More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3640 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3640  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 698 aa  1434    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000440881 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4246  glycosyl transferase group 1  22.97 
 
 		 753 aa  112  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  25.44 
 
 		 395 aa  85.5  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5459  glycosyl transferase group 1  26.51 
 
 		 660 aa  84.3  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0493  glycosyl transferase family 2  25.63 
 
 		 723 aa  80.5  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0986  glycosyl transferase group 1  24.73 
 
 		 429 aa  80.1  0.0000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.32714  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1955  glycosyl transferase group 1  25.69 
 
 		 768 aa  79.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.303263  normal  0.277598 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  28.4 
 
 		 353 aa  76.3  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  22.11 
 
 		 390 aa  73.2  0.00000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1673  glycosyl transferase group 1  25.91 
 
 		 411 aa  72.4  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.272276 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4345  glycosyl transferase, group 1  28.23 
 
 		 447 aa  72  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13048  transferase  22.91 
 
 		 414 aa  72  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00789661 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1062  glycosyl transferase group 1  31.29 
 
 		 400 aa  71.6  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0846  glycosyl transferase, group 1  29.75 
 
 		 405 aa  70.9  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.87203  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3892  glycosyl transferase group 1  26.98 
 
 		 408 aa  70.9  0.00000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4262  glycosyl transferase, group 1  23.97 
 
 		 410 aa  70.5  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0879  glycosyl transferase group 1  30.57 
 
 		 402 aa  70.5  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0254589  normal  0.0859714 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  30.32 
 
 		 423 aa  69.7  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6058  glycosyl transferase group 1  24.17 
 
 		 417 aa  66.6  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  28.34 
 
 		 446 aa  66.2  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3648  glycosyl transferase family protein  23.5 
 
 		 738 aa  66.6  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0250737  normal  0.0159543 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0299  glycosyl transferase, group 1  21.28 
 
 		 384 aa  66.6  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.120418  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0232  glycosyl transferase group 1  27.06 
 
 		 397 aa  64.3  0.000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1184  glycosyl transferase, group 1  24.79 
 
 		 412 aa  64.3  0.000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  25.27 
 
 		 935 aa  63.5  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  27.56 
 
 		 387 aa  63.2  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  26.75 
 
 		 410 aa  63.5  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  29.68 
 
 		 417 aa  62.8  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  28.85 
 
 		 748 aa  63.2  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  25.47 
 
 		 408 aa  62.4  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3263  glycosyl transferase group 1  22.08 
 
 		 425 aa  63.2  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1682  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.84 
 
 		 420 aa  62.4  0.00000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.961392 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3400  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.03 
 
 		 423 aa  62  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000326761 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3800  glycosyl transferase group 1  31.54 
 
 		 402 aa  62  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17673  normal  0.211423 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1761  glycosyl transferase group 1  25.79 
 
 		 390 aa  62  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2096  glycosyl transferase, group 1  23.56 
 
 		 410 aa  61.6  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4841  glycosyl transferase, group 1  29.01 
 
 		 374 aa  60.8  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000142373  normal  0.0561788 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  31.5 
 
 		 413 aa  60.8  0.00000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 396 aa  60.5  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  22.55 
 
 		 373 aa  60.5  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  30.38 
 
 		 536 aa  60.1  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0802  a-glycosyltransferase  22.94 
 
 		 429 aa  60.1  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0022358 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  24.68 
 
 		 414 aa  60.1  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  30.34 
 
 		 414 aa  59.7  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0073  glycosyl transferase, group 1  30.82 
 
 		 448 aa  59.3  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6402  glycosyl transferase group 1  26.45 
 
 		 517 aa  58.9  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.195294 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1573  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 		 420 aa  58.9  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1003  hypothetical protein  26.59 
 
 		 416 aa  58.9  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.911969  normal  0.550503 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1867  glycosyl transferase, group 1  25.49 
 
 		 412 aa  58.5  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1913  glycosyl transferase, group 1  25.49 
 
 		 412 aa  58.5  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.434704  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  24.54 
 
 		 435 aa  58.5  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1847  glycosyl transferase, group 1  25.49 
 
 		 412 aa  58.5  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.469612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2677  glycosyl transferase family protein  26.01 
 
 		 1267 aa  58.2  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1731  N-acetylglucosaminyl-phosphatidylinositol biosynthetic protein  26.63 
 
 		 376 aa  58.2  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.183221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  21.51 
 
 		 415 aa  58.2  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1869  glycosyl transferase group 1  25.32 
 
 		 432 aa  57.8  0.0000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.740215 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  25.31 
 
 		 391 aa  57.4  0.0000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1362  glycosyl transferase, group 1  29.49 
 
 		 390 aa  57.4  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0392501  normal  0.0175449 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  29.17 
 
 		 419 aa  57.4  0.0000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4083  glycosyl transferase group 1  29.45 
 
 		 399 aa  57  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0610  glycosyl transferase group 1  27.57 
 
 		 404 aa  57  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.253504  normal  0.0880164 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0439  glycosyl transferase, group 1  24.3 
 
 		 395 aa  56.2  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.63616  normal  0.246841 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4273  glycosyl transferase group 1  24.84 
 
 		 407 aa  55.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2087  UDP-N-acetylglucosamine  29.88 
 
 		 424 aa  56.2  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4043  glycosyl transferase, group 1  24.85 
 
 		 396 aa  56.6  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.121484  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  25.31 
 
 		 391 aa  56.2  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2441  glycosyl transferase group 1  26.82 
 
 		 351 aa  56.6  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.719271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3001  glycosyl transferase group 1  24.73 
 
 		 406 aa  56.2  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.469537 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3311  glycosyl transferase group 1  25.24 
 
 		 382 aa  55.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.867489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28310  glycosyltransferase  22.34 
 
 		 417 aa  55.8  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0640064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4161  glycosyl transferase, group 1  25.24 
 
 		 382 aa  55.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2339  glycosyl transferase, group 1  29.94 
 
 		 381 aa  55.8  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4205  glycosyl transferase, group 1  25.24 
 
 		 382 aa  55.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.384396 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0695  UDP-N-acetylglucosamine  29.76 
 
 		 431 aa  55.8  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3447  group 1 glycosyl transferase  26.99 
 
 		 395 aa  55.8  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2858  group 1 glycosyl transferase  28.92 
 
 		 393 aa  55.1  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0738  glycosyl transferase group 1  25.58 
 
 		 358 aa  55.1  0.000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0253  glycosyl transferase group 1  27.5 
 
 		 384 aa  55.5  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.674874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2586  glycosyl transferase group 1  26.88 
 
 		 384 aa  55.1  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.687638 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0297  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.18 
 
 		 355 aa  55.1  0.000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4229  glycosyl transferase, group 1  27.36 
 
 		 445 aa  54.7  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378432 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2212  glycosyl transferase group 1  27.67 
 
 		 439 aa  55.1  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0797  glycosyl transferase group 1  24.67 
 
 		 441 aa  54.7  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.926616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0792  glycosyl transferase group 1  27.11 
 
 		 375 aa  54.7  0.000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0154  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.93 
 
 		 360 aa  54.3  0.000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2015  glycosyl transferase, group 1  21.12 
 
 		 382 aa  54.3  0.000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2157  glycosyl transferase, group 1  27.85 
 
 		 385 aa  54.3  0.000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.750957  normal  0.801991 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0230  glycosyl transferase, group 1  25.16 
 
 		 374 aa  54.3  0.000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.264072 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3107  glycosyl transferase, group 1  30.52 
 
 		 452 aa  54.3  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  26.49 
 
 		 377 aa  53.9  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3772  glycosyl transferase group 1  24 
 
 		 438 aa  53.9  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1755  glycosyl transferase group 1  34.21 
 
 		 358 aa  53.9  0.000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.289237  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2468  putative glycosyltransferase  28 
 
 		 448 aa  53.5  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5022  glycosyl transferase group 1  26.04 
 
 		 395 aa  53.9  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2477  glycosyl transferase, group 1  29.61 
 
 		 382 aa  53.5  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.748103  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2067  glycosyl transferase, group 1  30.77 
 
 		 394 aa  53.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0419406  normal  0.401472 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0357  glycosyl transferase, group 1  27.61 
 
 		 375 aa  53.5  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1514  glycosyl transferase group 1  23.66 
 
 		 396 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.426668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2912  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 		 412 aa  53.5  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.341746  normal  0.205284 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1486  glycosyl transferase group 1  23.66 
 
 		 396 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>