More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3315 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU3315  major facilitator family transporter  100 
 
 
414 aa  802  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0257  major facilitator transporter  52.43 
 
 
417 aa  417  1e-115  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.72366 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0271  major facilitator transporter  52.54 
 
 
418 aa  410  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0097  major facilitator superfamily MFS_1  50.13 
 
 
415 aa  349  7e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0178467  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0079  major facilitator superfamily MFS_1  50 
 
 
425 aa  348  9e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28688e-24 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0056  major facilitator superfamily MFS_1  49.63 
 
 
411 aa  346  6e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0835  major facilitator transporter  34.52 
 
 
434 aa  243  3e-63  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.65824  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0080  major facilitator transporter  34.36 
 
 
434 aa  242  8e-63  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.163505  hitchhiker  0.00273826 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3925  major facilitator transporter  31.88 
 
 
445 aa  217  3e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.362735 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3001  major facilitator transporter  35.27 
 
 
432 aa  211  2e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2751  major facilitator transporter  37.25 
 
 
407 aa  188  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1139  major facilitator superfamily MFS_1  35.62 
 
 
395 aa  178  1e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.388877  normal  0.0189112 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1989  major facilitator transporter  35.03 
 
 
418 aa  177  4e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1836  major facilitator transporter  35.16 
 
 
412 aa  172  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2516  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 
446 aa  172  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.64401e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2425  major facilitator transporter  34.64 
 
 
427 aa  170  5e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410851  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1599  major facilitator transporter  31.28 
 
 
428 aa  168  1e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0862698 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2103  hypothetical protein  33.07 
 
 
420 aa  166  7e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.36255  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1898  major facilitator transporter  32.9 
 
 
420 aa  165  2e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0191579  normal  0.0647727 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2317  major facilitator superfamily MFS_1  33.09 
 
 
392 aa  163  4e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.85922 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1892  major facilitator superfamily MFS_1  35.64 
 
 
431 aa  163  5e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2603  major facilitator superfamily MFS_1  30.55 
 
 
437 aa  163  5e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3345  major facilitator transporter  31.59 
 
 
417 aa  160  3e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.231985 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0101  major facilitator transporter  33 
 
 
434 aa  159  6e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.467477  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1290  major facilitator superfamily MFS_1  29.35 
 
 
441 aa  157  3e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3355  hypothetical protein  33.42 
 
 
420 aa  155  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40936  normal  0.967492 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0035  major facilitator transporter  30.05 
 
 
405 aa  153  5e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.55843 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2630  major facilitator transporter  31.74 
 
 
425 aa  153  6e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0203  major facilitator transporter  30.65 
 
 
432 aa  146  5e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1288  hypothetical protein  26.9 
 
 
432 aa  144  2e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1289  hypothetical protein  26.9 
 
 
432 aa  144  3e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0661  major facilitator transporter  30.41 
 
 
418 aa  143  5e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1524  major facilitator transporter  30.81 
 
 
434 aa  140  3e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.472365  normal  0.129065 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0680  major facilitator family transporter  28.3 
 
 
443 aa  135  1e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2768  major facilitator superfamily MFS_1  27.17 
 
 
421 aa  134  2e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.17695  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1497  transporter, MFS superfamily  28.03 
 
 
443 aa  134  3e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41790  carbohydrate transport membrane protein  29.43 
 
 
415 aa  133  5e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0688  hypothetical protein  26.48 
 
 
430 aa  133  5e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0706  hypothetical protein  26.48 
 
 
430 aa  132  9e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0383  major facilitator superfamily MFS_1  27.14 
 
 
439 aa  128  2e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.53779e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1860  hypothetical protein  28.11 
 
 
426 aa  127  3e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1855  hypothetical protein  28.8 
 
 
426 aa  127  3e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1756  major facilitator transporter  33.08 
 
 
407 aa  127  4e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0117  major facilitator transporter  29.35 
 
 
389 aa  127  4e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1068  major facilitator superfamily MFS_1  30.36 
 
 
420 aa  126  8e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.27901  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1147  major facilitator superfamily transporter  30.36 
 
 
420 aa  125  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.428295  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1496  hypothetical protein  35.27 
 
 
461 aa  125  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.000950555  normal  0.877787 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4899  major facilitator superfamily MFS_1  29.45 
 
 
415 aa  123  7e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2869  major facilitator superfamily MFS_1  27.84 
 
 
413 aa  122  1e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000467547  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1279  major facilitator superfamily transporter  29.79 
 
 
493 aa  121  2e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1564  transporter, MFS superfamily  27 
 
 
426 aa  121  3e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1355  hypothetical protein  26.25 
 
 
430 aa  120  6e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1359  hypothetical protein  26.63 
 
 
430 aa  119  8e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1255  major facilitator transporter  27.85 
 
 
413 aa  118  2e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0230086  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0294  major facilitator superfamily transporter  29.87 
 
 
412 aa  118  2e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000111052 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0289  major facilitator superfamily MFS_1  29.6 
 
 
412 aa  118  2e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0691  hypothetical protein  26.96 
 
 
423 aa  118  2e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2665  major facilitator superfamily MFS_1  26.02 
 
 
421 aa  117  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.6609  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0296  major facilitator transporter  28.86 
 
 
431 aa  117  5e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0674  hypothetical protein  26.47 
 
 
423 aa  117  5e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1373  major facilitator transporter  30 
 
 
390 aa  116  9e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.421856  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5821  major facilitator superfamily permease  30.64 
 
 
432 aa  115  2e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.836569  normal  0.302155 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0591  major facilitator family tranporter  30.33 
 
 
412 aa  114  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0113  major facilitator superfamily transporter  29.94 
 
 
407 aa  114  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.378923 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0560  major facilitator family transporter  30.33 
 
 
412 aa  114  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1277  major facilitator family transporter  30.33 
 
 
412 aa  114  3e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.552414  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1500  major facilitator family transporter  30.33 
 
 
430 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.154972  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1470  major facilitator family transporter  30.33 
 
 
412 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0767  major facilitator family tranporter  30.33 
 
 
430 aa  114  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1604  major facilitator family tranporter  30.33 
 
 
412 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5829  major facilitator superfamily MFS_1  29.6 
 
 
439 aa  114  4e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.50819  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0130  major facilitator superfamily MFS_1  30.42 
 
 
407 aa  114  5e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.879042  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0604  hypothetical protein  27.23 
 
 
422 aa  113  5e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1152  transporter, MFS superfamily  30.93 
 
 
437 aa  113  6e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.309541  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2786  major facilitator family tranporter  30.33 
 
 
412 aa  112  9e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  4.99606e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0872  major facilitator transporter  28.65 
 
 
414 aa  112  1e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104086  normal  0.268886 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6743  major facilitator superfamily MFS_1  33.61 
 
 
413 aa  112  1e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.15445  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04611  multidrug ABC transporter  27.55 
 
 
451 aa  112  1e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0585  hypothetical protein  26.97 
 
 
427 aa  112  1e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0031  major facilitator transporter  29.1 
 
 
390 aa  111  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1022  intraphagosomal amino acid transporter (Pht) family protein  30.24 
 
 
437 aa  110  4e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0236  major facilitator superfamily transporter  29.44 
 
 
423 aa  109  8e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.394936 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0529  transporter, MFS superfamily  27.49 
 
 
428 aa  109  1e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.027512  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1663  major facilitator family transporter  27.23 
 
 
428 aa  108  3e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.106817  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1260  major facilitator transporter  30 
 
 
405 aa  107  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00393517  normal  0.0788656 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0041  major facilitator transporter  30.03 
 
 
390 aa  106  7e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0480  major facilitator superfamily MFS_1  33.47 
 
 
395 aa  106  7e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3664  major facilitator transporter  25.27 
 
 
437 aa  106  8e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.596983 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5613  major facilitator protein family permease  33.46 
 
 
432 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1311  major facilitator family transporter  23.7 
 
 
443 aa  105  1e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00377695  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2772  major facilitator transporter  30.75 
 
 
397 aa  104  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1166  major facilitator transporter  29.26 
 
 
410 aa  103  7e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.117427  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1178  major facilitator transporter  30.03 
 
 
410 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0817029  normal  0.188851 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0808  major facilitator transporter  29.34 
 
 
405 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000152405  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1289  major facilitator transporter  29.34 
 
 
405 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000170185  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1897  major facilitator transporter  30.35 
 
 
416 aa  101  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0473254  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2159  transporter, MFS superfamily  23.73 
 
 
452 aa  100  5e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0019  major facilitator family transporter  23.73 
 
 
452 aa  100  5e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4431  major facilitator transporter  28.79 
 
 
405 aa  100  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  4.64132e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2905  putative transmembrane transport protein  31.23 
 
 
430 aa  99.8  7e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>