More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4434 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0136  peptidoglycan glycosyltransferase  78.29 
 
 		 482 aa  764    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00209785 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4434  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 		 480 aa  970    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.367833 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0020  peptidoglycan glycosyltransferase  58.09 
 
 		 485 aa  528  1e-149  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0017  peptidoglycan glycosyltransferase  51.02 
 
 		 491 aa  449  1e-125  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.768484  normal  0.198111 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0017  peptidoglycan glycosyltransferase  51.02 
 
 		 491 aa  449  1e-125  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0025  peptidoglycan glycosyltransferase  51.02 
 
 		 491 aa  449  1e-125  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487065 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0810  penicillin-binding protein, transpeptidase  49.69 
 
 		 491 aa  442  1e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.647945 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00200  cell elongation-specific peptidoglycan D,D-transpeptidase  52.04 
 
 		 489 aa  445  1e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.765368  normal  0.710729 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0172  Peptidoglycan glycosyltransferase  47.93 
 
 		 483 aa  432  1e-120  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.81873 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0025  penicillin-binding protein, transpeptidase  49.49 
 
 		 491 aa  435  1e-120  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0037  Peptidoglycan glycosyltransferase  50.73 
 
 		 480 aa  429  1e-119  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0073  Peptidoglycan glycosyltransferase  50.1 
 
 		 485 aa  430  1e-119  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.133397  normal  0.88619 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10016  penicillin-binding protein pbpA  48.07 
 
 		 491 aa  404  1e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0053  peptidoglycan glycosyltransferase  46.93 
 
 		 485 aa  402  9.999999999999999e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00491745  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0028  Peptidoglycan glycosyltransferase  46.67 
 
 		 493 aa  395  1e-109  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.790877  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0029  penicillin-binding protein transpeptidase  46.32 
 
 		 504 aa  396  1e-109  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.851817  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0020  Peptidoglycan glycosyltransferase  46.12 
 
 		 489 aa  395  1e-109  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0027  Peptidoglycan glycosyltransferase  48.97 
 
 		 483 aa  396  1e-109  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0113  Peptidoglycan glycosyltransferase  44.42 
 
 		 485 aa  392  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0705115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0079  Peptidoglycan glycosyltransferase  46.84 
 
 		 493 aa  389  1e-107  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7946  Peptidoglycan glycosyltransferase  47.93 
 
 		 487 aa  375  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26970  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  44.63 
 
 		 481 aa  378  1e-103  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00200  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  46.84 
 
 		 490 aa  378  1e-103  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0024  peptidoglycan glycosyltransferase  43.99 
 
 		 490 aa  373  1e-102  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.805359  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3064  peptidoglycan glycosyltransferase  42.68 
 
 		 482 aa  370  1e-101  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.300447  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5248  Peptidoglycan glycosyltransferase  43.76 
 
 		 484 aa  366  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0023  Peptidoglycan glycosyltransferase  45.06 
 
 		 488 aa  362  6e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0951925  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0051  peptidoglycan glycosyltransferase  42.66 
 
 		 503 aa  361  1e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.948858  normal  0.601931 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0027  penicillin-binding protein transpeptidase  41.18 
 
 		 495 aa  361  2e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.474914  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00380  cell elongation-specific peptidoglycan D,D-transpeptidase  43.15 
 
 		 489 aa  360  2e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0046  peptidoglycan glycosyltransferase  42.66 
 
 		 501 aa  350  4e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.56645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1381  cell division protein  42.11 
 
 		 488 aa  342  8e-93  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0022  Peptidoglycan glycosyltransferase  40.37 
 
 		 486 aa  340  2e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000781199 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0022  peptidoglycan glycosyltransferase  39.55 
 
 		 486 aa  328  1.0000000000000001e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0032  penicillin-binding protein, transpeptidase domain protein  40.57 
 
 		 488 aa  318  2e-85  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00770  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  42.05 
 
 		 481 aa  309  8e-83  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6473  penicillin-binding protein transpeptidase  39.56 
 
 		 492 aa  308  1.0000000000000001e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0022  peptidoglycan glycosyltransferase  41.43 
 
 		 504 aa  306  6e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0037  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.9 
 
 		 490 aa  282  8.000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0065  penicillin-binding protein transpeptidase  37.27 
 
 		 489 aa  275  9e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0016  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.16 
 
 		 478 aa  275  1.0000000000000001e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0089  penicillin-binding protein transpeptidase  40.08 
 
 		 493 aa  268  2e-70  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  36.51 
 
 		 473 aa  263  4e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000594466  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3042  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.84 
 
 		 924 aa  259  9e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3047  peptidoglycan glycosyltransferase  36.01 
 
 		 470 aa  259  1e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000101617  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03310  cell division membrane protein  35.85 
 
 		 921 aa  256  9e-67  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27060  cell division membrane protein  37.45 
 
 		 933 aa  255  1.0000000000000001e-66  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.358527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2305  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.73 
 
 		 458 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.117419  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1337  penicillin-binding protein transpeptidase  33.47 
 
 		 972 aa  252  8.000000000000001e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000416244  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2476  penicillin-binding protein transpeptidase  33.81 
 
 		 471 aa  250  4e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1713  penicillin-binding protein, transpeptidase  33.94 
 
 		 476 aa  229  6e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0876  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.1 
 
 		 503 aa  227  4e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0911  peptidoglycan glycosyltransferase  36.14 
 
 		 461 aa  226  9e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.271036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3840  peptidoglycan glycosyltransferase  38.66 
 
 		 577 aa  225  1e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.527285  hitchhiker  0.000155287 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0340  putative penicillin-binding protein  34.82 
 
 		 487 aa  225  2e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1344  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.73 
 
 		 954 aa  225  2e-57  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0271008 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0332  penicillin binding protein transpeptidase domain-containing protein  34.55 
 
 		 487 aa  224  3e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1376  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.23 
 
 		 547 aa  224  4e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3845  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.67 
 
 		 472 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0579  peptidoglycan glycosyltransferase  37.91 
 
 		 578 aa  216  9e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3956  peptidoglycan glycosyltransferase  35.44 
 
 		 570 aa  213  4.9999999999999996e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.591181  normal  0.218815 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2616  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.67 
 
 		 573 aa  211  2e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3814  penicillin-binding protein transpeptidase  34.86 
 
 		 579 aa  210  4e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0233122  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1118  peptidoglycan glycosyltransferase  34.64 
 
 		 584 aa  202  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  34.24 
 
 		 574 aa  202  9.999999999999999e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1805  penicillin-binding protein 2  31.84 
 
 		 610 aa  195  1e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0817  peptidoglycan glycosyltransferase  34.62 
 
 		 643 aa  195  1e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.171924  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0709  penicillin-binding protein 2  32.07 
 
 		 640 aa  192  8e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0531  penicillin-binding protein 2  32.96 
 
 		 646 aa  186  9e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0437698  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1207  penicillin-binding protein 2  30.89 
 
 		 586 aa  182  1e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0864  penicillin-binding protein 2  34.72 
 
 		 641 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0630  penicillin-binding protein 2  35.36 
 
 		 615 aa  173  5.999999999999999e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.629085  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0571  peptidoglycan glycosyltransferase  34.99 
 
 		 634 aa  171  2e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.784328  normal  0.541139 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3920  peptidoglycan glycosyltransferase  30.93 
 
 		 673 aa  171  3e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0091  peptidoglycan glycosyltransferase  33.07 
 
 		 709 aa  171  3e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.371789  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  32.11 
 
 		 645 aa  171  4e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1011  peptidoglycan glycosyltransferase  32.34 
 
 		 551 aa  170  5e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.362727  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09030  stage V sporulation protein D  29.81 
 
 		 695 aa  169  8e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1164  penicillin-binding protein 2  31.04 
 
 		 647 aa  168  2e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4825  penicillin-binding protein  31.96 
 
 		 631 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.436079  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0979  peptidoglycan glycosyltransferase  30.83 
 
 		 723 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  32.54 
 
 		 611 aa  167  5e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0049  penicillin-binding protein 2  33.68 
 
 		 800 aa  167  5e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4365  peptidoglycan glycosyltransferase  31.97 
 
 		 631 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.710659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4970  peptidoglycan glycosyltransferase  31.65 
 
 		 631 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1106  penicillin-binding protein 2  31.6 
 
 		 646 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12060  penicillin-binding protein 2  30.72 
 
 		 646 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  31.71 
 
 		 642 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0805  penicillin-binding protein 2  30.63 
 
 		 648 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  32.38 
 
 		 636 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2413  peptidoglycan glycosyltransferase  31.15 
 
 		 632 aa  165  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0462384  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1500  peptidoglycan glycosyltransferase  33.8 
 
 		 535 aa  164  3e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  32.02 
 
 		 643 aa  164  3e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1304  penicillin-binding protein 2  31.14 
 
 		 701 aa  164  3e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000662569  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  32.4 
 
 		 647 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3016  peptidoglycan glycosyltransferase  32.96 
 
 		 603 aa  164  4.0000000000000004e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00236598 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1745  peptidoglycan glycosyltransferase  30.43 
 
 		 662 aa  164  5.0000000000000005e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.371842  normal  0.361926 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0079  peptidoglycan glycosyltransferase  32.63 
 
 		 766 aa  163  6e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3798  peptidoglycan glycosyltransferase  34.21 
 
 		 630 aa  163  6e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.624413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0323  penicillin-binding protein 2  32.81 
 
 		 771 aa  163  7e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.635218  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>