More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1352 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_1352  UDP-glucose 4-epimerase  100 
 
 
329 aa  675    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  61.04 
 
 
328 aa  410  1e-113  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0940  UDP-glucose 4-epimerase  58.72 
 
 
327 aa  389  1e-107  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0282  UDP-glucose 4-epimerase  56.17 
 
 
328 aa  388  1e-107  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0273  UDP-glucose 4-epimerase  56.17 
 
 
328 aa  388  1e-107  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4242  UDP-glucose 4-epimerase  57.94 
 
 
332 aa  386  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4306  UDP-glucose 4-epimerase  60 
 
 
324 aa  386  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0064009  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0186  UDP-galactose 4-epimerase  54.29 
 
 
354 aa  379  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347724  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1064  UDP-glucose 4-epimerase  57.68 
 
 
328 aa  376  1e-103  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0537  UDP-glucose 4-epimerase  56.13 
 
 
328 aa  373  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0284  UDP-galactose 4-epimerase  53.21 
 
 
330 aa  368  1e-101  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.555091  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2084  UDP-glucose 4-epimerase  55.21 
 
 
328 aa  367  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1662  UDP-glucose 4-epimerase  53.52 
 
 
330 aa  365  1e-100  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1957  UDP-galactose 4-epimerase  56.21 
 
 
332 aa  365  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880811  normal  0.626313 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4279  UDP-galactose 4-epimerase  54.66 
 
 
333 aa  362  4e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.277879  normal  0.0248708 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1088  UDP-glucose 4-epimerase  57.41 
 
 
329 aa  362  5.0000000000000005e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1068  UDP-galactose 4-epimerase  51.99 
 
 
334 aa  362  7.0000000000000005e-99  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.715245  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3237  UDP-glucose 4-epimerase  51.69 
 
 
328 aa  361  9e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.218159  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2299  UDP-glucose 4-epimerase  55.9 
 
 
332 aa  360  2e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4827  UDP-glucose 4-epimerase  53.4 
 
 
329 aa  358  7e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.321852  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0339  UDP-galactose 4-epimerase  50.46 
 
 
331 aa  354  1e-96  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1369  UDP-glucose 4-epimerase  53.5 
 
 
333 aa  354  1e-96  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1923  UDP-glucose 4-epimerase  51.67 
 
 
331 aa  353  2e-96  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1166  UDP-glucose 4-epimerase  54.43 
 
 
330 aa  353  2.9999999999999997e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2205  UDP-glucose 4-epimerase  54.57 
 
 
327 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1089  UDP-glucose 4-epimerase  54.86 
 
 
323 aa  352  5.9999999999999994e-96  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4945  UDP-glucose 4-epimerase  52.73 
 
 
330 aa  351  8.999999999999999e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5114  UDP-glucose 4-epimerase  52.42 
 
 
330 aa  351  1e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5505  UDP-glucose 4-epimerase  52.42 
 
 
330 aa  351  1e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.678064  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5380  UDP-glucose 4-epimerase  52.42 
 
 
330 aa  350  2e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4960  UDP-glucose 4-epimerase  52.42 
 
 
330 aa  350  2e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00145973  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5056  UDP-glucose 4-epimerase  52.44 
 
 
330 aa  350  2e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5354  UDP-glucose 4-epimerase  52.42 
 
 
330 aa  350  2e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1402  UDP-galactose 4-epimerase  50.91 
 
 
332 aa  349  4e-95  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.232119  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5434  UDP-glucose 4-epimerase  52.12 
 
 
330 aa  348  9e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4141  UDP-glucose 4-epimerase  52.8 
 
 
332 aa  347  1e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0320  UDP-galactose 4-epimerase  51.55 
 
 
332 aa  347  1e-94  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4181  UDP-glucose 4-epimerase  52.8 
 
 
332 aa  346  3e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4455  UDP-glucose 4-epimerase  51.66 
 
 
330 aa  345  7e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000044018  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2916  UDP-glucose 4-epimerase  52.63 
 
 
320 aa  343  2e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.660815 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0043  UDP-glucose 4-epimerase  50.62 
 
 
337 aa  343  2e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0041  UDP-glucose 4-epimerase  50.31 
 
 
337 aa  343  2e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2242  UDP-galactose 4-epimerase  52 
 
 
326 aa  343  2e-93  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0608  UDP-glucose 4-epimerase  53.54 
 
 
324 aa  341  8e-93  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000293819  hitchhiker  0.00261597 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2187  UDP-galactose 4-epimerase  51.9 
 
 
327 aa  338  5.9999999999999996e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0673  UDP-galactose 4-epimerase  53.11 
 
 
337 aa  338  5.9999999999999996e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000299597 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0769  UDP-glucose 4-epimerase  51.72 
 
 
329 aa  338  5.9999999999999996e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0119  UDP-glucose 4-epimerase  51.52 
 
 
328 aa  338  9e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.500269  hitchhiker  0.00370533 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1342  UDP-glucose 4-epimerase  54.09 
 
 
332 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0418  UDP-glucose 4-epimerase  52.83 
 
 
326 aa  336  3.9999999999999995e-91  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1081  UDP-glucose 4-epimerase  53.46 
 
 
321 aa  336  3.9999999999999995e-91  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000142619  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1950  UDP-glucose 4-epimerase  50.3 
 
 
328 aa  335  5.999999999999999e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00010158  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0322  UDP-glucose 4-epimerase  51.99 
 
 
326 aa  335  7.999999999999999e-91  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2411  UDP-galactose 4-epimerase  49.22 
 
 
333 aa  335  9e-91  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.016358  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1702  UDP-galactose 4-epimerase  52.89 
 
 
331 aa  333  2e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.189185 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1324  UDP-glucose 4-epimerase  48.93 
 
 
330 aa  333  2e-90  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1555  UDP-glucose 4-epimerase  48.93 
 
 
330 aa  333  2e-90  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1708  UDP-glucose 4-epimerase  49.53 
 
 
331 aa  331  8e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.380668  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1125  UDP-glucose 4-epimerase  50.47 
 
 
329 aa  330  2e-89  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.333219  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2654  UDP-glucose 4-epimerase  50.92 
 
 
329 aa  329  3e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.933262  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1807  UDP-glucose 4-epimerase  49.69 
 
 
324 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1509  UDP-glucose 4-epimerase  51.53 
 
 
326 aa  326  3e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0386563  normal  0.0493544 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0768  UDP-galactose 4-epimerase  50 
 
 
337 aa  326  3e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2693  UDP-glucose 4-epimerase  49.09 
 
 
327 aa  324  1e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212619  normal  0.400076 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1573  UDP-galactose 4-epimerase  49.54 
 
 
328 aa  323  2e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  1.52654e-16 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1486  UDP-galactose 4-epimerase  51.27 
 
 
330 aa  322  5e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.608224 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1771  UDP-glucose 4-epimerase  47.56 
 
 
328 aa  320  9.999999999999999e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.333176  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0576  UDP-glucose 4-epimerase  50.31 
 
 
325 aa  320  3e-86  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3795  UDP-glucose 4-epimerase  47.71 
 
 
353 aa  316  4e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.611688 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2305  UDP-glucose 4-epimerase  47.52 
 
 
328 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.738706  normal  0.125833 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1183  UDP-glucose 4-epimerase  48.15 
 
 
351 aa  313  1.9999999999999998e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.119771  normal  0.642661 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0652  UDP-galactose 4-epimerase  47.52 
 
 
328 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.276662  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0647  UDP-glucose 4-epimerase  48.01 
 
 
334 aa  312  5.999999999999999e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.52379 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2340  UDP-glucose 4-epimerase  48.9 
 
 
328 aa  311  9e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169139  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3289  UDP-glucose 4-epimerase  46.48 
 
 
330 aa  311  1e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2339  UDP-glucose 4-epimerase  48.73 
 
 
338 aa  310  2e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000378791  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1503  UDP-glucose 4-epimerase  46.75 
 
 
324 aa  310  2e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.615148  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4249  UDP-galactose 4-epimerase  45.68 
 
 
327 aa  309  2.9999999999999997e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.444052 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0208  UDP-glucose 4-epimerase  49.84 
 
 
328 aa  309  4e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163102  normal  0.146368 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2242  UDP-glucose 4-epimerase  46.83 
 
 
334 aa  308  5.9999999999999995e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.558956  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0163  UDP-galactose 4-epimerase  46.54 
 
 
331 aa  307  2.0000000000000002e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.507846  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1224  UDP-glucose 4-epimerase  48.62 
 
 
328 aa  306  3e-82  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00236591  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3171  UDP-glucose 4-epimerase  48.3 
 
 
327 aa  305  5.0000000000000004e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5423  UDP-glucose 4-epimerase  48.02 
 
 
328 aa  305  6e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0946684  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0016  UDP-galactose 4-epimerase  47.83 
 
 
327 aa  305  7e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00490558  normal  0.701092 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3129  UDP-glucose 4-epimerase  50.47 
 
 
321 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.86735 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3859  UDP-glucose 4-epimerase  47.02 
 
 
327 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142705  normal  0.126757 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0137  UDP-glucose 4-epimerase  45.98 
 
 
356 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.169815 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1711  UDP-glucose 4-epimerase  46.54 
 
 
329 aa  303  2.0000000000000002e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0857741  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0464  UDP-glucose 4-epimerase  48.62 
 
 
327 aa  303  3.0000000000000004e-81  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0781477  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2493  UDP-glucose 4-epimerase  45.14 
 
 
350 aa  302  4.0000000000000003e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4409  UDP-glucose 4-epimerase  49.53 
 
 
316 aa  302  4.0000000000000003e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0368  UDP-glucose 4-epimerase  48.3 
 
 
323 aa  302  5.000000000000001e-81  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4187  UDP-glucose 4-epimerase  46.71 
 
 
327 aa  301  8.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335902  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0159  UDP-galactose 4-epimerase  46.11 
 
 
330 aa  300  2e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.15603  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1573  UDP-glucose 4-epimerase  46.91 
 
 
328 aa  300  3e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.95776  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18321  UDP-glucose 4-epimerase  46.88 
 
 
348 aa  300  3e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.161705  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4942  UDP-glucose 4-epimerase  46.44 
 
 
328 aa  300  3e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0332152  normal  0.293116 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1793  UDP-glucose 4-epimerase  46.11 
 
 
330 aa  299  4e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4205  UDP-glucose 4-epimerase  50.31 
 
 
318 aa  299  4e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>