More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4345 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4345  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 447 aa  885    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6402  glycosyl transferase group 1  71.46 
 
 		 517 aa  592  1e-168  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.195294 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1673  glycosyl transferase group 1  54.3 
 
 		 411 aa  429  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.272276 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1184  glycosyl transferase, group 1  54.11 
 
 		 412 aa  422  1e-117  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4246  glycosyl transferase group 1  26.62 
 
 		 753 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  30.95 
 
 		 414 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3648  glycosyl transferase family protein  27.13 
 
 		 738 aa  102  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0250737  normal  0.0159543 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  29.71 
 
 		 446 aa  100  6e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1955  glycosyl transferase group 1  26.78 
 
 		 768 aa  96.3  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.303263  normal  0.277598 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  37.23 
 
 		 433 aa  94.4  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1804  glycosyl transferase group 1  29.02 
 
 		 415 aa  93.2  8e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3263  glycosyl transferase group 1  27.23 
 
 		 425 aa  92.4  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  28.1 
 
 		 435 aa  91.7  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2495  glycosyl transferase group 1  37.2 
 
 		 392 aa  88.6  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  36.36 
 
 		 353 aa  88.6  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0580  glycosyl transferase group 1  31.23 
 
 		 399 aa  88.2  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28310  glycosyltransferase  30.77 
 
 		 417 aa  87.8  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0640064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6058  glycosyl transferase group 1  29.58 
 
 		 417 aa  86.7  8e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  25.72 
 
 		 369 aa  86.7  9e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  25.41 
 
 		 387 aa  86.3  0.000000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  26.36 
 
 		 413 aa  86.3  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  29.4 
 
 		 362 aa  86.3  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13048  transferase  28.8 
 
 		 414 aa  86.3  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00789661 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  27.72 
 
 		 371 aa  85.5  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3800  glycosyl transferase group 1  28.42 
 
 		 402 aa  85.5  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17673  normal  0.211423 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  36.02 
 
 		 392 aa  85.1  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  23.85 
 
 		 419 aa  85.9  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0503  putative glycosyltransferase  34.88 
 
 		 363 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0256  glycosyl transferase group 1  37.22 
 
 		 415 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.910371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5160  glycosyl transferase group 1  30.29 
 
 		 800 aa  84  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.170469  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2168  glycosyl transferase group 1  29.08 
 
 		 399 aa  83.6  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  24.4 
 
 		 410 aa  83.6  0.000000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4262  glycosyl transferase, group 1  27.42 
 
 		 410 aa  83.6  0.000000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4049  glycosyl transferase group 1  30.58 
 
 		 363 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2766  glycosyl transferase group 1  29 
 
 		 413 aa  82.8  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.36427 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0357  glycosyl transferase, group 1  27.39 
 
 		 375 aa  82.8  0.00000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  27.32 
 
 		 748 aa  82.4  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4956  glycosyl transferase group 1  27.18 
 
 		 340 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3055  glycosyl transferase, group 1  29.75 
 
 		 395 aa  81.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2257  glucosyltransferase  30.84 
 
 		 426 aa  80.9  0.00000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.150164  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0080  glycosyl transferase group 1  35.64 
 
 		 404 aa  80.9  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  23.23 
 
 		 408 aa  80.5  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4918  group 1 glycosyl transferase  24.91 
 
 		 366 aa  80.1  0.00000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  22.43 
 
 		 395 aa  80.1  0.00000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2638  glycosyl transferase group 1  30.3 
 
 		 367 aa  80.1  0.00000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0400002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2096  glycosyl transferase, group 1  28.33 
 
 		 410 aa  79.7  0.00000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  26.99 
 
 		 414 aa  79.3  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2594  glycosyl transferase group 1  26.55 
 
 		 421 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3271  glycosyl transferase group 1  31.8 
 
 		 768 aa  79.3  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2906  glycosyl transferase group 1  39.74 
 
 		 400 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.61318 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4972  glycosyl transferase group 1  34.86 
 
 		 445 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1065  glycosyl transferase, group 1  25.84 
 
 		 414 aa  79  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2681  glycosyl transferase group 1  35.26 
 
 		 376 aa  78.6  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  34.39 
 
 		 409 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2157  glycosyl transferase, group 1  31.05 
 
 		 385 aa  78.2  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.750957  normal  0.801991 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6015  glycosyl transferase group 1  35.79 
 
 		 384 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.44691 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  25.48 
 
 		 373 aa  77.4  0.0000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  28.39 
 
 		 935 aa  77  0.0000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3640  glycosyl transferase group 1  26.87 
 
 		 698 aa  76.6  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000440881 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06690  glycosyltransferase  29.26 
 
 		 406 aa  76.6  0.0000000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2250  putative glycosyltransferase  37.5 
 
 		 384 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  31.79 
 
 		 406 aa  75.9  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  34.01 
 
 		 374 aa  76.3  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2379  glycosyl transferase, group 1  36.9 
 
 		 381 aa  76.3  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1964  glycosyl transferase group 1  37.28 
 
 		 385 aa  76.3  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014923 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  21.48 
 
 		 391 aa  75.9  0.000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1345  glycosyl transferase, group 1  27.14 
 
 		 398 aa  75.5  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0391  glycosyl transferase group 1  30.2 
 
 		 414 aa  75.5  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2096  glycosyltransferase  34.59 
 
 		 415 aa  74.7  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1381  glycosyl transferase group 1  27.43 
 
 		 397 aa  74.3  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000217179 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2418  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  30.49 
 
 		 370 aa  74.7  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00701147  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  24.15 
 
 		 388 aa  74.3  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  24.07 
 
 		 360 aa  74.3  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  23.61 
 
 		 390 aa  74.3  0.000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  34.42 
 
 		 419 aa  74.3  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  30.29 
 
 		 414 aa  74.3  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  32.81 
 
 		 415 aa  73.9  0.000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0773  glycosyl transferase group 1  28.68 
 
 		 457 aa  73.9  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0010  glycosyl transferase, group 1  42.38 
 
 		 467 aa  73.9  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.785418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42467  predicted protein  28.96 
 
 		 679 aa  74.3  0.000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.486955  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1445  glycosyl transferase group 1  32.16 
 
 		 370 aa  73.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2209  glycosyl transferase group 1  35.85 
 
 		 421 aa  73.9  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0688071 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1540  glycosyl transferase group 1  32.16 
 
 		 370 aa  73.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0102267  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0978  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.14 
 
 		 382 aa  73.6  0.000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000355781  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  33.5 
 
 		 373 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1784  glycosyl transferase, group 1  29.22 
 
 		 379 aa  73.6  0.000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  38.69 
 
 		 399 aa  73.2  0.000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2716  glycosyl transferase group 1  38.41 
 
 		 400 aa  73.2  0.000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3661  glycosyl transferase group 1  32.23 
 
 		 367 aa  73.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0516  glycosyl transferase group 1  37.06 
 
 		 360 aa  72.8  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.192039  normal  0.814109 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  26.29 
 
 		 396 aa  72.8  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3592  glycosyl transferase group 1  32.23 
 
 		 367 aa  72.8  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_851  glycosyltransferase  27.27 
 
 		 382 aa  72  0.00000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209144  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  31.51 
 
 		 350 aa  72  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3504  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  32.49 
 
 		 367 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2465  glycosyl transferase, group 1  28.62 
 
 		 377 aa  72.4  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.356534  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3101  glycosyl transferase group 1  32.76 
 
 		 369 aa  72  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.542778 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2877  glycosyl transferase, group 1  28.81 
 
 		 426 aa  72.4  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2072  glycosyl transferase group 1  25.39 
 
 		 374 aa  71.6  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  39.74 
 
 		 389 aa  72  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>