More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4522 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_4522  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
329 aa  635    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2962  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.52 
 
 
280 aa  205  7e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0794658  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3278  ABC transporter related protein  41.63 
 
 
257 aa  181  2e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000407876  normal  0.0335836 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3330  ABC transporter membrane spanning protein  35.71 
 
 
295 aa  177  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.730487  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4149  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.64 
 
 
276 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4037  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.64 
 
 
276 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.960786  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3514  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.76 
 
 
295 aa  171  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.739127  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4882  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.74 
 
 
259 aa  171  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.947992  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5341  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.07 
 
 
293 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.7364 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5061  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.71 
 
 
293 aa  170  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.877762  normal  0.739003 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1531  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.83 
 
 
295 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0957  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.91 
 
 
274 aa  164  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.199065  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3923  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.94 
 
 
289 aa  163  5.0000000000000005e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.276752  normal  0.204471 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5602  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.46 
 
 
302 aa  161  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.033554  normal  0.953446 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1200  transmembrane permease ABC transporter protein  37.08 
 
 
263 aa  160  4e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.441856  normal  0.826922 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1056  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.23 
 
 
266 aa  159  6e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.498595  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6067  ABC transporter permease  37.66 
 
 
261 aa  159  8e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3961  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.14 
 
 
287 aa  158  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0493  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  37.5 
 
 
287 aa  158  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114665  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3590  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.11 
 
 
262 aa  158  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1306  ABC transporter, permease component  36.21 
 
 
286 aa  157  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.334764  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.74 
 
 
263 aa  157  3e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4033  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
287 aa  157  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.753159  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2274  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.67 
 
 
279 aa  157  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2336  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.71 
 
 
277 aa  157  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.544063  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1136  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.74 
 
 
263 aa  157  3e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.629035  normal  0.968824 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2678  ABC transporter, permease protein  39.84 
 
 
285 aa  156  4e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0253  ABC transporter, permease protein  39.84 
 
 
282 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.735185  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1432  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.77 
 
 
260 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324199  normal  0.863766 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3274  ABC transporter, permease protein  39.84 
 
 
282 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1853  ABC transporter, permease protein  39.84 
 
 
282 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.989072  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0040  ABC transporter, permease protein  39.84 
 
 
282 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0040  ABC transporter, permease protein  39.84 
 
 
282 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.522623  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2699  ABC transporter, permease protein  39.84 
 
 
282 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2355  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  34.07 
 
 
274 aa  155  7e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.214574  normal  0.0382396 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0261  ABC transporter, permease protein  34.57 
 
 
263 aa  155  8e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.597346  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0038  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.44 
 
 
285 aa  155  8e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.090458  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0032  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.44 
 
 
285 aa  155  8e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3216  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, inner membrane subunit  39.84 
 
 
285 aa  155  9e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.44 
 
 
282 aa  155  9e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0037  ABC transporter, permease protein  38.55 
 
 
259 aa  155  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2120  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.78 
 
 
263 aa  154  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0243564  normal  0.0474626 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.02 
 
 
264 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.440017  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0034  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.44 
 
 
285 aa  154  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2103  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.39 
 
 
263 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.153016  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0950  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.97 
 
 
283 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.616045  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0024  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.44 
 
 
285 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0033  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.44 
 
 
282 aa  153  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.589022  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0285  ABC transporter, permease protein  33.83 
 
 
263 aa  152  5.9999999999999996e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1832  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.65 
 
 
274 aa  152  8e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.146122 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2561  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.74 
 
 
279 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2107  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.58 
 
 
265 aa  150  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.970819 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3212  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.1 
 
 
271 aa  150  4e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.896165  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2524  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.36 
 
 
279 aa  149  5e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.667278  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.36 
 
 
279 aa  149  5e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.568124  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2746  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.22 
 
 
283 aa  146  6e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3334  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.39 
 
 
265 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.227064  normal  0.190195 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.36 
 
 
294 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0684117  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1998  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.19 
 
 
283 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.894639  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2621  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.97 
 
 
281 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000218671  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3758  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.59 
 
 
256 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5801  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.71 
 
 
290 aa  136  5e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2256  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.84 
 
 
268 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0814  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.39 
 
 
270 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.08 
 
 
253 aa  132  6e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0231  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.47 
 
 
271 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0797  ABC transporter, permease protein, putative  31.54 
 
 
250 aa  130  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2919  putative sulfonate ABC transporter, permease protein  32.35 
 
 
282 aa  130  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.35916e-18 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.58 
 
 
280 aa  130  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.615395  normal  0.42897 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0881  putative ABC transporter, permease protein  31.15 
 
 
251 aa  129  6e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00328051  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3131  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.92 
 
 
281 aa  129  8.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2959  sulfonate ABC transporter, permease protein, putative  32.59 
 
 
284 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.132224  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4547  putative ABC transporter, permease protein  31.15 
 
 
251 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.113137  normal  0.441246 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.15 
 
 
251 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0620  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 
254 aa  128  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.63161  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2712  sulfonate ABC transporter permease  34.91 
 
 
282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2920  sulfonate ABC transporter permease protein  34.91 
 
 
282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1169  putative ABC transporter permease protein  35.36 
 
 
279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0637  ABC transporter, permease  30.77 
 
 
250 aa  127  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0804  putative ABC transporter, permease protein  30.77 
 
 
250 aa  127  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22036e-46 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3099  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.29 
 
 
261 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0693  ABC transporter permease  30.77 
 
 
250 aa  126  5e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0637  ABC transporter, permease  30.77 
 
 
250 aa  126  5e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00537874  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0727  ABC transporter permease  30.77 
 
 
250 aa  126  5e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0363276  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1862  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.55 
 
 
257 aa  126  5e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116723  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0784  putative ABC transporter, permease protein  30 
 
 
250 aa  125  7e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.605831  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.8 
 
 
273 aa  125  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2985  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.09 
 
 
273 aa  125  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.85 
 
 
273 aa  124  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2777  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.27 
 
 
292 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1261  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.85 
 
 
273 aa  124  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.306936 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1221  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.78 
 
 
246 aa  124  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13670  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  29.8 
 
 
249 aa  123  4e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0614  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.86 
 
 
250 aa  123  5e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2663  alkanesulfonates transport system permease; sulfonate ABC transporter, permease  34.55 
 
 
282 aa  122  6e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2640  alkanesulfonates transport system permease; sulfonate ABC transporter, permease  34.55 
 
 
282 aa  122  7e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0770  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.82 
 
 
273 aa  122  7e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4580  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.74 
 
 
257 aa  122  8e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1834  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.8 
 
 
268 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.101401  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.56 
 
 
274 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>