More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0414 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0414  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  100 
 
 
581 aa  1184    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3432  sporulation kinase A  36.2 
 
 
510 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0123298  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3702  sporulation kinase A  36.2 
 
 
510 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3670  sporulation kinase A  37.12 
 
 
510 aa  288  2e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.825905  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3344  sporulation kinase A  35.99 
 
 
510 aa  288  2e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3749  sporulation kinase A  35.99 
 
 
510 aa  288  2e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3674  sporulation kinase A  36.42 
 
 
510 aa  288  2e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.123371  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1567  sporulation kinase A  35.99 
 
 
510 aa  288  2e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.800828 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3652  sporulation kinase A  35.99 
 
 
510 aa  288  2e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3393  sporulation kinase A  35.99 
 
 
510 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.785669  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2307  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.82 
 
 
506 aa  282  9e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2115  sporulation kinase  37.32 
 
 
801 aa  282  1e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3143  sporulation kinase  37.74 
 
 
801 aa  280  4e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.564779 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2889  sensory transduction histidine kinase; sporulation kinase A  37.74 
 
 
801 aa  280  4e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.516791  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3122  sporulation kinase  37.53 
 
 
801 aa  280  6e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3327  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.24 
 
 
510 aa  279  9e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.26559  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5651  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.82 
 
 
801 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.285543 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1736  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.21 
 
 
738 aa  256  5e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1395  histidine kinase  55.46 
 
 
581 aa  255  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0841  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.94 
 
 
744 aa  252  1e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0673  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  40.48 
 
 
1215 aa  252  1e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2665  sensor histidine kinase  32.78 
 
 
590 aa  252  1e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00650271 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2659  hypothetical protein  34.51 
 
 
595 aa  250  5e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.306767  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2505  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 
595 aa  243  7.999999999999999e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0288015  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2380  sensor histidine kinase  33.06 
 
 
595 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.343005  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2653  sensor histidine kinase  33.06 
 
 
595 aa  241  4e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000377576 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2419  sensor histidine kinase  33.06 
 
 
595 aa  241  4e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.131968  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2636  sensor histidine kinase  33.06 
 
 
499 aa  239  9e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2456  sensor histidine kinase  33.06 
 
 
509 aa  239  1e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.237642  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2703  hypothetical protein  31.87 
 
 
595 aa  238  3e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.894836  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2662  hypothetical protein  33.19 
 
 
595 aa  237  4e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17167  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1880  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 
612 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.139426  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1966  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.4 
 
 
492 aa  214  3.9999999999999995e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.917004  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1004  sensory box histidine kinase  35.77 
 
 
363 aa  212  1e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.27324  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2787  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.79 
 
 
365 aa  210  5e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220649  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.23 
 
 
819 aa  207  6e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000597485  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02146  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with AtoC  31.88 
 
 
608 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1439  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.88 
 
 
608 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.36941  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1431  sensory histidine kinase AtoS  31.88 
 
 
608 aa  202  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.250093  hitchhiker  0.00150562 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2360  sensory histidine kinase AtoS  31.88 
 
 
608 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00013069  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02105  hypothetical protein  31.88 
 
 
608 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2898  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.53 
 
 
849 aa  201  3e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16474e-17 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2368  sensory histidine kinase AtoS  31.88 
 
 
608 aa  201  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0221711  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1718  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
470 aa  201  3.9999999999999996e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0915  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  35.71 
 
 
362 aa  199  9e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.115848  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.25 
 
 
503 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.534636  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0515  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.07 
 
 
533 aa  199  1.0000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1139  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.45 
 
 
578 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3017  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.84 
 
 
864 aa  195  2e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3078  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.4 
 
 
369 aa  193  7e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1993  two component sensor histidine kinase  33.61 
 
 
366 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1934  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.57 
 
 
1015 aa  191  4e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.452261  normal  0.114848 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1781  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.89 
 
 
430 aa  191  4e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2562  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.52 
 
 
363 aa  190  5.999999999999999e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117213 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0426  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.06 
 
 
598 aa  190  8e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.830485  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1404  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.7 
 
 
361 aa  190  8e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000236023 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0172  sensory histidine kinase AtoS  30.68 
 
 
621 aa  189  1e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.557198  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2806  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.15 
 
 
361 aa  186  7e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3741  putative PAS/PAC sensor protein  27.33 
 
 
1268 aa  182  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1227  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.08 
 
 
1229 aa  180  5.999999999999999e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0339  histidine kinase  41.28 
 
 
408 aa  179  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3714  PAS  27.54 
 
 
1028 aa  179  1e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.101634 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0828  sensory histidine kinase AtoS  32.04 
 
 
613 aa  179  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.167481 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2411  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.43 
 
 
497 aa  179  1e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0531  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.85 
 
 
1193 aa  179  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4912  sporulation kinase  40.43 
 
 
408 aa  178  3e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0406  sporulation kinase  40.43 
 
 
408 aa  177  5e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1745  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  34.23 
 
 
424 aa  177  6e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.62 
 
 
634 aa  177  7e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.125308  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3132  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.86 
 
 
743 aa  176  8e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.583735  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.74 
 
 
630 aa  176  8e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.21488  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2148  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.01 
 
 
770 aa  176  9.999999999999999e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0675  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.45 
 
 
855 aa  175  1.9999999999999998e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0916  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.78 
 
 
599 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000947728  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1904  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.69 
 
 
651 aa  174  3.9999999999999995e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326262  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0531  sensory histidine kinase AtoS  34.87 
 
 
611 aa  174  3.9999999999999995e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4776  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.2 
 
 
1086 aa  174  5e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.108623  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0692  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 
620 aa  173  6.999999999999999e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.7 
 
 
1326 aa  173  7.999999999999999e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1384  sensory histidine kinase AtoS  29.97 
 
 
617 aa  172  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2812  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.07 
 
 
495 aa  170  8e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2455  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.47 
 
 
430 aa  169  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0127  sensory box sensor histidine kinase  29.29 
 
 
1061 aa  168  2e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03428  PAS signal transduction protein  27.14 
 
 
962 aa  168  2e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0857  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.86 
 
 
698 aa  168  2e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0897898 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_134  sensor histidine kinase  28.23 
 
 
1062 aa  168  2.9999999999999998e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0448  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.08 
 
 
519 aa  167  4e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4259  PAS sensor protein  29.92 
 
 
1086 aa  167  4e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.127746 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4625  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.92 
 
 
1092 aa  167  4e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2511  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.64 
 
 
543 aa  167  4e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4058  sporulation kinase B  39.74 
 
 
424 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4025  sporulation kinase B  39.74 
 
 
424 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3916  sporulation kinase B  39.74 
 
 
424 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.651909  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3748  sporulation kinase B  39.74 
 
 
424 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2808  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.86 
 
 
595 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.277541  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3764  sporulation kinase B  39.74 
 
 
424 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.320466  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4223  sporulation kinase B  39.74 
 
 
424 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3277  ATP-binding region, ATPase-like  27.66 
 
 
812 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.438196  hitchhiker  0.00707292 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0659  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.93 
 
 
525 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1127  sporulation kinase B  39.74 
 
 
424 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.918455 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>