144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1653 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1653  cytochrome oxidase assembly  100 
 
 		 342 aa  652    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2078  cytochrome oxidase assembly  68.52 
 
 		 351 aa  389  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.7047 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0193  cytochrome oxidase assembly  41.74 
 
 		 321 aa  216  5e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2378  cytochrome oxidase assembly  45.77 
 
 		 337 aa  202  7e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.653771  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2430  cytochrome oxidase assembly  44.19 
 
 		 325 aa  201  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.424525  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3312  cytochrome oxidase assembly  45.83 
 
 		 325 aa  199  7.999999999999999e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000656603 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2543  cytochrome oxidase assembly  45.93 
 
 		 305 aa  194  2e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0684946  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22000  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  47.69 
 
 		 313 aa  194  2e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.891794  normal  0.935402 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13300  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  46.78 
 
 		 287 aa  192  8e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0813876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2249  cytochrome oxidase assembly  42.91 
 
 		 386 aa  189  7e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000165994 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3085  cytochrome oxidase assembly  45.08 
 
 		 326 aa  186  4e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0734948  normal  0.300108 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2061  cytochrome oxidase assembly  47.5 
 
 		 309 aa  186  6e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.603923  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2347  cytochrome oxidase assembly  41.34 
 
 		 328 aa  185  9e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0173507  normal  0.0130822 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1977  cytochrome oxidase assembly  43.84 
 
 		 328 aa  185  9e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.628163 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2217  cytochrome oxidase assembly  46.55 
 
 		 351 aa  182  6e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000899528  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6009  hypothetical protein  45.55 
 
 		 329 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00257584  normal  0.402021 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1995  putative integral membrane transport protein  42.71 
 
 		 351 aa  176  4e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1133  cytochrome oxidase assembly  43.89 
 
 		 370 aa  175  9e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2971  cytochrome oxidase assembly  44.82 
 
 		 370 aa  175  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5168  cytochrome oxidase assembly  44.52 
 
 		 322 aa  174  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.251951  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16080  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  40.44 
 
 		 323 aa  166  5e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2099  cytochrome oxidase assembly  43.55 
 
 		 301 aa  164  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.763514  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1841  cytochrome oxidase assembly  43.84 
 
 		 314 aa  164  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000355712 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1135  cytochrome oxidase assembly  38.27 
 
 		 318 aa  159  7e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2514  cytochrome oxidase assembly  40.07 
 
 		 326 aa  155  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787939  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3684  cytochrome oxidase assembly  40.14 
 
 		 318 aa  154  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.189637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5475  cytochrome oxidase assembly  39.18 
 
 		 331 aa  154  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2429  cytochrome oxidase assembly  39.78 
 
 		 342 aa  152  8e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2474  cytochrome oxidase assembly  39.78 
 
 		 342 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2467  cytochrome oxidase assembly  39.78 
 
 		 342 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2726  cytochrome oxidase assembly  40.49 
 
 		 318 aa  145  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0568935  normal  0.123389 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1353  cytochrome oxidase assembly  39.79 
 
 		 320 aa  143  4e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2268  cytochrome oxidase assembly  42.53 
 
 		 337 aa  143  5e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00686495  normal  0.0860504 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11450  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  38.71 
 
 		 338 aa  142  7e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.314019  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1666  cytochrome oxidase assembly  41.16 
 
 		 348 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00799414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11484  antibiotic ABC transporter membrane protein  38.67 
 
 		 310 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.802636 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2553  cytochrome oxidase assembly  43.38 
 
 		 304 aa  139  6e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14570  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  40.71 
 
 		 307 aa  137  3.0000000000000003e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.852831  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3264  cytochrome oxidase assembly  43.48 
 
 		 298 aa  124  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.133931 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  33.5 
 
 		 622 aa  86.7  6e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3469  cytochrome oxidase assembly  24.64 
 
 		 342 aa  85.9  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0691461 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5672  cytochrome oxidase assembly  28.62 
 
 		 339 aa  72.8  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.919236 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2479  cytochrome oxidase assembly  27.95 
 
 		 311 aa  68.6  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0174052  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4285  cytochrome oxidase assembly  26.86 
 
 		 341 aa  66.6  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.367263  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3001  cytochrome oxidase assembly  35.06 
 
 		 339 aa  64.7  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2205  cytochrome oxidase assembly protein  25.46 
 
 		 327 aa  64.7  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000750752  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1778  cytochrome oxidase assembly protein  27.3 
 
 		 323 aa  63.2  0.000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0371  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  33.52 
 
 		 363 aa  62.8  0.000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2601  putative cytochrome aa3 controlling protein  34 
 
 		 304 aa  62.8  0.000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.705731 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0300  cytochrome oxidase assembly  36.17 
 
 		 361 aa  61.2  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0322  cytochrome oxidase assembly  33.33 
 
 		 367 aa  60.1  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.334167  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0478  hypothetical protein  31.11 
 
 		 335 aa  57.8  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0296  cytochrome oxidase assembly  28.57 
 
 		 354 aa  57.4  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.300662  normal  0.0109948 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05091  hypothetical protein  29.94 
 
 		 285 aa  57.8  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.150213  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1637  cytochrome oxidase assembly  33.79 
 
 		 373 aa  57.4  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0968838  normal  0.388921 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0246  cytochrome oxidase assembly  30.86 
 
 		 363 aa  56.6  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.241407  normal  0.0193794 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0227  cytochrome oxidase assembly  30.86 
 
 		 363 aa  56.6  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0446  hypothetical protein  27.88 
 
 		 308 aa  56.6  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.552412  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06105  cytochrome oxidase assembly protein  42.86 
 
 		 343 aa  56.2  0.0000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0454  hypothetical protein  30.56 
 
 		 335 aa  55.5  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2398  cytochrome oxidase assembly  26.92 
 
 		 326 aa  55.5  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04711  hypothetical protein  29.11 
 
 		 308 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1462  cytochrome oxidase assembly  30.17 
 
 		 348 aa  53.5  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05021  hypothetical protein  28.68 
 
 		 308 aa  53.5  0.000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06265  hypothetical protein  34.06 
 
 		 339 aa  53.1  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0186  hypothetical protein  35.71 
 
 		 137 aa  53.1  0.000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.480963 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4064  cytochrome aa3 controlling protein  32.86 
 
 		 311 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.839964  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4049  cytochrome aa3 controlling protein  32.86 
 
 		 311 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3993  cytochrome aa3 controlling protein  32.86 
 
 		 311 aa  52.8  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1191  cytochrome aa3 controlling protein  32.86 
 
 		 311 aa  52.8  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3961  cytochrome aa3 controlling protein  32.86 
 
 		 311 aa  52.8  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3858  cytochrome aa3 controlling protein  32.86 
 
 		 311 aa  52.8  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3689  cytochrome-c oxidase (cytochrome aa3 controlling protein)  32.86 
 
 		 311 aa  52.8  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3706  cytochrome-c oxidase (cytochrome aa3 controlling protein)  32.86 
 
 		 311 aa  52.8  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.006652  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4156  cytochrome aa3 controlling protein  32.86 
 
 		 311 aa  52.8  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1932  cytochrome oxidase assembly  30.61 
 
 		 376 aa  52.8  0.000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1753  putative cytochrome c oxidase assembly protein  32.28 
 
 		 327 aa  51.2  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.382605  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001452  heme A synthase cytochrome oxidase biogenesis protein Cox15-CtaA  32.88 
 
 		 339 aa  52  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06441  hypothetical protein  34.06 
 
 		 307 aa  50.8  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0836643 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0254  cytochrome oxidase assembly  26.32 
 
 		 313 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.497182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0256  cytochrome oxidase assembly  26.32 
 
 		 313 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3174  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  31.58 
 
 		 391 aa  50.1  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.350605  normal  0.387453 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0149  cytochrome oxidase assembly  33.6 
 
 		 345 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3689  cytochrome oxidase assembly  27.51 
 
 		 307 aa  50.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2849  cytochrome oxidase assembly  30.94 
 
 		 370 aa  49.7  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.442546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6168  cytochrome oxidase assembly  30.5 
 
 		 370 aa  49.7  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.473595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2225  cytochrome oxidase assembly  30.94 
 
 		 370 aa  49.7  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2838  cytochrome oxidase assembly  30.94 
 
 		 370 aa  49.7  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1459  cytochrome oxidase assembly  26.83 
 
 		 337 aa  49.3  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.494782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0886  cytochrome oxidase assembly  34.93 
 
 		 392 aa  49.3  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3528  cytochrome oxidase assembly  29.86 
 
 		 396 aa  48.9  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0498  cytochrome oxidase assembly protein  26.88 
 
 		 369 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0434  cytochrome c assembly family protein  30.22 
 
 		 369 aa  48.5  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0161  cytochrome c assembly family protein  30.22 
 
 		 369 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1431  cytochrome c assembly family protein  30.22 
 
 		 369 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0516  cytochrome oxidase assembly protein  30.22 
 
 		 369 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2858  cytochrome c assembly family protein  30.22 
 
 		 369 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3772  cytochrome oxidase assembly  35.96 
 
 		 311 aa  48.5  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161471  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3827  cytochrome oxidase assembly  28.81 
 
 		 411 aa  48.1  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.502475 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0285  cytochrome oxidase assembly  29.71 
 
 		 369 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>