More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1587 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1587  regulatory protein LacI  100 
 
 		 333 aa  675    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000010083  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0782  regulatory protein, LacI  55.66 
 
 		 327 aa  385  1e-106  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0778  LacI family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 337 aa  207  2e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.602381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0060  LacI family transcription regulator  35.06 
 
 		 355 aa  204  2e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0425291  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3423  extracellular solute-binding protein family 1  37.88 
 
 		 335 aa  202  6e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3225  hypothetical protein  37.88 
 
 		 335 aa  202  6e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.118806  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1526  transcriptional regulator, LacI family  34.64 
 
 		 344 aa  201  1.9999999999999998e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.114079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0580  LacI family transcription regulator  34.44 
 
 		 330 aa  193  3e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1261  LacI family transcription regulator  31.82 
 
 		 331 aa  190  2e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2920  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.44 
 
 		 318 aa  177  3e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  31.88 
 
 		 347 aa  159  6e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.42 
 
 		 339 aa  157  3e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4797  LacI family transcription regulator  31.63 
 
 		 336 aa  145  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.184791  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  32.06 
 
 		 353 aa  145  1e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  31.25 
 
 		 348 aa  142  9.999999999999999e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  33.33 
 
 		 332 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09530  transcriptional regulator, LacI family  33.04 
 
 		 340 aa  142  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00123183  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0292  transcriptional regulator, LacI family  32.73 
 
 		 336 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1736  transcriptional regulator, LacI family  32.65 
 
 		 333 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000004003  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.03 
 
 		 336 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0163  transcriptional regulator, LacI family  31.18 
 
 		 330 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000297035  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0512  LacI family transcription regulator  32.24 
 
 		 336 aa  140  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0499  LacI family transcription regulator  30.21 
 
 		 330 aa  139  7e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1314  transcriptional regulator, LacI family protein  30.65 
 
 		 352 aa  137  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  29.31 
 
 		 341 aa  137  2e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  29.94 
 
 		 329 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0732  ribose operon repressor  32.93 
 
 		 323 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0574  ribose operon repressor  32.63 
 
 		 323 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0793  ribose operon repressor  32.63 
 
 		 323 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00165994  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0721  ribose operon repressor  32.63 
 
 		 323 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.40772e-23 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4642  ribose operon repressor  32.93 
 
 		 323 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.317022  unclonable  5.22733e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0631  ribose operon repressor  32.63 
 
 		 323 aa  135  8e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0664  ribose operon repressor  32.63 
 
 		 323 aa  135  8e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.566043  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0578  LacI family transcription regulator  32.62 
 
 		 323 aa  135  8e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0559  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.34 
 
 		 323 aa  135  8e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000011059  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0279  transcriptional regulator, LacI family  27.49 
 
 		 351 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0575  ribose operon repressor  32.63 
 
 		 323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.64 
 
 		 330 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1400  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.36 
 
 		 332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.665266  normal  0.0917942 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  30.93 
 
 		 335 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2281  transcriptional regulator, LacI family  29.61 
 
 		 334 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3623  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.07 
 
 		 335 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.487296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5149  transcriptional regulator, LacI family  28.89 
 
 		 346 aa  133  5e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0696  ribose operon repressor  32.63 
 
 		 323 aa  132  6e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0345677  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2311  transcriptional regulator, LacI family  28.36 
 
 		 335 aa  132  9e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000106518  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6389  transcriptional regulator, LacI family  29.28 
 
 		 342 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3342  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  30.28 
 
 		 332 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000152618  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0449  catabolite control protein A  29.97 
 
 		 332 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0343  transcriptional regulator, LacI family  31.79 
 
 		 327 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0415  LacI family transcription regulator  31.85 
 
 		 335 aa  130  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.280412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4790  catabolite control protein A  29.97 
 
 		 332 aa  130  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0177  transcriptional regulator, LacI family  32.92 
 
 		 343 aa  130  3e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1559  alanine racemase  32.85 
 
 		 333 aa  130  4.0000000000000003e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000066632  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2273  LacI family transcription regulator  29.6 
 
 		 333 aa  130  4.0000000000000003e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0311079  hitchhiker  0.000018406 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4795  catabolite control protein A  29.97 
 
 		 332 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4410  catabolite control protein A  29.97 
 
 		 332 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4427  catabolite control protein A  29.97 
 
 		 332 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0559  transcriptional regulator, LacI family  29.59 
 
 		 337 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2245  LacI family transcription regulator  31.81 
 
 		 338 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.115687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.44 
 
 		 337 aa  129  6e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  29.79 
 
 		 368 aa  129  7.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1120  regulatory protein, LacI  30.82 
 
 		 324 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4575  catabolite control protein A  29.66 
 
 		 332 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0520  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.23 
 
 		 338 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  hitchhiker  0.0000174135 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  30.56 
 
 		 337 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4929  catabolite control protein A  29.66 
 
 		 332 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1790  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.52 
 
 		 337 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00351385  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4813  catabolite control protein A  29.66 
 
 		 332 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4811  catabolite control protein A  29.66 
 
 		 332 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2154  LacI transcriptional regulator  28.92 
 
 		 338 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0306626  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0115  DNA-binding transcriptional regulator CytR  28.82 
 
 		 342 aa  127  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2686  transcriptional regulator, LacI family  28.57 
 
 		 340 aa  127  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.241666  normal  0.163804 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0919  LacI family transcription regulator  31.33 
 
 		 327 aa  128  2.0000000000000002e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4506  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  30.37 
 
 		 332 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4101  DNA-binding transcriptional regulator CytR  28.82 
 
 		 342 aa  127  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4790  DNA-binding transcriptional regulator CytR  28.11 
 
 		 342 aa  127  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120208 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2370  ribose operon repressor  28.36 
 
 		 338 aa  127  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0297  LacI family transcription regulator  26.72 
 
 		 340 aa  127  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2817  LacI family transcription regulator  29.2 
 
 		 339 aa  127  3e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2503  transcriptional regulator  29.2 
 
 		 339 aa  127  3e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.117668  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6160  transcriptional regulator, LacI family  29.28 
 
 		 340 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00050807 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0306  LacI family transcription regulator  28.99 
 
 		 342 aa  127  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06943  hypothetical protein  30.38 
 
 		 334 aa  127  4.0000000000000003e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0832  LacI family transcription regulator  29.45 
 
 		 346 aa  126  5e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1128  transcriptional regulator, LacI family  28.61 
 
 		 361 aa  126  6e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  30.65 
 
 		 333 aa  125  7e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0728  transcriptional regulator, LacI family  30.43 
 
 		 337 aa  125  9e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.3979  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7472  transcriptional regulator LacI family  30.46 
 
 		 339 aa  125  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0566  transcriptional regulator, LacI family  29.13 
 
 		 328 aa  125  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0961  transcriptional regulator, LacI family  30.92 
 
 		 359 aa  125  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3918  LacI family transcription regulator  28.1 
 
 		 351 aa  125  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2250  DNA-binding transcriptional regulator CytR  27.88 
 
 		 335 aa  125  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4315  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.84 
 
 		 352 aa  125  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0957821 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1883  LacI family transcription regulator  28.74 
 
 		 351 aa  124  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0216034  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2385  transcriptional regulator, LacI family  28.02 
 
 		 346 aa  124  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.171577  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2609  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.71 
 
 		 342 aa  124  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0438  alanine racemase  33.43 
 
 		 338 aa  123  4e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000864233  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4333  transcriptional regulator, LacI family  27.83 
 
 		 340 aa  123  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.706731 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1024  LacI family transcription regulator  28.48 
 
 		 342 aa  123  6e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2268  transcriptional regulator, LacI family  29.31 
 
 		 339 aa  122  6e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.580288  hitchhiker  0.000512159 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>