More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0076 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0076  aminotransferase class-III  100 
 
 
377 aa  766    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1879  aminotransferase class-III  49.34 
 
 
378 aa  355  7.999999999999999e-97  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1220  aminotransferase class-III  47.63 
 
 
379 aa  303  3.0000000000000004e-81  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1710  acetylornithine aminotransferase  37.73 
 
 
392 aa  263  3e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0925352  hitchhiker  0.00335003 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2440  acetylornithine aminotransferase  37.5 
 
 
388 aa  262  6e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.493949  normal  0.0446911 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3311  acetylornithine aminotransferase  39.95 
 
 
390 aa  257  2e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0246414  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3527  acetylornithine aminotransferase  38.58 
 
 
395 aa  255  9e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.327175  normal  0.819815 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  36.92 
 
 
394 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2493  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.89 
 
 
397 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0739  acetylornithine aminotransferase  38.99 
 
 
386 aa  252  6e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.791606  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1072  acetylornithine aminotransferase  39.07 
 
 
385 aa  252  9.000000000000001e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0280572  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0637  acetylornithine aminotransferase  35.68 
 
 
418 aa  251  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00130856  normal  0.274942 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2079  acetylornithine aminotransferase  36.27 
 
 
391 aa  250  2e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4556  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  36.64 
 
 
396 aa  250  3e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.974298 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4075  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  36.13 
 
 
396 aa  249  4e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3612  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.4 
 
 
382 aa  249  5e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.98573  normal  0.143334 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4442  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  35.71 
 
 
396 aa  249  6e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.977458  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1596  acetylornithine aminotransferase  38.27 
 
 
386 aa  249  6e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0353  acetylornithine aminotransferase  36.03 
 
 
395 aa  249  8e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00220895 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  36.1 
 
 
396 aa  248  1e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1040  acetylornithine aminotransferase  38.82 
 
 
385 aa  247  2e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000111021  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2288  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  37.96 
 
 
396 aa  248  2e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.37355  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2154  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.73 
 
 
401 aa  246  4e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000952275  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3058  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.84 
 
 
402 aa  245  6.999999999999999e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00328868  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1102  acetylornithine aminotransferase  36.51 
 
 
394 aa  245  9e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5468  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.68 
 
 
436 aa  245  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0529885 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  35.51 
 
 
395 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1041  acetylornithine aminotransferase  36.24 
 
 
390 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.370932  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1901  acetylornithine aminotransferase  34.47 
 
 
400 aa  244  1.9999999999999999e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.133726  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1698  acetylornithine aminotransferase  37.07 
 
 
394 aa  244  3e-63  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1260  acetylornithine aminotransferase  37.7 
 
 
399 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.161601 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3172  acetylornithine aminotransferase  36.87 
 
 
444 aa  242  6e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.22064  normal  0.239102 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1129  acetylornithine aminotransferase  39.2 
 
 
375 aa  242  9e-63  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2013  acetylornithine aminotransferase  35.04 
 
 
418 aa  241  1e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.152714 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1986  acetylornithine aminotransferase  35.04 
 
 
418 aa  241  1e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0946  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  34.22 
 
 
398 aa  241  1e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104291  normal  0.0999204 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2838  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.69 
 
 
393 aa  241  2e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0375409  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0858  acetylornithine aminotransferase  36.12 
 
 
377 aa  240  2e-62  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0982  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  36.01 
 
 
410 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21710  acetylornithine/succinylornithine aminotransferase  38.13 
 
 
419 aa  240  2.9999999999999997e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3040  acetylornithine aminotransferase  34.88 
 
 
389 aa  240  4e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2179  acetylornithine aminotransferase  35.23 
 
 
398 aa  239  4e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.569965  normal  0.442274 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0540  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.22 
 
 
412 aa  239  5e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000106497  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2429  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  35.6 
 
 
393 aa  239  5e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3744  acetylornithine aminotransferase  37.08 
 
 
391 aa  239  5.999999999999999e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000932106 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0533  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  34.22 
 
 
394 aa  239  6.999999999999999e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0772  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  36.1 
 
 
399 aa  238  9e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.200689  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1094  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.43 
 
 
387 aa  238  1e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1784  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.93 
 
 
385 aa  238  1e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.74918  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0426  acetylornithine aminotransferase  35.14 
 
 
396 aa  238  1e-61  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0269327  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2028  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.29 
 
 
399 aa  238  1e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.832641  normal  0.501384 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0068  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.27 
 
 
375 aa  238  1e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.413029  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  34.97 
 
 
402 aa  238  2e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2969  acetylornithine aminotransferase  38.9 
 
 
402 aa  238  2e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.435478  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3013  acetylornithine aminotransferase  38.9 
 
 
402 aa  238  2e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.686794 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2984  acetylornithine aminotransferase  38.36 
 
 
402 aa  237  2e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0590766 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0569  acetylornithine aminotransferase  35.57 
 
 
400 aa  237  3e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.160273  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0225  acetylornithine aminotransferase  36.53 
 
 
393 aa  236  3e-61  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0570  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  36.93 
 
 
388 aa  237  3e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0406  acetylornithine aminotransferase  36.93 
 
 
388 aa  237  3e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6074  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.11 
 
 
400 aa  236  4e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.882536  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2898  acetylornithine aminotransferase  34.63 
 
 
389 aa  236  4e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1164  acetylornithine aminotransferase  34.04 
 
 
398 aa  236  4e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.581434  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0593  acetylornithine aminotransferase  35.64 
 
 
397 aa  236  5.0000000000000005e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.642559  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0483  acetylornithine aminotransferase  34.73 
 
 
395 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1290  acetylornithine transaminase protein  35.75 
 
 
401 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  36.84 
 
 
399 aa  236  6e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1740  acetylornithine aminotransferase  36.68 
 
 
414 aa  235  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00212917 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1866  acetylornithine aminotransferase  38.13 
 
 
400 aa  234  1.0000000000000001e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2872  acetylornithine aminotransferase  33.68 
 
 
397 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1901  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  38.57 
 
 
374 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2767  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.17 
 
 
403 aa  234  2.0000000000000002e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1842  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  34.99 
 
 
399 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.716815  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2121  acetylornithine aminotransferase  32.65 
 
 
404 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00994118  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2464  acetylornithine aminotransferase  34.85 
 
 
392 aa  233  3e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2826  acetylornithine aminotransferase  36.15 
 
 
386 aa  232  6e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6536  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  36.64 
 
 
397 aa  232  6e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.396008  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7457  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  36.73 
 
 
397 aa  232  6e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.484657  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5154  acetylornithine aminotransferase  33.5 
 
 
426 aa  233  6e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000762221 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3002  acetylornithine aminotransferase  34.22 
 
 
398 aa  232  7.000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.555766  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0394  acetylornithine transaminase protein  35.66 
 
 
403 aa  232  8.000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3003  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  33.58 
 
 
427 aa  232  8.000000000000001e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1138  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.83 
 
 
388 aa  231  1e-59  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0152211  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3065  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.97 
 
 
401 aa  231  1e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110355  normal  0.664029 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4128  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.25 
 
 
396 aa  231  1e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0278283  decreased coverage  0.00000134579 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2618  acetylornithine aminotransferase  34.88 
 
 
400 aa  231  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00459682  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2429  acetylornithine aminotransferase  34.22 
 
 
398 aa  231  2e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1851  acetylornithine aminotransferase  34.93 
 
 
394 aa  231  2e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3025  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  36.1 
 
 
393 aa  231  2e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.048422  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0313  acetylornithine aminotransferase  36.81 
 
 
380 aa  231  2e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0875  aminotransferase class-III  34.18 
 
 
395 aa  231  2e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.171491  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1258  acetylornithine aminotransferase  34.72 
 
 
398 aa  230  3e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00185503  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0278  acetylornithine aminotransferase  36.79 
 
 
393 aa  230  3e-59  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.368086  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0842  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  35.42 
 
 
399 aa  230  3e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0215856 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3708  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  33.51 
 
 
412 aa  230  3e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.339324  normal  0.0114471 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  34.54 
 
 
396 aa  230  3e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3033  acetylornithine aminotransferase  35.28 
 
 
390 aa  230  4e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.850335  normal  0.390329 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1409  acetylornithine transaminase protein  36.15 
 
 
396 aa  229  4e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111439  normal  0.291313 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1907  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  33.94 
 
 
387 aa  230  4e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0119007  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0481  acetylornithine transaminase protein  37.04 
 
 
402 aa  229  5e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>