More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1879 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1879  aminotransferase class-III  100 
 
 		 378 aa  749    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0076  aminotransferase class-III  49.34 
 
 		 377 aa  345  6e-94  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1220  aminotransferase class-III  51.05 
 
 		 379 aa  345  8.999999999999999e-94  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0739  acetylornithine aminotransferase  43.54 
 
 		 386 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.791606  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3309  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.26 
 
 		 393 aa  281  9e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1040  acetylornithine aminotransferase  40.77 
 
 		 385 aa  280  3e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000111021  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2288  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  38.38 
 
 		 396 aa  280  3e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.37355  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1072  acetylornithine aminotransferase  40.26 
 
 		 385 aa  279  5e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0280572  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0593  acetylornithine aminotransferase  39.32 
 
 		 397 aa  279  6e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.642559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1957  acetylornithine aminotransferase  39.47 
 
 		 399 aa  276  5e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000196367  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1583  acetylornithine aminotransferase  37.37 
 
 		 401 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0172924 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  37.66 
 
 		 396 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1842  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  36.81 
 
 		 399 aa  273  3e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.716815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0638  acetylornithine aminotransferase  38.79 
 
 		 397 aa  273  3e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0503  acetylornithine aminotransferase  37.73 
 
 		 398 aa  271  2e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0609  acetylornithine aminotransferase  39.05 
 
 		 399 aa  270  2.9999999999999997e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.110616  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0540  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.36 
 
 		 412 aa  268  8e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000106497  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3040  acetylornithine aminotransferase  36.43 
 
 		 389 aa  267  2e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2898  acetylornithine aminotransferase  36.43 
 
 		 389 aa  267  2e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17211  acetylornithine aminotransferase  37.5 
 
 		 420 aa  266  4e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2440  acetylornithine aminotransferase  37.56 
 
 		 388 aa  266  4e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.493949  normal  0.0446911 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  37.82 
 
 		 394 aa  266  5e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1740  acetylornithine aminotransferase  34.66 
 
 		 414 aa  266  5.999999999999999e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212917 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1094  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.84 
 
 		 387 aa  265  8e-70  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1596  acetylornithine aminotransferase  40 
 
 		 386 aa  264  2e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0734  acetylornithine aminotransferase  38.26 
 
 		 405 aa  264  2e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0867  acetylornithine aminotransferase  36.99 
 
 		 393 aa  263  3e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13491  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  36.5 
 
 		 420 aa  262  6.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3172  acetylornithine aminotransferase  36.29 
 
 		 444 aa  261  1e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.22064  normal  0.239102 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1907  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.37 
 
 		 387 aa  260  3e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0119007  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.7 
 
 		 395 aa  259  4e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3065  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.67 
 
 		 401 aa  259  7e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110355  normal  0.664029 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02850  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.95 
 
 		 399 aa  258  9e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000577952  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0946  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  34.2 
 
 		 398 aa  258  1e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104291  normal  0.0999204 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1698  acetylornithine aminotransferase  37.53 
 
 		 394 aa  257  2e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2079  acetylornithine aminotransferase  36.18 
 
 		 391 aa  257  2e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0533  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  35.6 
 
 		 394 aa  257  2e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2154  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.37 
 
 		 401 aa  257  2e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000952275  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0570  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  34.79 
 
 		 388 aa  256  3e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0406  acetylornithine aminotransferase  34.79 
 
 		 388 aa  256  3e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1710  acetylornithine aminotransferase  36.62 
 
 		 392 aa  257  3e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0925352  hitchhiker  0.00335003 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  35.57 
 
 		 402 aa  255  8e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3311  acetylornithine aminotransferase  36.1 
 
 		 390 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0246414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1041  acetylornithine aminotransferase  35.84 
 
 		 390 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.370932  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1102  acetylornithine aminotransferase  36.32 
 
 		 394 aa  254  1.0000000000000001e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0842  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  34.46 
 
 		 399 aa  254  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0215856 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19841  acetylornithine aminotransferase  33.67 
 
 		 418 aa  254  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0786665 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1114  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  35.77 
 
 		 420 aa  254  2.0000000000000002e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.922193  normal  0.423827 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2151  acetylornithine aminotransferase  33.77 
 
 		 405 aa  253  3e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0731978 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3741  acetylornithine aminotransferase  36.25 
 
 		 397 aa  254  3e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0569  acetylornithine aminotransferase  36.6 
 
 		 400 aa  253  3e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.160273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0353  acetylornithine aminotransferase  36.88 
 
 		 395 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00220895 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3612  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.87 
 
 		 382 aa  253  4.0000000000000004e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.98573  normal  0.143334 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1260  acetylornithine aminotransferase  35.64 
 
 		 399 aa  252  7e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.161601 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1371  acetylornithine aminotransferase  36.88 
 
 		 379 aa  252  8.000000000000001e-66  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1224  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  35.32 
 
 		 399 aa  252  9.000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.803293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2826  acetylornithine aminotransferase  39.21 
 
 		 386 aa  251  1e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1397  acetylornithine aminotransferase  40.15 
 
 		 417 aa  251  1e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3636  acetylornithine aminotransferase  35.99 
 
 		 397 aa  251  1e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14621  acetylornithine aminotransferase  37.85 
 
 		 417 aa  251  1e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_50577  acetylornithine aminotransferase  34.61 
 
 		 476 aa  251  2e-65  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0640  acetylornithine aminotransferase  38.34 
 
 		 403 aa  250  3e-65  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.41902  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0637  acetylornithine aminotransferase  34.6 
 
 		 418 aa  250  3e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00130856  normal  0.274942 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5468  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  34.7 
 
 		 436 aa  249  5e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0529885 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1346  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  35.94 
 
 		 399 aa  249  6e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2429  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  35.16 
 
 		 393 aa  249  6e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1784  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  36.65 
 
 		 385 aa  249  8e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.74918  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3744  acetylornithine aminotransferase  34.88 
 
 		 391 aa  249  8e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000932106 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3962  acetylornithine aminotransferase  39.79 
 
 		 386 aa  248  9e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00766837  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0426  acetylornithine aminotransferase  37.14 
 
 		 396 aa  248  1e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0269327  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3527  acetylornithine aminotransferase  35.29 
 
 		 395 aa  248  1e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.327175  normal  0.819815 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2464  acetylornithine aminotransferase  33.59 
 
 		 392 aa  248  1e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1851  acetylornithine aminotransferase  35.7 
 
 		 394 aa  248  1e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21710  acetylornithine/succinylornithine aminotransferase  35.22 
 
 		 419 aa  248  1e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0009  acetylornithine transaminase protein  34.29 
 
 		 401 aa  248  1e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  35.13 
 
 		 399 aa  248  2e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  35.84 
 
 		 395 aa  248  2e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1951  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  36.75 
 
 		 398 aa  248  2e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.620278  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0063  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  35.96 
 
 		 396 aa  247  2e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.857354  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0871  acetylornithine aminotransferase  36.34 
 
 		 403 aa  246  4e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6074  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  36.51 
 
 		 400 aa  246  4e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.882536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0772  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  35.94 
 
 		 399 aa  246  4.9999999999999997e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.200689  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2676  acetylornithine aminotransferase  33.86 
 
 		 391 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2179  acetylornithine aminotransferase  35.86 
 
 		 398 aa  246  6e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.569965  normal  0.442274 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6536  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  34.47 
 
 		 397 aa  246  6e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.396008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  35.31 
 
 		 396 aa  246  6.999999999999999e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15001  acetylornithine aminotransferase  38.36 
 
 		 391 aa  245  8e-64  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4636  acetylornithine aminotransferase  34.64 
 
 		 395 aa  245  8e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621133  normal  0.175641 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4263  acetylornithine aminotransferase  40.16 
 
 		 386 aa  245  9e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2872  acetylornithine aminotransferase  34.03 
 
 		 397 aa  245  9e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1258  acetylornithine aminotransferase  36.2 
 
 		 398 aa  245  9.999999999999999e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00185503  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7457  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  34.47 
 
 		 397 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.484657  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1164  acetylornithine aminotransferase  35.75 
 
 		 398 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.581434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3150  acetylornithine aminotransferase  35.75 
 
 		 399 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0914  acetylornithine aminotransferase  32.73 
 
 		 399 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0626  acetylornithine aminotransferase  34.96 
 
 		 426 aa  244  1.9999999999999999e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.882273  normal  0.369402 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_19153  predicted protein  38.04 
 
 		 384 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5259  acetylornithine transaminase protein  34.39 
 
 		 403 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3158  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  34.46 
 
 		 416 aa  243  3e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3058  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  36.07 
 
 		 402 aa  243  3e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00328868  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>