More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0027 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0101  indolepyruvate/phenylpyruvate decarboxylase  57.74 
 
 
542 aa  636  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.438272  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2331  putative phenylpyruvate decarboxylase  66.49 
 
 
555 aa  745  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00138899  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0027  indolepyruvate/phenylpyruvate decarboxylase  100 
 
 
572 aa  1152  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.173161 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0518  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding protein  57.37 
 
 
540 aa  629  1e-179  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2719  phenylpyruvate decarboxylase  56.27 
 
 
553 aa  586  1e-166  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.572163  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3526  indolepyruvate/phenylpyruvate decarboxylase  51.68 
 
 
543 aa  554  1e-156  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0476584  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3027  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  51.94 
 
 
543 aa  549  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.306897  normal  0.499119 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0512  indole-3-pyruvate decarboxylase  52.34 
 
 
545 aa  542  1e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  0.198842 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2425  indole-3-pyruvate decarboxylase  51.31 
 
 
543 aa  541  1e-152  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0467064 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4114  thiamine pyrophosphate enzyme  36.51 
 
 
541 aa  321  3e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.178401 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1571  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  33.87 
 
 
545 aa  298  2e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0887  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  31.94 
 
 
557 aa  289  1e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2858  pyruvate decarboxylase  34.46 
 
 
547 aa  287  3e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0996  thiamine pyrophosphate enzyme family decarboxylase  33.39 
 
 
549 aa  263  4e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.604603  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2218  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  29.31 
 
 
552 aa  246  6e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.209747 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2156  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  29.31 
 
 
552 aa  246  6e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4879  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  30.28 
 
 
546 aa  243  5e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2390  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  32.42 
 
 
550 aa  237  4e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.517187  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2517  indolepyruvate decarboxylase, putative  23.67 
 
 
561 aa  185  2e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  9.21209e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2507  putative indolepyruvate decarboxylase  22.98 
 
 
558 aa  181  4e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2279  indolepyruvate decarboxylase  23.16 
 
 
561 aa  180  7e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000128489  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04888  Pyruvate decarboxylase (EC 4.1.1.1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P87208]  26.99 
 
 
568 aa  179  9e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0997848  normal  0.116699 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2440  putative indolepyruvate decarboxylase  23.06 
 
 
558 aa  179  9e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00745629  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2486  indolepyruvate decarboxylase  22.64 
 
 
561 aa  177  3e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00246816  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2311  indolepyruvate decarboxylase  22.64 
 
 
561 aa  177  3e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.252232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2232  indolepyruvate decarboxylase  22.81 
 
 
561 aa  176  1e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.224159  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2581  putative indolepyruvate decarboxylase  23.29 
 
 
558 aa  175  3e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  2.25581e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2242  indole-3-pyruvate decarboxylase  22.85 
 
 
549 aa  172  2e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1794  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  26.97 
 
 
547 aa  162  1e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.163596  normal  0.90828 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3412  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  26.91 
 
 
553 aa  161  3e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2434  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  25.68 
 
 
572 aa  161  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.118986  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0858  putative pyruvate decarboxylase  26.98 
 
 
556 aa  159  1e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.434282  normal  0.563377 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1429  indolepyruvate decarboxylase  24.37 
 
 
542 aa  157  4e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0493266 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00950  pyruvate decarboxylase, putative  22.9 
 
 
713 aa  156  8e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1754  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  26.44 
 
 
572 aa  156  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0178  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  23.5 
 
 
546 aa  154  3e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0173  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  23.5 
 
 
546 aa  154  3e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3426  indolepyruvate decarboxylase  25.86 
 
 
555 aa  153  8e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.310622  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2923  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  26.24 
 
 
552 aa  152  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.356965  normal  0.0604993 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5992  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  29.52 
 
 
551 aa  152  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0792937 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2362  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  26.06 
 
 
553 aa  151  3e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0964  pyruvate decarboxylase  26.07 
 
 
556 aa  151  4e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.719154  unclonable  4.49891e-05 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3836  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  23.75 
 
 
586 aa  148  3e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.742198  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1162  hypothetical protein  24.87 
 
 
559 aa  147  7e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0182  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  28.21 
 
 
561 aa  146  8e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.217855 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1157  hypothetical protein  24.87 
 
 
559 aa  145  1e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86443  pyruvate decarboxylase  24.57 
 
 
570 aa  141  4e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08396  pyruvate decarboxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G00750)  23.75 
 
 
575 aa  140  9e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0109  putative pyruvate decarboxylase  25.95 
 
 
580 aa  139  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.731177  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0992  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  24.56 
 
 
558 aa  138  3e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3389  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  28.4 
 
 
562 aa  133  8e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.887563  normal  0.228354 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3108  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  24.83 
 
 
571 aa  133  1e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0303  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  24.02 
 
 
559 aa  129  1e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.296158  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3230  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.75 
 
 
644 aa  127  4e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0734  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  24.35 
 
 
526 aa  127  4e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2639  indole-3-pyruvate decarboxylase  24.92 
 
 
550 aa  127  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0544  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.5 
 
 
602 aa  127  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2663  indole-3-pyruvate decarboxylase  24.75 
 
 
550 aa  126  8e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.603651 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2548  indole-3-pyruvate decarboxylase  24.75 
 
 
550 aa  126  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.581828  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2597  indole-3-pyruvate decarboxylase  24.75 
 
 
550 aa  126  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.380997  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08870  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  24.92 
 
 
620 aa  126  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3554  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.73 
 
 
581 aa  125  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.743835  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0281  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  24.2 
 
 
554 aa  124  5e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1911  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  22.36 
 
 
573 aa  124  7e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.274178  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05291  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  23.17 
 
 
617 aa  123  9e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4239  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  26.9 
 
 
620 aa  123  1e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.469976  normal  0.302024 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0838  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  26.8 
 
 
576 aa  122  2e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00172744  normal  0.208315 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0605  acetolactate synthase, large subunit  24.39 
 
 
567 aa  122  2e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.102703 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0596  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  24.06 
 
 
573 aa  121  3e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.793346  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2242  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  25.22 
 
 
558 aa  120  5e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13018  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  26.71 
 
 
618 aa  120  6e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0170383  normal  0.298126 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0810  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  24.43 
 
 
595 aa  120  7e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.845021  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2114  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  26.26 
 
 
565 aa  120  9e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1952  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  26.19 
 
 
619 aa  120  1e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.338885  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1886  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  26.19 
 
 
619 aa  120  1e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0490387  normal  0.105007 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1906  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  26.19 
 
 
619 aa  120  1e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.365234  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001649  acetolactate synthase large subunit  23.09 
 
 
574 aa  119  2e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.546971  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2122  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  25.22 
 
 
625 aa  119  2e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.522117  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1070  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  24.43 
 
 
558 aa  119  2e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0531725  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1242  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  22.82 
 
 
563 aa  119  2e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2864  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.06 
 
 
659 aa  118  3e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.887934  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2843  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  23.72 
 
 
587 aa  118  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0984  thiamine pyrophosphate protein central region  24.91 
 
 
553 aa  118  3e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.351073 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1543  acetolactate synthase catalytic subunit  22.98 
 
 
587 aa  118  3e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.59725  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1090  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  26.44 
 
 
598 aa  117  4e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2490  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  23.88 
 
 
572 aa  118  4e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.156428  hitchhiker  0.00098132 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1114  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  24.73 
 
 
562 aa  117  4e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5914  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  23.91 
 
 
588 aa  117  5e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_64926  pyruvate decarboxylase  22.98 
 
 
596 aa  117  5e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.99262  normal  0.284292 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0634  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  24.19 
 
 
573 aa  117  6e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0951931  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2386  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  23.44 
 
 
572 aa  117  6e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0890713  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3437  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  22.77 
 
 
542 aa  117  6e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00701573  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0284  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.27 
 
 
555 aa  117  6e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1428  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  24.87 
 
 
564 aa  117  7e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00100174  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1973  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  23.44 
 
 
572 aa  116  9e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.417395  hitchhiker  2.55584e-05 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10680  acetolactate synthase, large subunit  26.12 
 
 
626 aa  116  9e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.141846 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1858  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  23.71 
 
 
582 aa  116  1e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.667431  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4544  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  23.79 
 
 
574 aa  116  1e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.145283  hitchhiker  4.05432e-05 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0929  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  25.4 
 
 
619 aa  116  1e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6021  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  25.51 
 
 
611 aa  116  1e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.265007  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>