71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0020 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0020  CRISPR-associated Cse4 family protein  100 
 
 		 384 aa  778    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.451411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17330  CRISPR-associated protein, Cse4 family  53.83 
 
 		 381 aa  387  1e-106  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3052  CRISPR-associated protein, Cse4 family  46.58 
 
 		 378 aa  311  2e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000809112  hitchhiker  0.00221304 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2575  CRISPR-associated Cse4 family protein  45.16 
 
 		 387 aa  291  2e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0107855 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0762  CRISPR system CASCADE complex protein CasC  42.41 
 
 		 362 aa  278  1e-73  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0450827 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1283  CRISPR-associated protein, Cse4 family  50 
 
 		 395 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1598  CRISPR-associated Cse4 family protein  45.1 
 
 		 397 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00285454  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0986  CRISPR-associated protein, Cse4 family  44.42 
 
 		 386 aa  273  4.0000000000000004e-72  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3907  CRISPR-associated protein, Cse4 family  43.42 
 
 		 399 aa  272  8.000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000018703  normal  0.192043 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2682  CRISPR-associated protein, Cse4 family  46.77 
 
 		 397 aa  263  4.999999999999999e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000309604  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1533  Cse4 family CRISPR-associated protein  43.09 
 
 		 392 aa  259  7e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.136535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1898  CRISPR-associated protein, Cse4 family  41.36 
 
 		 382 aa  253  3e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3758  CRISPR-associated Cse4 family protein  43.87 
 
 		 384 aa  248  1e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.398681 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1233  CRISPR-associated protein, Cse4 family  42.69 
 
 		 388 aa  247  3e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00111756  normal  0.718248 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17200  CRISPR-associated protein, CT1975  45.89 
 
 		 380 aa  243  3e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3016  Cse4 family CRISPR-associated protein  41.88 
 
 		 390 aa  238  1e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000977881  normal  0.046365 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1974  CRISPR-associated Cse4 family protein  43.13 
 
 		 380 aa  211  1e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.466584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2632  CRISPR-associated Cse4 family protein  41.67 
 
 		 385 aa  211  2e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2340  CRISPR-associated Cse4 family protein  39.31 
 
 		 374 aa  210  4e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2827  CRISPR-associated Cse4 family protein  37.57 
 
 		 384 aa  202  5e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0926  CRISPR-associated protein, Cse4 family  36.66 
 
 		 350 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1590  CRISPR-associated Cse4 family protein  37.62 
 
 		 373 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.322861  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0830  CRISPR-associated Cse4 family protein  34.86 
 
 		 408 aa  189  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.50766  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17160  CRISPR-associated protein, Cse4 family  38.02 
 
 		 390 aa  184  3e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2674  CRISPR-associated protein, Cse4 family  37.05 
 
 		 347 aa  176  6e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1378  CRISPR-associated Cse4 family protein  36.76 
 
 		 382 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.0035432  normal  0.385916 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1605  CRISPR-associated protein, Cse4 family  36.05 
 
 		 368 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.936152 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0596  CRISPR-associated Cse4 family protein  34.62 
 
 		 367 aa  164  3e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000866758  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3095  crispr-associated protein, Cse4 family  35.71 
 
 		 352 aa  163  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0478447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0400  CRISPR-associated protein, Cse4 family  36.31 
 
 		 355 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0182914  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0908  CRISPR-associated protein, Cse4 family  34.72 
 
 		 344 aa  163  4.0000000000000004e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.580096  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2477  CRISPR-associated protein, Cse4 family  35.38 
 
 		 356 aa  163  5.0000000000000005e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0959  CRISPR-associated Cse4 family protein  35.49 
 
 		 373 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0648  CRISPR-associated Cse4 family protein  32.28 
 
 		 402 aa  162  6e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.626197 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0229  CRISPR-associated Cse4 family protein  34.98 
 
 		 368 aa  162  7e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3252  crispr-associated protein, Cse4 family  36.71 
 
 		 352 aa  159  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.633483  normal  0.732205 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5412  CRISPR-associated protein, Cse4 family  37.91 
 
 		 346 aa  159  9e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.995476  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3151  CRISPR-associated protein Cse4 family  35.69 
 
 		 352 aa  159  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.784001 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0425  CRISPR-associated protein, Cse4 family  35.73 
 
 		 352 aa  158  1e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00278102  normal  0.032174 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1415  CRISPR-associated protein, Cse4 family  34.3 
 
 		 347 aa  158  2e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0668384 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3545  CRISPR-associated Cse4 family protein  33.33 
 
 		 344 aa  156  5.0000000000000005e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.785914  normal  0.0809396 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0172  CRISPR-associated Cse4 family protein  37.42 
 
 		 359 aa  156  6e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.406672  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3588  CRISPR-associated protein, Cse4 family  36.11 
 
 		 345 aa  155  1e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1811  CRISPR-associated Cse4 family protein  34.87 
 
 		 370 aa  154  2e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3060  CRISPR-associated Cse4 family protein  35.42 
 
 		 351 aa  154  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3069  crispr-associated protein, Cse4 family  35.33 
 
 		 352 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4011  CRISPR-associated protein, Cse4 family  35.42 
 
 		 351 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.453377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2886  CRISPR-associated Cse4 family protein  35.18 
 
 		 351 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.420598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2986  CRISPR-associated Cse4 family protein  32.78 
 
 		 370 aa  153  4e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3317  CRISPR-associated Cse4 family protein  34.29 
 
 		 370 aa  151  2e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0862  CRISPR-associated Cse4 family protein  35.49 
 
 		 376 aa  150  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3135  Cse4 family CRISPR-associated protein  34.28 
 
 		 352 aa  150  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2162  CRISPR-associated protein, Cse4 family  33.13 
 
 		 378 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0895292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0943  CRISPR-associated protein, Cse4 family  34.38 
 
 		 399 aa  146  6e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.669234  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1387  CRISPR-associated Cse4 family protein  36.28 
 
 		 364 aa  145  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2897  CRISPR-associated Cse4 family protein  31.36 
 
 		 363 aa  143  5e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.317201  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0954  CRISPR-associated Cse4 family protein  31.36 
 
 		 363 aa  142  7e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1589  CRISPR-associated Cse4 family protein  31.51 
 
 		 337 aa  142  9.999999999999999e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.466428  normal  0.48477 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0930  CRISPR-associated protein, Cse4 family  31.07 
 
 		 363 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4091  CRISPR-associated protein, Cse4 family  41.76 
 
 		 501 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.347558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13890  CRISPR-associated protein, Cse4 family  33.44 
 
 		 368 aa  140  4.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.325909  normal  0.555168 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2441  CRISPR-associated protein, Cse4 family  43.84 
 
 		 480 aa  123  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2231  CRISPR-associated protein, Cse4 family  30.92 
 
 		 394 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00868  CRISPR-associated protein, Cse4 family  32.17 
 
 		 315 aa  115  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0344  CRISPR-associated Cse4 family protein  30 
 
 		 381 aa  109  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0952  CRISPR-associated Cse4 family protein  28.46 
 
 		 385 aa  105  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.195706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0483  CRISPR-associated protein, Cse4 family  26.98 
 
 		 423 aa  103  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.797503  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0781  CRISPR-associated protein, Cse4 family  28.27 
 
 		 413 aa  99.4  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3217  CRISPR-associated protein  30.14 
 
 		 373 aa  98.6  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.879676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0781  CRISPR-associated protein, Cse4 family  28.42 
 
 		 413 aa  97.1  4e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0933  CRISPR-associated Cse4 family protein  24.15 
 
 		 414 aa  82.4  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0723191  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>