More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2658 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_19490  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  60.04 
 
 		 557 aa  648    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2658  FAD linked oxidase-like  100 
 
 		 584 aa  1178    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.128646  normal  0.201188 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1001  FAD linked oxidase domain protein  63.47 
 
 		 554 aa  715    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3149  FAD linked oxidase domain protein  66.48 
 
 		 552 aa  737    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0907968  normal  0.068579 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27110  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  49.28 
 
 		 568 aa  555  1e-156  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2176  oxidase, FAD-binding  41.08 
 
 		 563 aa  433  1e-120  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000623586  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5413  Alkylglycerone-phosphate synthase  38.82 
 
 		 550 aa  349  9e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3761  alkylglycerone-phosphate synthase  36.59 
 
 		 527 aa  343  5.999999999999999e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3374  alkylglycerone-phosphate synthase  36.41 
 
 		 525 aa  340  4e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3385  alkylglycerone-phosphate synthase  36.41 
 
 		 525 aa  340  4e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3436  alkylglycerone-phosphate synthase  36.41 
 
 		 525 aa  340  4e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0692131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1669  alkylglycerone-phosphate synthase  36.07 
 
 		 556 aa  332  1e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.216533  normal  0.884657 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1798  Alkylglycerone-phosphate synthase  36.91 
 
 		 528 aa  324  3e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00290405  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0358  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.66 
 
 		 533 aa  321  1.9999999999999998e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000693187  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2772  alkylglycerone-phosphate synthase  35.14 
 
 		 527 aa  320  5e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.117671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12280  flavoprotein  34.83 
 
 		 529 aa  320  7e-86  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00816767  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2238  alkylglycerone-phosphate synthase  36.05 
 
 		 532 aa  319  9e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.185547 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2332  FAD linked oxidase-like  34.23 
 
 		 538 aa  306  9.000000000000001e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.16388  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0943  FAD linked oxidase-like  35.83 
 
 		 545 aa  300  3e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0368093  normal  0.140312 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4590  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.43 
 
 		 518 aa  300  7e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0387906  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1558  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.22 
 
 		 531 aa  298  1e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0927889 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1346  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.79 
 
 		 534 aa  299  1e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.825647  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2132  hypothetical protein  34.91 
 
 		 531 aa  298  2e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4359  alkylglycerone-phosphate synthase  33.75 
 
 		 559 aa  295  1e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0594  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.81 
 
 		 565 aa  286  5e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.227015 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4399  Alkylglycerone-phosphate synthase  36.47 
 
 		 540 aa  286  9e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24940  hypothetical protein  33.39 
 
 		 531 aa  286  9e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33270  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  37.12 
 
 		 534 aa  285  1.0000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.495555  normal  0.797078 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2774  alkylglycerone-phosphate synthase  37.68 
 
 		 521 aa  282  1e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.757745  hitchhiker  0.000882641 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6682  Alkylglycerone-phosphate synthase  34.55 
 
 		 521 aa  282  1e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0557877  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0015  FAD linked oxidase-like  30.81 
 
 		 583 aa  279  9e-74  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.344556 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0302  Alkylglycerone-phosphate synthase  35.09 
 
 		 524 aa  278  2e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0179371  normal  0.709623 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5599  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.81 
 
 		 572 aa  275  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0254483  hitchhiker  0.00797673 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1958  Alkylglycerone-phosphate synthase  35.86 
 
 		 531 aa  261  2e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.778758  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2577  alkylglycerone-phosphate synthase  36.41 
 
 		 520 aa  258  2e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3390  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.06 
 
 		 579 aa  256  1.0000000000000001e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44190  predicted protein  30.56 
 
 		 554 aa  252  2e-65  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.694416  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0138  alkyldihydroxyacetonephosphate synthase, putative  29.91 
 
 		 586 aa  244  3e-63  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.568715  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1045  FAD linked oxidase domain protein  33.33 
 
 		 546 aa  234  2.0000000000000002e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0325485 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13124  alkyldihydroxyacetonephosphate synthase agpS  32.21 
 
 		 527 aa  234  3e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.209068 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3350  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.51 
 
 		 536 aa  233  7.000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0117199 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2614  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.66 
 
 		 564 aa  232  1e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.010282  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5107  FAD linked oxidase-like  30.84 
 
 		 534 aa  230  5e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.477653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3848  FAD linked oxidase-like  31.89 
 
 		 532 aa  230  5e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.16086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3120  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.85 
 
 		 535 aa  230  5e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0913078  normal  0.485742 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1454  FAD linked oxidase domain protein  31.79 
 
 		 531 aa  227  4e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2454  Alkylglycerone-phosphate synthase  35.16 
 
 		 467 aa  225  2e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000169679  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1270  FAD linked oxidase-like  31.96 
 
 		 532 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.544288 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2483  FAD linked oxidase-like  31.05 
 
 		 502 aa  217  4e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.146767  normal  0.0195086 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6436  FAD linked oxidase domain protein  30.12 
 
 		 534 aa  217  5.9999999999999996e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000466111 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1876  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.08 
 
 		 510 aa  195  2e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.606958  normal  0.0560108 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8219  FAD linked oxidase domain protein  30.52 
 
 		 470 aa  192  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3321  FAD linked oxidase domain protein  28.86 
 
 		 572 aa  187  4e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0988206  normal  0.0174959 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4576  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.99 
 
 		 523 aa  182  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.539848  normal  0.906341 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1372  alkylglycerone-phosphate synthase  28.29 
 
 		 465 aa  180  4.999999999999999e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.782717  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2080  FAD linked oxidase-like  31.78 
 
 		 520 aa  179  9e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270192  normal  0.562813 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4360  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.28 
 
 		 520 aa  176  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2462  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.18 
 
 		 516 aa  173  9e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.806747  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1119  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.6 
 
 		 516 aa  172  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5443  putative alkylglycerone-phosphate synthase  28.51 
 
 		 517 aa  162  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2461  alkylglycerone-phosphate synthase  26.86 
 
 		 484 aa  154  2.9999999999999998e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4029  FAD binding domain protein  27.04 
 
 		 484 aa  152  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.637066 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2912  FAD binding domain-containing protein  26.85 
 
 		 484 aa  151  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0940  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.04 
 
 		 484 aa  151  4e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3074  FAD binding domain-containing protein  26.85 
 
 		 484 aa  150  5e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.101156  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02617  predicted FAD containing dehydrogenase  26.85 
 
 		 484 aa  150  8e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0916  FAD linked oxidase domain protein  26.85 
 
 		 484 aa  150  8e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02580  hypothetical protein  26.85 
 
 		 484 aa  150  8e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2901  FAD binding domain-containing protein  26.65 
 
 		 484 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.468939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1036  FAD linked oxidase-like  27.53 
 
 		 513 aa  147  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3774  putative oxidoreductase  28.38 
 
 		 499 aa  124  4e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0098375 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1477  FAD linked oxidase-like  28.47 
 
 		 474 aa  120  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0640821  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0202  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.54 
 
 		 473 aa  118  3.9999999999999997e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.243944 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2162  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.65 
 
 		 447 aa  117  5e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5949  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.11 
 
 		 472 aa  117  5e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00822967 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0061  FAD linked oxidase domain protein  28.98 
 
 		 474 aa  117  6e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0040  Fis family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 474 aa  116  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.19101 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52647  mitochondrial lactate ferricytochrome c oxidoreductase  23.39 
 
 		 489 aa  116  1.0000000000000001e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.172036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3226  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.32 
 
 		 463 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.339169  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1937  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.65 
 
 		 484 aa  115  3e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00614579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3515  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  25.15 
 
 		 463 aa  114  5e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0111  FAD linked oxidase-like  27.08 
 
 		 473 aa  113  8.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1735  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  25.92 
 
 		 463 aa  113  9e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.975111  normal  0.083174 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1292  glycolate oxidase, subunit GlcD, putative  27.02 
 
 		 469 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0095  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.23 
 
 		 474 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0625  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.79 
 
 		 469 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3530  glycolate oxidase, subunit GlcD, putative  25 
 
 		 463 aa  110  6e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.692393  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0069  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.55 
 
 		 473 aa  110  6e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.881498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2651  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.79 
 
 		 469 aa  110  9.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0846115 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3278  glycolate oxidase, GlcD subunit  25 
 
 		 463 aa  109  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0069912  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3536  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  24.78 
 
 		 463 aa  110  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0651  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.35 
 
 		 469 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1149  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.44 
 
 		 467 aa  109  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.930112 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3329  putative glycolate oxidase subunit  26.58 
 
 		 469 aa  107  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3341  D-lactate dehydrogenase (acceptor: cytochrome)  26.58 
 
 		 469 aa  107  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1767  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.16 
 
 		 469 aa  107  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.101334  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0052  FAD linked oxidase domain protein  24.51 
 
 		 474 aa  108  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3295  putative glycolate oxidase subunit  26.58 
 
 		 469 aa  107  5e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0332  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  26.58 
 
 		 469 aa  107  5e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2602  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  26.58 
 
 		 469 aa  107  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>