA  35.9 
 
 		 1218 aa  732    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1486  recombination helicase AddA  68.67 
 
 		 1242 aa  1706    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1193  ATP-dependent nuclease, subunit A  56.64 
 
 		 1241 aa  1390    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1245  ATP-dependent nuclease, subunit A  57.04 
 
 		 1241 aa  1402    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1276  UvrD-like DNA helicase, C terminal  43.3 
 
 		 1230 aa  936    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1061  ATP-dependent nuclease subunit A  57.2 
 
 		 1241 aa  1399    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1041  ATP-dependent nuclease, subunit A  56.88 
 
 		 1241 aa  1398    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0860  recombination helicase AddA  56.32 
 
 		 1242 aa  1388    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1039  ATP-dependent nuclease, subunit A  56.96 
 
 		 1241 aa  1398    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0203  UvrD-like DNA helicase, C terminal  41.39 
 
 		 1233 aa  886    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0986  recombination helicase AddA  36.66 
 
 		 1217 aa  742    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0857621  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1855  recombination helicase AddA  35.96 
 
 		 1282 aa  775    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0546193 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1142  ATP-dependent nuclease subunit A  57.2 
 
 		 1241 aa  1399    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3423  recombination helicase AddA  33.58 
 
 		 1377 aa  696    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2832  recombination helicase AddA  38.31 
 
 		 1392 aa  821    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1416  UvrD-like DNA helicase, C terminal  44.71 
 
 		 1244 aa  1033    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1220  ATP-dependent nuclease, subunit A  57.09 
 
 		 1240 aa  1395    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1041  recombination helicase AddA  57.12 
 
 		 1241 aa  1395    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.552246  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4148  ATP-dependent nuclease, subunit A  56.8 
 
 		 1241 aa  1398    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0025  ATP-dependent nuclease, subunit A  40.11 
 
 		 1271 aa  873    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0025  recombination helicase AddA  40.41 
 
 		 1270 aa  879    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1774  recombination helicase AddA  40.5 
 
 		 1248 aa  890    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1297  ATP-dependent nuclease, subunit A  57.12 
 
 		 1241 aa  1401    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1146  ATP-dependent exoDNAse beta subunit  37.61 
 
 		 1236 aa  818    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1481  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  34.58 
 
 		 1230 aa  642    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1031  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) beta subunit  32.01 
 
 		 1204 aa  619  1e-175  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.655323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0309  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  31.79 
 
 		 1186 aa  567  1e-160  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0482  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  42.95 
 
 		 1405 aa  498  1e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0050  recombination helicase AddA  32.16 
 
 		 1392 aa  494  9.999999999999999e-139  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.110759  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0004  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  29.7 
 
 		 1203 aa  492  1e-137  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0874  exonuclease RexA  30.49 
 
 		 1207 aa  481  1e-134  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.149314  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1681  ATP-dependent exoDNAse beta subunit  30.32 
 
 		 1217 aa  474  1e-132  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2076  UvrD/REP helicase  31.96 
 
 		 1240 aa  457  1e-127  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.692604  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0523  UvrD/REP helicase  28.24 
 
 		 1121 aa  439  1e-121  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1805  UvrD/REP helicase  25.44 
 
 		 1184 aa  202  5e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1322  hypothetical protein  25.19 
 
 		 1057 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1157  hypothetical protein  26.6 
 
 		 1061 aa  189  3e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1286  UvrD/REP helicase  25.17 
 
 		 1074 aa  181  4.999999999999999e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1377  Exodeoxyribonuclease V  28.85 
 
 		 1226 aa  177  9.999999999999999e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.246845  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00770  ATP-dependent exonuclase V beta subunit, helicase and exonuclease domain-containing  25 
 
 		 1262 aa  173  1e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4408  UvrD/REP helicase  25.19 
 
 		 1123 aa  173  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.471337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3438  double-strand break repair helicase AddA  23.55 
 
 		 1125 aa  162  5e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0359  UvrD/Rep/AddA family helicase  23.68 
 
 		 1089 aa  160  2e-37  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1498  UvrD/REP helicase  26.98 
 
 		 1080 aa  157  1e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1357  UvrD/REP helicase  28.5 
 
 		 1196 aa  155  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0551  UvrD/REP helicase  26.63 
 
 		 1149 aa  154  1e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0345301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0086  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  24.58 
 
 		 1183 aa  151  6e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0841  UvrD/REP helicase  24.1 
 
 		 1161 aa  150  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.94071  normal  0.0247795 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0870  UvrD/REP helicase  24.62 
 
 		 1165 aa  149  2.0000000000000003e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.129938 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0641  UvrD/REP helicase  24.04 
 
 		 1173 aa  147  2e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0566745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0782  UvrD/REP helicase  24.49 
 
 		 1107 aa  145  5e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.685172  normal  0.12668 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3242  double-strand break repair helicase AddA  24.23 
 
 		 1189 aa  145  6e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1357  double-strand break repair helicase AddA  23.8 
 
 		 1155 aa  142  6e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1775  hypothetical protein  24.42 
 
 		 1076 aa  141  8.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1997  UvrD/REP helicase  22.67 
 
 		 1161 aa  139  3.0000000000000003e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.283179  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2846  UvrD/REP helicase  24.16 
 
 		 1121 aa  139  3.0000000000000003e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.347056 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1708  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) beta subunit  23.08 
 
 		 1118 aa  139  4e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0372  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  24.4 
 
 		 1168 aa  138  6.0000000000000005e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0389874  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2124  UvrD/REP helicase  26.81 
 
 		 1147 aa  136  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1776  hypothetical protein  24.47 
 
 		 1076 aa  136  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2794  UvrD-like DNA helicase domain-containing protein  27.56 
 
 		 1124 aa  136  3e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.370193 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0037  UvrD/REP helicase  26.9 
 
 		 1115 aa  136  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3118  UvrD/REP helicase  23.21 
 
 		 1061 aa  136  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674969 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08490  ATP-dependent exonuclase V beta subunit, helicase and exonuclease domain-containing  25.37 
 
 		 1251 aa  134  2.0000000000000002e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.266931 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4853  double-strand break repair helicase AddA  23.74 
 
 		 1157 aa  132  4.0000000000000003e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.744046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1997  UvrD/REP helicase  25.74 
 
 		 1110 aa  132  4.0000000000000003e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.469294  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1560  UvrD/REP helicase  22.07 
 
 		 1054 aa  130  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.538348  normal  0.490234 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1190  hypothetical protein  26.16 
 
 		 1177 aa  128  7e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2641  UvrD/REP helicase  24.44 
 
 		 1168 aa  127  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0136938 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1571  UvrD/REP helicase  26.17 
 
 		 1110 aa  127  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1305  UvrD/REP helicase  26.98 
 
 		 1185 aa  126  2e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.737945  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4954  double-strand break repair helicase AddA  23.98 
 
 		 1147 aa  125  6e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.218744 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5412  UvrD/REP helicase  26.61 
 
 		 1117 aa  123  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0988  UvrD/REP helicase  24.97 
 
 		 1146 aa  123  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.181635  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0375  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.07 
 
 		 763 aa  123  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1101  UvrD/REP helicase  25.75 
 
 		 1065 aa  123  1.9999999999999998e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0085  ATP-dependent DNA helicase UvrD  25.51 
 
 		 1139 aa  122  3e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0625  UvrD/REP helicase  25.36 
 
 		 1019 aa  122  4.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.243128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0519  UvrD/REP helicase  24.78 
 
 		 1130 aa  122  6e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0090  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  23.41 
 
 		 1156 aa  121  7e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195606  normal  0.386807 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1741  UvrD/REP helicase  24.54 
 
 		 1162 aa  121  7e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.616964  hitchhiker  0.00243499 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1975  UvrD/REP helicase  26.8 
 
 		 1132 aa  121  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.109081  normal  0.151355 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6025  UvrD/REP helicase  26.83 
 
 		 787 aa  120  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1248  Exodeoxyribonuclease V  25.3 
 
 		 833 aa  120  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.637879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2961  ATP-dependent DNA helicase  25.75 
 
 		 678 aa  120  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.26035  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1514  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.23 
 
 		 755 aa  120  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2417  Exodeoxyribonuclease V  24.35 
 
 		 1124 aa  120  1.9999999999999998e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.449307  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2896  UvrD/REP helicase  25.96 
 
 		 1165 aa  119  3e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.522615  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1270  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  22.57 
 
 		 1240 aa  119  3e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1375  UvrD/REP helicase family protein  23.37 
 
 		 1110 aa  119  3.9999999999999997e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.134048  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2131  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V subunit A  25.83 
 
 		 1187 aa  117  8.999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.564437  normal  0.516906 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0691  exodeoxyribonuclease V, beta subunit  23.68 
 
 		 1200 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1873  UvrD/REP helicase  24.69 
 
 		 786 aa  117  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.340872  normal  0.0203553 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2114  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  25.3 
 
 		 1197 aa  117  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4066  UvrD/REP helicase  27.15 
 
 		 1120 aa  117  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.160711 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2005  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  24.41 
 
 		 1155 aa  117  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25 
 
 		 785 aa  117  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>