More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6383 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_6383  cytochrome P450-like protein  100 
 
 
379 aa  734    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.158835  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2495  cytochrome P450  57.92 
 
 
464 aa  224  2e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.209676  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0433  cytochrome P450  47.62 
 
 
447 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0443  cytochrome P450  47.62 
 
 
447 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0122986 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0420  cytochrome P450  47.62 
 
 
447 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0288  cytochrome P450  47.22 
 
 
444 aa  206  7e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.0000866708  normal  0.107645 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0600  cytochrome P450  46.03 
 
 
443 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.441621  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11908  cytochrome P450 140 cyp140  46.98 
 
 
438 aa  195  1e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.818643 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4666  cytochrome P450  51.28 
 
 
450 aa  193  4e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3652  cytochrome P450  39.74 
 
 
431 aa  149  6e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  46.15 
 
 
402 aa  149  7e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5525  cytochrome P450  40.52 
 
 
435 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  45.13 
 
 
401 aa  147  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6078  cytochrome P450  45.74 
 
 
414 aa  145  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  37.75 
 
 
410 aa  144  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  39.44 
 
 
426 aa  143  4e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1229  cytochrome P450  44.5 
 
 
405 aa  140  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  41.59 
 
 
405 aa  140  3.9999999999999997e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3964  cytochrome P450  44.27 
 
 
423 aa  139  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403344  normal  0.433493 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1930  cytochrome P450  44.34 
 
 
429 aa  137  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.708059 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1901  cytochrome P450  42.55 
 
 
411 aa  137  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.908058  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  44.08 
 
 
402 aa  137  4e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  35.02 
 
 
420 aa  135  9e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5579  cytochrome P450  42.5 
 
 
419 aa  135  9e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  44.02 
 
 
399 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  41.38 
 
 
407 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  41.38 
 
 
407 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  41.38 
 
 
407 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  41.04 
 
 
398 aa  133  5e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8494  cytochrome P450  40.21 
 
 
409 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.880445 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  33.61 
 
 
411 aa  130  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1451  cytochrome P450  39.01 
 
 
405 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.729337 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  43.32 
 
 
412 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  34.07 
 
 
411 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4481  cytochrome P450  41.88 
 
 
411 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0557214  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2217  cytochrome P450  40.43 
 
 
417 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000207738  decreased coverage  0.000000904548 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2115  cytochrome P450  43.17 
 
 
430 aa  128  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  39.13 
 
 
410 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8837  cytochrome P450 family protein  41.62 
 
 
418 aa  127  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0842422 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  38.19 
 
 
417 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  35.79 
 
 
411 aa  125  9e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  35.79 
 
 
411 aa  125  9e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  35.79 
 
 
411 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  33.63 
 
 
411 aa  125  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  35.79 
 
 
411 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4000  cytochrome P450  41.62 
 
 
412 aa  125  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  0.53904 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  34.43 
 
 
411 aa  125  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  33.63 
 
 
411 aa  125  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4369  cytochrome P450  40.84 
 
 
412 aa  124  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  40.43 
 
 
394 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  34.58 
 
 
411 aa  124  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20970  cytochrome P450  40.1 
 
 
418 aa  123  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210976  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1245  cytochrome P450  37.71 
 
 
414 aa  123  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  35.26 
 
 
411 aa  123  5e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  43.98 
 
 
411 aa  122  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  42.13 
 
 
400 aa  123  7e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1608  cytochrome P450  42.13 
 
 
416 aa  122  8e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.894041  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0077  cytochrome P450  41.23 
 
 
410 aa  122  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  36.04 
 
 
411 aa  122  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  37.8 
 
 
412 aa  120  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  37.95 
 
 
402 aa  121  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  41.46 
 
 
412 aa  120  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3880  cytochrome P450  41.18 
 
 
413 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123005  normal  0.0220713 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  41.58 
 
 
419 aa  119  6e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  40.67 
 
 
423 aa  119  7e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  41.97 
 
 
408 aa  119  7.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2064  cytochrome P450  38.89 
 
 
408 aa  118  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.680222 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6987  putative cytochrome P450  39.9 
 
 
409 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0660812 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1856  cytochrome P450  37.91 
 
 
417 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654752  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0804  cytochrome P450  38.1 
 
 
407 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1336  cytochrome P450  34.86 
 
 
414 aa  117  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.204499  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  33.47 
 
 
398 aa  116  5e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0642  cytochrome P450  38.76 
 
 
410 aa  116  5e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0366485 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  36.14 
 
 
388 aa  116  6.9999999999999995e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1860  cytochrome P450  41.18 
 
 
459 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3938  cytochrome P450  34.3 
 
 
417 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0168475 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1189  cytochrome P450  39.69 
 
 
404 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351372  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3600  cytochrome P450  41.3 
 
 
402 aa  114  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.633631  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2531  cytochrome P450  37.11 
 
 
408 aa  114  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1816  cytochrome P450  34.3 
 
 
415 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.393276  normal  0.302822 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1694  cytochrome P450 hydroxylase  35.43 
 
 
414 aa  114  4.0000000000000004e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.103657  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0674  cytochrome P450  39.19 
 
 
421 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.544663  normal  0.200583 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2330  putative cytochrome P450 hydroxylase(monooxygenase)  37.36 
 
 
417 aa  113  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.998685  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1426  cytochrome P450  40.1 
 
 
414 aa  113  6e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1946  cytochrome P450 hydroxylase  35.8 
 
 
393 aa  113  6e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5447  cytochrome P450  36.9 
 
 
399 aa  113  6e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154914  normal  0.0468411 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  41.27 
 
 
392 aa  113  6e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6190  cytochrome P450  40 
 
 
406 aa  112  8.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4299  cytochrome P450  39.18 
 
 
406 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.657054  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4599  cytochrome P450  39.78 
 
 
417 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.995024  normal  0.135664 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4939  cytochrome P450  38.86 
 
 
404 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4384  cytochrome P450  38.46 
 
 
400 aa  112  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0518  cytochrome P450  42.33 
 
 
406 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1521  cytochrome P450  38.67 
 
 
407 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0530  cytochrome P450  42.33 
 
 
406 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1544  cytochrome P450  38.67 
 
 
407 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2844  putative cytochrome P450  35.86 
 
 
409 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.681869  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0597  cytochrome P450  35.23 
 
 
393 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.16463  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0508  cytochrome P450  42.33 
 
 
406 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.642311  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0869  cytochrome P450  32.96 
 
 
415 aa  110  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.610072  normal  0.98941 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>