More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1160 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1160  glutamate racemase  100 
 
 		 276 aa  568  1e-161  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1372  glutamate racemase  56.3 
 
 		 263 aa  289  3e-77  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0698  glutamate racemase  38.82 
 
 		 259 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0699  glutamate racemase  38.82 
 
 		 259 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0264  glutamate racemase  37.97 
 
 		 276 aa  160  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.741636  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2038  glutamate racemase  39.58 
 
 		 267 aa  160  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00710975  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2832  glutamate racemase  38.43 
 
 		 275 aa  159  4e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0609148  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0487  glutamate racemase  39.09 
 
 		 288 aa  157  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0664  glutamate racemase  37.97 
 
 		 259 aa  157  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1783  glutamate racemase  37.3 
 
 		 280 aa  157  2e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0404  glutamate racemase  37.3 
 
 		 280 aa  157  2e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3675  glutamate racemase  38.08 
 
 		 258 aa  157  3e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00345939  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0260  glutamate racemase  39.26 
 
 		 278 aa  155  7e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00172375 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0275  glutamate racemase  38.43 
 
 		 278 aa  155  8e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.147503  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2923  glutamate racemase  37.86 
 
 		 272 aa  154  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1296  glutamate racemase  35.16 
 
 		 259 aa  154  1e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0278  glutamate racemase  37.6 
 
 		 264 aa  154  1e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.424849  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0079  glutamate racemase  40.49 
 
 		 246 aa  154  1e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2724  glutamate racemase  37.8 
 
 		 266 aa  154  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0518  glutamate racemase  37.6 
 
 		 276 aa  152  4e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000716913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1411  glutamate racemase  36.63 
 
 		 272 aa  151  8.999999999999999e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.093968  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1522  glutamate racemase  35.71 
 
 		 265 aa  151  8.999999999999999e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.167317  normal  0.205372 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0153  glutamate racemase  38.98 
 
 		 263 aa  151  1e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000323357  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0547  glutamate racemase  37.19 
 
 		 276 aa  151  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.77942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3204  glutamate racemase  35.77 
 
 		 267 aa  150  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.685477  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0527  glutamate racemase  35.71 
 
 		 264 aa  150  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06751  putative aspartate and glutamate racemases:glutamate racemase  37.3 
 
 		 265 aa  150  2e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0479  glutamate racemase  35.1 
 
 		 265 aa  149  4e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.553791  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0054  glutamate racemase  36.89 
 
 		 265 aa  147  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.382436  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1508  glutamate racemase  40.67 
 
 		 273 aa  148  1.0000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1937  glutamate racemase  37.85 
 
 		 268 aa  146  4.0000000000000006e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000512985  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4379  glutamate racemase  34.62 
 
 		 269 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.119134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4220  glutamate racemase  34.62 
 
 		 269 aa  144  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.328787  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4573  glutamate racemase  34.62 
 
 		 269 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0632  glutamate racemase  34.62 
 
 		 269 aa  144  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000756048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4603  glutamate racemase  34.62 
 
 		 269 aa  144  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.171271  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2743  glutamate racemase  39.25 
 
 		 285 aa  144  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.677331  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4717  glutamate racemase  34.62 
 
 		 269 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000252581  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4328  glutamate racemase  34.62 
 
 		 267 aa  144  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2602  glutamate racemase  36.36 
 
 		 264 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4589  glutamate racemase  34.88 
 
 		 269 aa  143  4e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.547606  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4623  glutamate racemase  34.88 
 
 		 269 aa  143  4e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000438915  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3790  glutamate racemase  39.72 
 
 		 270 aa  143  4e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0490998  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4404  glutamate racemase  34.65 
 
 		 295 aa  142  5e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1543  glutamate racemase  34.68 
 
 		 277 aa  142  7e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1321  glutamate racemase  31.64 
 
 		 262 aa  141  9.999999999999999e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1315  glutamate racemase  35.56 
 
 		 282 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.278048  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4236  glutamate racemase  34.23 
 
 		 269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0638  glutamate racemase  35.92 
 
 		 256 aa  140  3e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0541  glutamate racemase  39.44 
 
 		 267 aa  139  3.9999999999999997e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000256058  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3010  glutamate racemase  35.27 
 
 		 275 aa  139  4.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.067434 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3052  glutamate racemase  35.27 
 
 		 275 aa  139  4.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.580902 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2361  glutamate racemase  33.46 
 
 		 289 aa  139  6e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.566119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1403  glutamate racemase  36.5 
 
 		 271 aa  139  6e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.011176  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0708  glutamate racemase  34.63 
 
 		 259 aa  138  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.235687 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3231  glutamate racemase  38.18 
 
 		 272 aa  138  8.999999999999999e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.041198  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0573  glutamate racemase  34.36 
 
 		 267 aa  138  1e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1602  glutamate racemase  35.66 
 
 		 281 aa  137  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.151201  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0161  glutamate racemase  35.02 
 
 		 270 aa  136  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0534068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0987  glutamate racemase  38.07 
 
 		 260 aa  136  4e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.507565  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2810  glutamate racemase  38.57 
 
 		 308 aa  136  4e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09110  glutamate racemase  32.51 
 
 		 307 aa  136  4e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.644138  normal  0.0830373 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06731  putative aspartate and glutamate racemases:glutamate racemase  31.15 
 
 		 264 aa  135  5e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.278101  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06821  putative aspartate and glutamate racemases:glutamate racemase  33.06 
 
 		 264 aa  135  7.000000000000001e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.876328  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1015  glutamate racemase  32.51 
 
 		 264 aa  135  9e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1848  glutamate racemase  37.85 
 
 		 281 aa  134  9.999999999999999e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000532867  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0590  glutamate racemase  33.47 
 
 		 293 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.169456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1276  glutamate racemase  35.27 
 
 		 295 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2202  glutamate racemase  38.32 
 
 		 282 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06431  putative aspartate and glutamate racemases:glutamate racemase  31.15 
 
 		 264 aa  135  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1797  glutamate racemase  35.86 
 
 		 278 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1824  glutamate racemase  35.25 
 
 		 247 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0617  glutamate racemase  30.74 
 
 		 264 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1643  glutamate racemase  35.25 
 
 		 247 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1600  glutamate racemase  34.71 
 
 		 264 aa  133  3e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0129686  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0848  glutamate racemase  35.06 
 
 		 264 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0538  glutamate racemase  37.84 
 
 		 261 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000109629  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2509  glutamate racemase  34.91 
 
 		 291 aa  132  6e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.194908 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1554  glutamate racemase  34.29 
 
 		 247 aa  132  6.999999999999999e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00221253  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2003  glutamate racemase  35.54 
 
 		 269 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.520225  normal  0.08167 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1238  glutamate racemase  39.71 
 
 		 268 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2013  glutamate racemase  35.25 
 
 		 247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1700  glutamate racemase  33.47 
 
 		 301 aa  130  3e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0499651  normal  0.299923 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0940  glutamate racemase  32.95 
 
 		 277 aa  130  3e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.389602 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1955  glutamate racemase  32.14 
 
 		 303 aa  130  3e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00243974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29140  glutamate racemase  34.62 
 
 		 265 aa  129  5.0000000000000004e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.818975 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1686  glutamate racemase  34.02 
 
 		 263 aa  129  6e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.000161224  hitchhiker  0.00000616393 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0754  glutamate racemase  35.38 
 
 		 268 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0346  glutamate racemase  33.33 
 
 		 274 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.633772  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1136  glutamate racemase  30.77 
 
 		 265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.204541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1214  glutamate racemase  32.37 
 
 		 268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11368  glutamate racemase  32.23 
 
 		 271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110986  normal  0.482837 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1732  Glutamate racemase  33.21 
 
 		 276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.648223 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0624  glutamate racemase  36.02 
 
 		 270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000306047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1755  glutamate racemase  31.66 
 
 		 266 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000954192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1467  glutamate racemase  31.72 
 
 		 292 aa  125  5e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0107271  normal  0.23474 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1323  glutamate racemase  31.33 
 
 		 285 aa  126  5e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.123332  hitchhiker  0.00249811 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4218  glutamate racemase  32.22 
 
 		 285 aa  125  6e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.574186  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7556  glutamate racemase  33.33 
 
 		 295 aa  125  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2583  glutamate racemase  31.68 
 
 		 312 aa  125  7e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00016554  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>