76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2634 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2634  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  100 
 
 		 227 aa  449  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2843  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  66.18 
 
 		 356 aa  242  3.9999999999999997e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.65443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1833  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  63.59 
 
 		 234 aa  238  5e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2536  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  44.74 
 
 		 199 aa  119  3e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2379  putative serine/threonine kinaseanti-sigma factor  37.81 
 
 		 197 aa  99.8  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.084958 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0892  hypothetical protein  39.79 
 
 		 195 aa  98.2  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0400  putative signal transduction histidine kinase  36.79 
 
 		 203 aa  87  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1327  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  38.74 
 
 		 211 aa  82  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1779  putative signal transduction histidine kinase  35.05 
 
 		 214 aa  79  0.00000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.144417 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2700  putative signal transduction histidine kinase  33.68 
 
 		 207 aa  76.6  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.738661  normal  0.546363 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0034  hypothetical protein  36.32 
 
 		 236 aa  74.7  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0164  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  40.3 
 
 		 174 aa  74.3  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2892  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  32.37 
 
 		 202 aa  71.2  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.679484 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2744  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.18 
 
 		 155 aa  69.7  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.813583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3110  putative PAS/PAC sensor protein  40 
 
 		 697 aa  68.6  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.63551  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1263  response regulator receiver  39.06 
 
 		 282 aa  68.2  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0593741  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0918  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  36.11 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.283269  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0519  putative signal transduction histidine kinase  36.69 
 
 		 165 aa  62.8  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4098  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.1 
 
 		 1045 aa  62  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.108116 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1739  PAS/protein phosphatase 2C-like  35.51 
 
 		 817 aa  61.6  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7300  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  34.62 
 
 		 573 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7826  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  38.1 
 
 		 152 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0743  putative PAS/PAC sensor protein  36.3 
 
 		 855 aa  59.3  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2480  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.78 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.252056 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1752  protein phosphatase 2C-like  33.33 
 
 		 591 aa  58.2  0.00000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8367  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.78 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8758  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.75 
 
 		 192 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  39.86 
 
 		 616 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.697266  normal  0.4865 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5629  putative signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 		 167 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.56187 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4163  putative PAS/PAC sensor protein  37.01 
 
 		 1039 aa  56.2  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0226672 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0489  putative signal transduction histidine kinase  33.09 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4080  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.51 
 
 		 738 aa  55.5  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0250  PAS containing protein phosphatase 2C-like  26.4 
 
 		 753 aa  55.1  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.337993  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0874  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.82 
 
 		 205 aa  53.5  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1173  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  41.13 
 
 		 180 aa  53.1  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5624  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.45 
 
 		 143 aa  53.5  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000415643  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4166  putative PAS/PAC sensor protein  26.97 
 
 		 765 aa  51.6  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.299427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2307  putative regulator  34.96 
 
 		 181 aa  51.2  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0346  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.87 
 
 		 122 aa  51.6  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.108962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4122  Stage II sporulation E family protein  29.7 
 
 		 805 aa  51.6  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.530219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1009  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  27.78 
 
 		 743 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3782  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.16 
 
 		 146 aa  50.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1228  putative signal transduction histidine kinase  33.87 
 
 		 169 aa  50.1  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.141602 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2511  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 130 aa  49.3  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.55888  normal  0.653712 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6225  putative PAS/PAC sensor protein  33.09 
 
 		 713 aa  48.9  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1503  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.12 
 
 		 192 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.941649 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0838  putative PAS/PAC sensor protein  30.41 
 
 		 754 aa  47.8  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01960  Protein of unknown function (DUF742)  28.25 
 
 		 174 aa  47.8  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.505418 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4151  putative signal transduction histidine kinase  33.08 
 
 		 183 aa  48.1  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5311  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  39.1 
 
 		 952 aa  48.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.09 
 
 		 549 aa  47  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00204881 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4276  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.99 
 
 		 180 aa  46.6  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0915518  normal  0.326932 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0207  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.59 
 
 		 613 aa  47  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00647646 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0524  putative PAS/PAC sensor protein  26.25 
 
 		 744 aa  46.6  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00695402 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4085  putative signal transduction histidine kinase  31.09 
 
 		 160 aa  47  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3140  protein serine/threonine phosphatase  28.22 
 
 		 745 aa  46.6  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.444013  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0976  hypothetical protein  34.93 
 
 		 158 aa  45.8  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2074  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.86 
 
 		 136 aa  45.4  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148055  normal  0.91426 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0664  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.17 
 
 		 147 aa  45.1  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.535186 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1581  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.04 
 
 		 149 aa  45.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0308365  normal  0.151358 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7294  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35 
 
 		 161 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0192  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.82 
 
 		 177 aa  44.3  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.513716 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2966  protein serine/threonine phosphatase  29.37 
 
 		 716 aa  44.7  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.451872  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0025  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.46 
 
 		 226 aa  43.1  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0109  putative PAS/PAC sensor protein  44 
 
 		 776 aa  43.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.310164  normal  0.141702 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1989  putative PAS/PAC sensor protein  34.11 
 
 		 722 aa  43.5  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.965966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0095  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.63 
 
 		 174 aa  43.1  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3501  putative PAS/PAC sensor protein  35.34 
 
 		 1225 aa  43.1  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.480314  normal  0.404449 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0121  putative PAS/PAC sensor protein  35 
 
 		 470 aa  43.1  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.660456  normal  0.370084 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6631  putative signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 		 135 aa  43.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0674873 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1805  hypothetical protein  35.56 
 
 		 145 aa  42.7  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8305  putative PAS/PAC sensor protein  34.34 
 
 		 528 aa  42.7  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.817018 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1306  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.86 
 
 		 202 aa  42.4  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00486516  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1241  putative PAS/PAC sensor protein  48.39 
 
 		 1432 aa  42  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00402812 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2138  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  29.08 
 
 		 155 aa  42  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0220396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4779  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.27 
 
 		 141 aa  41.6  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>