More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0198 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0198  hypothetical protein  100 
 
 		 411 aa  796    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.146044  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6962  hypothetical protein  82.24 
 
 		 410 aa  641    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0549352  normal  0.280239 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  45.28 
 
 		 406 aa  311  2e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1724  protein of unknown function DUF214  40.64 
 
 		 406 aa  291  1e-77  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000472644  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4734  protein of unknown function DUF214  43.69 
 
 		 405 aa  290  4e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0670299 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0210  protein of unknown function DUF214  45.11 
 
 		 409 aa  289  8e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  39.76 
 
 		 405 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3036  hypothetical protein  42.16 
 
 		 409 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000134447  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1060  protein of unknown function DUF214  41.18 
 
 		 410 aa  272  9e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3269  hypothetical protein  40.84 
 
 		 417 aa  271  2e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392624  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  41.36 
 
 		 407 aa  270  4e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1127  hypothetical protein  40.98 
 
 		 409 aa  270  5e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2971  hypothetical protein  40 
 
 		 412 aa  267  2e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  40.14 
 
 		 443 aa  263  3e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2026  protein of unknown function DUF214  43 
 
 		 409 aa  263  3e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000157118 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2201  protein of unknown function DUF214  43 
 
 		 409 aa  263  4e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1062  ABC transporter  41.5 
 
 		 409 aa  262  8.999999999999999e-69  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.978594  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  40.44 
 
 		 391 aa  261  1e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  38.7 
 
 		 658 aa  261  1e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2826  hypothetical protein  38.59 
 
 		 405 aa  261  1e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3166  protein of unknown function DUF214  43.58 
 
 		 409 aa  261  2e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3058  protein of unknown function DUF214  43.34 
 
 		 409 aa  259  6e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1994  protein of unknown function DUF214  40.72 
 
 		 405 aa  259  8e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0259708 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1967  protein of unknown function DUF214  40.72 
 
 		 405 aa  259  8e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  37.38 
 
 		 405 aa  258  1e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2970  hypothetical protein  43.1 
 
 		 409 aa  258  1e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  38.81 
 
 		 401 aa  258  1e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  38.6 
 
 		 401 aa  258  2e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8874  protein of unknown function DUF214  39.35 
 
 		 418 aa  257  3e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00933707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  37.62 
 
 		 409 aa  255  8e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  35.78 
 
 		 406 aa  255  9e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  36.56 
 
 		 406 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4500  protein of unknown function DUF214  40.29 
 
 		 403 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  39.85 
 
 		 409 aa  253  3e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  38.76 
 
 		 400 aa  253  3e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1437  ABC transporter  40.44 
 
 		 409 aa  254  3e-66  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51547  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1676  protein of unknown function DUF214  39.06 
 
 		 415 aa  253  4.0000000000000004e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4044  protein of unknown function DUF214  38.98 
 
 		 405 aa  252  9.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4002  protein of unknown function DUF214  38.98 
 
 		 405 aa  251  1e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1376  ABC transporter related  39.9 
 
 		 643 aa  251  2e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1042  protein of unknown function DUF214  39.47 
 
 		 404 aa  250  3e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  38.28 
 
 		 400 aa  249  4e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0904  hypothetical protein  41.61 
 
 		 411 aa  249  4e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0627404  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  37.94 
 
 		 398 aa  249  5e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  35.11 
 
 		 406 aa  248  9e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1168  hypothetical protein  41.79 
 
 		 406 aa  249  9e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.69946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0412  hypothetical protein  42.03 
 
 		 394 aa  249  9e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1126  hypothetical protein  39.43 
 
 		 414 aa  249  9e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  37.65 
 
 		 412 aa  248  1e-64  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2862  hypothetical protein  40.05 
 
 		 405 aa  247  3e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3645  hypothetical protein  41.4 
 
 		 402 aa  247  3e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.52542 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3235  hypothetical protein  39.81 
 
 		 408 aa  247  3e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09961  putative ABC transporter  36.89 
 
 		 409 aa  246  4.9999999999999997e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  39.95 
 
 		 405 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09461  putative ABC transporter  37.16 
 
 		 410 aa  244  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0294  putative ABC transporter  38.97 
 
 		 409 aa  244  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09481  putative ABC transporter  37.16 
 
 		 410 aa  244  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3757  hypothetical protein  39.67 
 
 		 414 aa  244  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000165799 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09661  putative ABC transporter  38.97 
 
 		 409 aa  244  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.326291  normal  0.359789 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3550  hypothetical protein  37.44 
 
 		 402 aa  242  1e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1452  hypothetical protein  41.81 
 
 		 410 aa  240  2.9999999999999997e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2043  hypothetical protein  36.63 
 
 		 403 aa  239  4e-62  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2353  hypothetical protein  40.82 
 
 		 408 aa  239  4e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0317292  normal  0.0674472 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2926  hypothetical protein  35.28 
 
 		 394 aa  238  1e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.019889  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  38 
 
 		 400 aa  238  1e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2859  hypothetical protein  37.53 
 
 		 423 aa  237  3e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.326481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  41 
 
 		 403 aa  236  4e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3570  protein of unknown function DUF214  40.34 
 
 		 409 aa  236  6e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  36.56 
 
 		 657 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3373  ABC efflux transporter, inner membrane subunit  38.74 
 
 		 401 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3019  hypothetical protein  38.74 
 
 		 401 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4210  efflux ABC transporter ATP-binding protein  38.26 
 
 		 654 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.875938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3866  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system periplasmic component-like protein  38.26 
 
 		 401 aa  232  7.000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  38.6 
 
 		 402 aa  231  1e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  37.86 
 
 		 402 aa  230  3e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  37.86 
 
 		 402 aa  230  3e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2870  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  36.98 
 
 		 663 aa  230  4e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.876991  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1616  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  38.63 
 
 		 651 aa  229  5e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0879367  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33760  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  36.25 
 
 		 663 aa  229  6e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267667  hitchhiker  0.000629117 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1397  protein of unknown function DUF214  40.05 
 
 		 431 aa  229  8e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.408295 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  36.59 
 
 		 644 aa  229  1e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2296  protein of unknown function DUF214  38.18 
 
 		 392 aa  228  1e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3524  ABC transporter related  38.88 
 
 		 671 aa  227  3e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0813  hypothetical protein  32.22 
 
 		 402 aa  226  6e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  36.34 
 
 		 653 aa  225  1e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2159  macrolide ABC efflux protein  35.28 
 
 		 656 aa  224  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103755  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0306  ABC transporter related  36.19 
 
 		 707 aa  223  4e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.114507  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3463  hypothetical protein  38.04 
 
 		 402 aa  223  7e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2918  protein of unknown function DUF214  38.26 
 
 		 405 aa  222  9e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.393852  normal  0.599334 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0496  ATPase  36.05 
 
 		 670 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0953  hypothetical protein  37.77 
 
 		 402 aa  220  3e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3782  ABC transporter related  38.16 
 
 		 654 aa  220  3e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.972642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2041  ABC transporter, ATPase subunit  39.29 
 
 		 645 aa  220  3.9999999999999997e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.568421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1258  ABC transporter related  37.65 
 
 		 652 aa  219  5e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3283  ABC transporter related  35.66 
 
 		 666 aa  219  7e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.477638  normal  0.90811 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3722  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  37.32 
 
 		 661 aa  219  1e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.197836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  34.74 
 
 		 656 aa  219  1e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1856  hypothetical protein  35.59 
 
 		 657 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.804501  normal  0.550352 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1708  protein of unknown function DUF214  36.58 
 
 		 400 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.490219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2458  hypothetical protein  36.25 
 
 		 394 aa  216  4e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>