297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2978 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_3728  amidohydrolase  80.15 
 
 
417 aa  657  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3368  amidohydrolase  86.89 
 
 
414 aa  738  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.929128  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2466  amidohydrolase  80.84 
 
 
424 aa  650  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.357249  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1408  amidohydrolase  78.75 
 
 
402 aa  638  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.321357  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3788  amidohydrolase  80.15 
 
 
417 aa  657  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.463322  normal  0.142834 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2978  amidohydrolase  100 
 
 
429 aa  860  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3715  amidohydrolase  80.15 
 
 
417 aa  657  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355417  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4188  amidohydrolase  82.11 
 
 
421 aa  655  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3308  amidohydrolase  74.82 
 
 
419 aa  614  1e-175  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692035  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  56.73 
 
 
412 aa  459  1e-128  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4292  amidohydrolase  59.75 
 
 
402 aa  455  1e-127  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2437  amidohydrolase  57.7 
 
 
411 aa  454  1e-126  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3749  amidohydrolase  56.66 
 
 
408 aa  451  1e-125  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3761  amidohydrolase  56.66 
 
 
408 aa  451  1e-125  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225154  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3822  amidohydrolase  56.66 
 
 
408 aa  451  1e-125  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4855  amidohydrolase  54.93 
 
 
403 aa  427  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.165345  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3237  amidohydrolase  54.17 
 
 
404 aa  420  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136124  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  40.1 
 
 
426 aa  280  3e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1967  amidohydrolase  41.03 
 
 
405 aa  267  2e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  40 
 
 
445 aa  261  2e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  39.57 
 
 
430 aa  257  2e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2093  amidohydrolase  38.89 
 
 
431 aa  256  5e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.885062  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  40.28 
 
 
444 aa  253  6e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  39.76 
 
 
430 aa  250  3e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  37.56 
 
 
426 aa  247  4e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  38.69 
 
 
440 aa  244  3e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  37.29 
 
 
426 aa  243  3e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2368  amidohydrolase  38.55 
 
 
441 aa  242  1e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  36.1 
 
 
431 aa  239  9e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  38.98 
 
 
438 aa  228  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  37.71 
 
 
459 aa  222  9e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2377  amidohydrolase  36.47 
 
 
421 aa  222  1e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.134161  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  35.44 
 
 
423 aa  221  2e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  37.24 
 
 
433 aa  220  4e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  36.1 
 
 
455 aa  218  2e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  37.44 
 
 
432 aa  216  5e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0935  amidohydrolase  36.78 
 
 
428 aa  207  3e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.755972  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  35.43 
 
 
444 aa  206  7e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  36.27 
 
 
433 aa  202  7e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1413  amidohydrolase  38.89 
 
 
423 aa  201  1e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1238  amidohydrolase  39.29 
 
 
444 aa  201  2e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0871897  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  33.81 
 
 
434 aa  200  5e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  36.1 
 
 
437 aa  199  7e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  35.98 
 
 
433 aa  199  7e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2115  amidohydrolase  37.77 
 
 
426 aa  199  1e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1867  amidohydrolase  37.32 
 
 
480 aa  190  4e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.445197  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0432  amidohydrolase  35.03 
 
 
421 aa  190  5e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2823  amidohydrolase  34.94 
 
 
422 aa  187  2e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.750141  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3036  amidohydrolase  33.33 
 
 
407 aa  185  2e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2318  amidohydrolase  32.77 
 
 
428 aa  183  6e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  33.24 
 
 
407 aa  182  1e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2801  prolidase, putative  34.89 
 
 
419 aa  176  9e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00617614  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2932  amidohydrolase  32.55 
 
 
431 aa  175  1e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  32.03 
 
 
407 aa  174  3e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4565  amidohydrolase  34.72 
 
 
423 aa  173  4e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.244661  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2529  amidohydrolase  34.98 
 
 
419 aa  174  4e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.403539  normal  0.929586 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5037  amidohydrolase  32.77 
 
 
432 aa  171  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3137  amidohydrolase  32.46 
 
 
411 aa  170  3e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3973  amidohydrolase  31.43 
 
 
409 aa  170  4e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  33.01 
 
 
407 aa  169  1e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  30.08 
 
 
413 aa  168  2e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1893  amidohydrolase  34.53 
 
 
409 aa  167  3e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.342109 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1037  amidohydrolase  32.17 
 
 
405 aa  167  3e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1913  amidohydrolase  34.53 
 
 
409 aa  167  4e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.406706  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1959  amidohydrolase  34.53 
 
 
409 aa  167  4e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4304  amidohydrolase  33 
 
 
470 aa  166  6e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0436  amidohydrolase  35.45 
 
 
417 aa  166  1e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1130  amidohydrolase  32.49 
 
 
425 aa  165  2e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.474819 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2515  amidohydrolase  34.38 
 
 
426 aa  164  2e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0890  amidohydrolase  33.89 
 
 
412 aa  164  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.559583  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2354  amidohydrolase  32.54 
 
 
420 aa  164  4e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2609  amidohydrolase  33.41 
 
 
396 aa  163  5e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2450  amidohydrolase  29.72 
 
 
478 aa  160  6e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2221  hypothetical protein  28.14 
 
 
412 aa  159  7e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1219  amidohydrolase  32.36 
 
 
390 aa  157  3e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.82253  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2193  hypothetical protein  27.17 
 
 
412 aa  157  3e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0761  hypothetical protein  31.18 
 
 
461 aa  156  6e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4994  amidohydrolase  32.67 
 
 
413 aa  155  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.939807 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3741  amidohydrolase  31.68 
 
 
413 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3782  amidohydrolase  31.68 
 
 
413 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0062486  decreased coverage  0.00131434 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3028  putative prolidase (Xaa-Pro dipeptidase)  32.41 
 
 
436 aa  154  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0496396  normal  0.0296694 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1420  putative prolidase  31.74 
 
 
411 aa  153  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0151921  normal  0.142512 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4503  amidohydrolase  30.1 
 
 
408 aa  153  7e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0479  amidohydrolase  28.74 
 
 
401 aa  152  8e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2089  amidohydrolase  30.7 
 
 
416 aa  152  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608536  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5427  amidohydrolase  28.23 
 
 
432 aa  151  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0808338 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2208  amidohydrolase  30.89 
 
 
440 aa  150  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00166067 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2646  amidohydrolase  33.17 
 
 
391 aa  150  4e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3588  amidohydrolase  29.84 
 
 
482 aa  149  7e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01184  conserved hypothetical protein  29.31 
 
 
445 aa  149  8e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0159  amidohydrolase  32.03 
 
 
415 aa  147  3e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2826  amidohydrolase  33.95 
 
 
461 aa  147  4e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00342984  normal  0.0235152 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5232  amidohydrolase  31.09 
 
 
434 aa  147  4e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2139  amidohydrolase  36.39 
 
 
408 aa  146  5e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.018924 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21530  amidohydrolase, imidazolonepropionase  31.26 
 
 
447 aa  146  6e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4125  amidohydrolase  32.16 
 
 
409 aa  146  8e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0420  amidohydrolase  30.33 
 
 
418 aa  145  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0983  amidohydrolase  32.21 
 
 
445 aa  145  1e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1727  amidohydrolase  29.86 
 
 
486 aa  145  1e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4676  amidohydrolase  32.42 
 
 
414 aa  145  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0192807  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>