More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0888 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0620  lysyl-tRNA synthetase  75.25 
 
 		 503 aa  799    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1365  lysyl-tRNA synthetase  82.44 
 
 		 532 aa  872    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.040149  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2234  lysyl-tRNA synthetase  69.59 
 
 		 504 aa  716    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2993  lysyl-tRNA synthetase  85.23 
 
 		 501 aa  901    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0888  lysyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 501 aa  1031    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3384  lysyl-tRNA synthetase  68.85 
 
 		 502 aa  696    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3742  lysyl-tRNA synthetase  62.88 
 
 		 496 aa  616  1e-175  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.464722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1248  lysyl-tRNA synthetase  59.23 
 
 		 494 aa  597  1e-169  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.88178e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2360  lysyl-tRNA synthetase, class-2  59.35 
 
 		 491 aa  584  1.0000000000000001e-165  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3014  lysyl-tRNA synthetase  58.22 
 
 		 503 aa  581  1.0000000000000001e-165  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.270584  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2271  lysyl-tRNA synthetase  58.94 
 
 		 491 aa  581  1e-164  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0757  lysyl-tRNA synthetase  57.81 
 
 		 492 aa  581  1e-164  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0478688  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3424  lysyl-tRNA synthetase  56.8 
 
 		 492 aa  568  1e-161  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3240  lysyl-tRNA synthetase  56.94 
 
 		 494 aa  568  1e-161  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000008657  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0836  lysyl-tRNA synthetase  56.8 
 
 		 492 aa  569  1e-161  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000359337  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2847  lysyl-tRNA synthetase  56.12 
 
 		 484 aa  548  1e-155  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0422  lysyl-tRNA synthetase  55.18 
 
 		 511 aa  547  1e-154  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0163  lysyl-tRNA synthetase  53.46 
 
 		 488 aa  542  1e-153  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000142799  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1462  lysyl-tRNA synthetase  54.8 
 
 		 499 aa  538  9.999999999999999e-153  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.485699  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0251  lysyl-tRNA synthetase  53.4 
 
 		 499 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000260184  normal  0.314985 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0301  lysyl-tRNA synthetase  55 
 
 		 496 aa  536  1e-151  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2848  lysyl-tRNA synthetase  53.75 
 
 		 501 aa  535  1e-151  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.266623 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1647  lysyl-tRNA synthetase  54.99 
 
 		 489 aa  536  1e-151  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0075  lysyl-tRNA synthetase  52.83 
 
 		 494 aa  531  1e-150  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0152  lysyl-tRNA synthetase  54.4 
 
 		 489 aa  533  1e-150  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000016249  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04000  lysine tRNA synthetase, inducible  52.42 
 
 		 505 aa  530  1e-149  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3862  lysyl-tRNA synthetase  52.42 
 
 		 505 aa  529  1e-149  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00750  Lysyl-tRNA synthetase  52.31 
 
 		 491 aa  529  1e-149  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253681  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3370  lysyl-tRNA synthetase  54.6 
 
 		 505 aa  528  1e-149  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.234173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4370  lysyl-tRNA synthetase  52.42 
 
 		 505 aa  529  1e-149  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.119358  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5645  lysyl-tRNA synthetase  52.42 
 
 		 505 aa  529  1e-149  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03962  hypothetical protein  52.42 
 
 		 505 aa  530  1e-149  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0116  lysyl-tRNA synthetase  51.9 
 
 		 493 aa  528  1e-149  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0354257  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0983  lysyl-tRNA synthetase  55.26 
 
 		 496 aa  531  1e-149  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4180  lysyl-tRNA synthetase  52.82 
 
 		 505 aa  528  1e-149  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4598  lysyl-tRNA synthetase  52.42 
 
 		 505 aa  529  1e-149  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.221304  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02722  lysine tRNA synthetase, constitutive  52.62 
 
 		 505 aa  527  1e-148  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.639926  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0802  lysyl-tRNA synthetase  52.62 
 
 		 505 aa  527  1e-148  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000973431  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0175  lysyl-tRNA synthetase  53.13 
 
 		 510 aa  526  1e-148  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3422  lysyl-tRNA synthetase  52.72 
 
 		 505 aa  526  1e-148  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.231607  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0075  lysyl-tRNA synthetase  51.02 
 
 		 499 aa  526  1e-148  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3023  lysyl-tRNA synthetase  52.62 
 
 		 505 aa  526  1e-148  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0076  lysyl-tRNA synthetase  51.02 
 
 		 499 aa  526  1e-148  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0629827  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0072  lysyl-tRNA synthetase  51.02 
 
 		 499 aa  526  1e-148  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0072  lysyl-tRNA synthetase  51.02 
 
 		 499 aa  526  1e-148  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3309  lysyl-tRNA synthetase  52.62 
 
 		 505 aa  527  1e-148  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.97294  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02685  hypothetical protein  52.62 
 
 		 505 aa  527  1e-148  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.803561  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3216  lysyl-tRNA synthetase  52.62 
 
 		 505 aa  527  1e-148  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0078  lysyl-tRNA synthetase  52.23 
 
 		 494 aa  525  1e-148  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.312229  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0076  lysyl-tRNA synthetase  51.02 
 
 		 499 aa  526  1e-148  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0819  lysyl-tRNA synthetase  52.62 
 
 		 505 aa  527  1e-148  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3049  lysyl-tRNA synthetase  52.62 
 
 		 505 aa  527  1e-148  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0088  lysyl-tRNA synthetase  51.02 
 
 		 499 aa  526  1e-148  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.863253  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4684  lysyl-tRNA synthetase  52.22 
 
 		 505 aa  528  1e-148  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3898  lysyl-tRNA synthetase  52.22 
 
 		 505 aa  528  1e-148  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0085  lysyl-tRNA synthetase  51.22 
 
 		 499 aa  527  1e-148  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000436352 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1438  lysyl-tRNA synthetase  54.49 
 
 		 501 aa  526  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3274  lysyl-tRNA synthetase  52.53 
 
 		 505 aa  525  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1152  lysyl-tRNA synthetase  52.79 
 
 		 508 aa  522  1e-147  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.562013  normal  0.115463 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0084  lysyl-tRNA synthetase  50.61 
 
 		 499 aa  524  1e-147  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.016168  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0924  lysyl-tRNA synthetase  52.8 
 
 		 505 aa  523  1e-147  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1957  lysyl-tRNA synthetase  53.24 
 
 		 513 aa  522  1e-147  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3851  lysyl-tRNA synthetase  52.8 
 
 		 505 aa  523  1e-147  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0982146 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3308  lysyl-tRNA synthetase  51.92 
 
 		 505 aa  522  1e-147  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0072  lysyl-tRNA synthetase  50.81 
 
 		 499 aa  521  1e-147  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.407963  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0865  lysyl-tRNA synthetase  52.08 
 
 		 505 aa  524  1e-147  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3208  lysyl-tRNA synthetase  52.53 
 
 		 505 aa  525  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.563866 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3376  lysyl-tRNA synthetase  52.53 
 
 		 505 aa  525  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3196  lysyl-tRNA synthetase  52.53 
 
 		 505 aa  525  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.442927  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3296  lysyl-tRNA synthetase  52.18 
 
 		 505 aa  523  1e-147  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16530  lysyl-tRNA synthetase  53.97 
 
 		 501 aa  521  1e-147  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.530256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0883  lysyl-tRNA synthetase  52.8 
 
 		 505 aa  523  1e-147  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1032  lysyl-tRNA synthetase  53.41 
 
 		 501 aa  523  1e-147  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.565305  normal  0.238368 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3271  lysyl-tRNA synthetase  52.53 
 
 		 505 aa  525  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1450  lysyl-tRNA synthetase  53.32 
 
 		 512 aa  521  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.499845 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1561  lysyl-tRNA synthetase  52.72 
 
 		 513 aa  520  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.274992 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5959  lysyl-tRNA synthetase  52.11 
 
 		 508 aa  518  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5232  lysyl-tRNA synthetase  50.61 
 
 		 499 aa  521  1e-146  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0118491  hitchhiker  0.00000000172197 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2571  lysyl-tRNA synthetase  52.52 
 
 		 518 aa  520  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158431  normal  0.0253603 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0072  lysyl-tRNA synthetase  50.41 
 
 		 499 aa  520  1e-146  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000341012  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2136  lysyl-tRNA synthetase  52.11 
 
 		 508 aa  518  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.251549 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2118  lysyl-tRNA synthetase  52.11 
 
 		 508 aa  518  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414372  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5424  lysyl-tRNA synthetase  52.11 
 
 		 524 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3888  lysyl-tRNA synthetase  52.62 
 
 		 505 aa  518  1.0000000000000001e-145  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00071  lysyl-tRNA synthetase  52.51 
 
 		 505 aa  516  1.0000000000000001e-145  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.381624  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0649  lysyl-tRNA synthetase  52.52 
 
 		 505 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2028  lysyl-tRNA synthetase  51.99 
 
 		 508 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2155  lysyl-tRNA synthetase  51.99 
 
 		 508 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.351617  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1472  lysyl-tRNA synthetase  51 
 
 		 514 aa  512  1e-144  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0640  lysyl-tRNA synthetase  55.13 
 
 		 496 aa  513  1e-144  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0480  lysyl-tRNA synthetase  55.13 
 
 		 496 aa  513  1e-144  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1480  lysyl-tRNA synthetase  52.39 
 
 		 508 aa  514  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1700  lysyl-tRNA synthetase  52.39 
 
 		 508 aa  514  1e-144  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.816716  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1883  lysyl-tRNA synthetase  52.19 
 
 		 508 aa  513  1e-144  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0797  lysyl-tRNA synthetase  52.29 
 
 		 509 aa  511  1e-144  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0164991 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3111  lysyl-tRNA synthetase  52.39 
 
 		 508 aa  514  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1642  lysyl-tRNA synthetase  51.2 
 
 		 498 aa  512  1e-144  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.573049  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0893  lysyl-tRNA synthetase  51.49 
 
 		 514 aa  513  1e-144  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.246749  normal  0.0933962 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0398  lysyl-tRNA synthetase  51.81 
 
 		 506 aa  511  1e-144  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.575675  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2207  lysyl-tRNA synthetase  52.39 
 
 		 508 aa  514  1e-144  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>