58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2359 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2359  hypothetical protein  100 
 
 		 794 aa  1631    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.780918  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0038  glycoside hydrolase family 57  46.5 
 
 		 807 aa  721    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0114  glycoside hydrolase family 57  52.6 
 
 		 814 aa  840    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0789579 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2093  glycoside hydrolase family 57  51.33 
 
 		 812 aa  829    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0133  glycoside hydrolase family 57  52.47 
 
 		 814 aa  849    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0849  glycoside hydrolase family protein  50.64 
 
 		 813 aa  795    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0812  glycoside hydrolase family protein  51.17 
 
 		 811 aa  781    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0121928 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4460  glycoside hydrolase family protein  51.54 
 
 		 811 aa  789    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0202939 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3268  glycoside hydrolase family protein  59.64 
 
 		 817 aa  957    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2350  glycoside hydrolase family protein  50.26 
 
 		 807 aa  793    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4705  glycoside hydrolase family protein  53.74 
 
 		 820 aa  831    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0553  glycoside hydrolase family protein  41.1 
 
 		 850 aa  637    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.330945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1810  glycoside hydrolase family protein  52.75 
 
 		 811 aa  847    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1766  glycoside hydrolase family protein  45.95 
 
 		 823 aa  618  1e-175  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0138478  normal  0.386412 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0021  glycoside hydrolase family protein  40.84 
 
 		 786 aa  611  1e-173  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1916  glycoside hydrolase family 57  44.36 
 
 		 812 aa  596  1e-169  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.900625  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2048  glycoside hydrolase family protein  43.96 
 
 		 816 aa  590  1e-167  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.686637  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1831  glycoside hydrolase family 57  43.96 
 
 		 812 aa  590  1e-167  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.699985  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1884  glycoside hydrolase family 57  45.1 
 
 		 900 aa  581  1e-164  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0696  glycoside hydrolase family 57  43.14 
 
 		 862 aa  555  1e-156  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.602449 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1264  glycoside hydrolase family protein  42.91 
 
 		 791 aa  550  1e-155  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4559  glycoside hydrolase family protein  41.09 
 
 		 907 aa  544  1e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1295  glycoside hydrolase family protein  41.14 
 
 		 871 aa  535  1e-151  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0701988  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2438  family 57 glycoside hydrolase  41.6 
 
 		 902 aa  528  1e-148  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.178015  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0544  glycoside hydrolase family 57  38.05 
 
 		 790 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3241  glycoside hydrolase family 57  47.24 
 
 		 709 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2603  hypothetical protein  46.07 
 
 		 771 aa  394  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.106323  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0769  glycoside hydrolase family protein  46.11 
 
 		 779 aa  390  1e-107  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.276229  normal  0.208351 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0935  glycoside hydrolase family 57  45.66 
 
 		 821 aa  387  1e-106  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2765  glycoside hydrolase family 57  31.23 
 
 		 766 aa  357  3.9999999999999996e-97  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000129952  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0112  glycoside hydrolase family 57  38.12 
 
 		 682 aa  295  3e-78  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0904172  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0199  glycoside hydrolase family protein  38.3 
 
 		 485 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.400833 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0672  glycoside hydrolase family protein  38.52 
 
 		 485 aa  244  6e-63  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.565437 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1236  glycoside hydrolase family protein  38.11 
 
 		 472 aa  235  3e-60  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0183  glycoside hydrolase family protein  37.56 
 
 		 471 aa  232  2e-59  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00355516  normal  0.949853 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0210  glycoside hydrolase family protein  26.42 
 
 		 609 aa  79.7  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.044129  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0803  glycoside hydrolase family protein  22.22 
 
 		 1162 aa  70.9  0.00000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2244  4-alpha-glucanotransferase  26.34 
 
 		 706 aa  57.4  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4047  glycoside hydrolase family 57  25.37 
 
 		 747 aa  55.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.422577 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2072  glycoside hydrolase, family 57  24.45 
 
 		 577 aa  54.7  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0138  glycoside hydrolase family 57  28.96 
 
 		 726 aa  52.4  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.806114  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0135  glycoside hydrolase family protein  31.06 
 
 		 722 aa  52.8  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000920685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0149  glycoside hydrolase family 57  28.96 
 
 		 726 aa  51.6  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00221085  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0131  glycoside hydrolase family protein  26.39 
 
 		 726 aa  50.8  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0840945  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3464  glycoside hydrolase family 57  27.38 
 
 		 728 aa  50.4  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0856  glycoside hydrolase family protein  31.41 
 
 		 732 aa  48.9  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0960  glycoside hydrolase family protein  26.6 
 
 		 584 aa  47.8  0.0008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285068 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0719  glycoside hydrolase family protein  26.84 
 
 		 566 aa  47.8  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3401  glycoside hydrolase family 57  25.52 
 
 		 728 aa  47  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0734  glycoside hydrolase family protein  27.03 
 
 		 1022 aa  45.8  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.983175  normal  0.257164 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1369  glycoside hydrolase family protein  24.5 
 
 		 582 aa  45.4  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0509  glycoside hydrolase family protein  22.5 
 
 		 575 aa  45.1  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0675  glycoside hydrolase family 57  18.72 
 
 		 1042 aa  45.1  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0896  4-alpha-glucanotransferase  26.42 
 
 		 686 aa  45.1  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.252136  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0985  glycoside hydrolase family protein  24.12 
 
 		 994 aa  45.1  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.369995  normal  0.376092 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2138  glycoside hydrolase family 57  21.83 
 
 		 902 aa  44.7  0.008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.205932  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2965  glycoside hydrolase family 57  24.38 
 
 		 749 aa  44.3  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.993077  normal  0.662325 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3153  glycoside hydrolase family 57  24.38 
 
 		 749 aa  44.3  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>