130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_3079 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_3079  flagellar assembly protein FliH  100 
 
 
244 aa  484  1e-136  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.131312  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3805  flagellar assembly protein FliH  99.59 
 
 
244 aa  482  1e-135  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0570665  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4393  flagellar assembly protein FliH  63.68 
 
 
245 aa  267  1e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1115  flagellar assembly protein FliH  57.02 
 
 
247 aa  223  2e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.222897 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0640  flagellar assembly protein FliH  51.34 
 
 
303 aa  209  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0552  flagellar assembly protein FliH  40 
 
 
227 aa  176  2e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1018  flagellar assembly protein FliH  32.51 
 
 
261 aa  112  5e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0771  flagellar assembly protein FliH  29.17 
 
 
231 aa  86.7  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.24197  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1976  flagellar assembly protein FliH  29.38 
 
 
226 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0567  flagellar biosynthesis protein  33.19 
 
 
268 aa  84  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.448203  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1602  flagellar assembly protein FliH  28.19 
 
 
209 aa  82.4  0.000000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.292833 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1090  flagellar assembly protein FliH  29.83 
 
 
201 aa  81.3  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.486271 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0392  flagellar assembly protein H  31.4 
 
 
248 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5263  flagellar assembly protein H  31.72 
 
 
278 aa  80.1  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16543  normal  0.0759214 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0198  flagellar assembly protein H  31.87 
 
 
207 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5099  flagellar assembly protein H  32.8 
 
 
255 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.484808  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1500  flagellar assembly protein H  30.06 
 
 
264 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3652  flagellar assembly protein H  28.49 
 
 
245 aa  75.1  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.526766 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3928  flagellar assembly protein H  30.06 
 
 
260 aa  75.1  0.0000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4729  flagellar assembly protein H  28.49 
 
 
245 aa  75.1  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.249746  normal  0.0365414 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1160  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  29.31 
 
 
233 aa  73.9  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00966123 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3692  flagellar assembly protein H  29.24 
 
 
254 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.438422  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2977  flagellar assembly protein H  32.54 
 
 
227 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.575281 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3111  flagellar assembly protein H  32.54 
 
 
227 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.33418  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4367  flagellar assembly protein H  28.32 
 
 
263 aa  71.6  0.000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.631289 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3279  flagellar assembly protein H  31.87 
 
 
226 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2944  flagellar assembly protein H  31.87 
 
 
226 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.122685  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2144  flagellar assembly protein H  31.87 
 
 
226 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0232  flagellar assembly protein H  31.87 
 
 
226 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0216224  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3402  flagellar assembly protein H  31.87 
 
 
226 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0415  flagellar assembly protein H  31.87 
 
 
226 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.359601  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2357  flagellar assembly protein FliH  29.48 
 
 
243 aa  70.5  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3063  flagellar assembly protein H  33.53 
 
 
225 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0220  flagellar assembly protein H  30.77 
 
 
226 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.188523  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6415  flagellar assembly protein H  31.36 
 
 
227 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.491071 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3085  flagellar assembly protein H  32.94 
 
 
227 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0955445  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0164  flagellar assembly protein H  29.32 
 
 
227 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1347  flagellar assembly protein FliH  27.87 
 
 
251 aa  67.8  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4657  flagellar assembly protein FliH  32.53 
 
 
225 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.275761 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2933  flagellar assembly protein H  27.59 
 
 
225 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3772  flagellar assembly protein H  28.95 
 
 
227 aa  67  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.939362 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2902  flagellar assembly protein FliH  30.65 
 
 
201 aa  66.6  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0843  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like  31.71 
 
 
243 aa  65.9  0.0000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4268  flagellar assembly protein H  30.23 
 
 
267 aa  65.1  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0838142  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1967  flagellar assembly protein FliH  29.57 
 
 
242 aa  63.9  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.147072  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50110  flagellar assembly protein H  29.07 
 
 
268 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00973712 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2823  flagellar assembly protein H  29.07 
 
 
266 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.283065  normal  0.0158669 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3064  flagellar assembly protein FliH  27.93 
 
 
334 aa  61.2  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001188  flagellar assembly protein FliH  26.61 
 
 
251 aa  61.6  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1960  flagellar assembly protein Flih, putative  27.17 
 
 
272 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.31844  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1995  flagellar assembly protein FliH  30.11 
 
 
296 aa  61.2  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3455  flagellar assembly protein H  26.59 
 
 
272 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1538  flagellar assembly protein H  26.74 
 
 
268 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4211  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  27.08 
 
 
269 aa  58.2  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3045  flagellar assembly protein H  24.16 
 
 
266 aa  57.4  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16870  Flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein  27.22 
 
 
262 aa  57.4  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06187  flagellar assembly protein FliH  28.97 
 
 
206 aa  57  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00312706  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0081  flagellar assembly protein H  29.55 
 
 
251 aa  57  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00979  flagellar assembly protein FliH  28.97 
 
 
206 aa  57  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.360201  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02887  flagellar assembly protein H  23.05 
 
 
260 aa  56.6  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2452  flagellar assembly protein H  32.94 
 
 
227 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0964661  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3066  flagellar assembly protein H  32.94 
 
 
227 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00102567  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3302  flagellar assembly protein FliH  31.21 
 
 
257 aa  55.8  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0711  flagellar assembly protein FliH  30 
 
 
295 aa  55.5  0.0000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.487054 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1440  flagellar assembly protein FliH  21.47 
 
 
276 aa  55.5  0.0000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002817  flagellar assembly protein FliH  24.4 
 
 
266 aa  55.1  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3110  flagellar assembly protein fliH, putative  30.52 
 
 
304 aa  54.3  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4170  flagellar assembly protein FliH  28.24 
 
 
237 aa  54.3  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.299024  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1763  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  27.57 
 
 
231 aa  53.9  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24210  Flagellar assembly protein  27.5 
 
 
245 aa  54.3  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0165568  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2186  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like  29.14 
 
 
349 aa  53.5  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0773  flagellar assembly protein FliH  31.45 
 
 
252 aa  52.8  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1652  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like  30.15 
 
 
259 aa  52.8  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0257969  normal  0.368301 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0690  flagellar assembly protein FliH  25.68 
 
 
249 aa  52.8  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1957  flagellar assembly protein FliH  24.43 
 
 
252 aa  52.4  0.000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.253082  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1284  flagellar assembly protein H  22.81 
 
 
316 aa  52.4  0.000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2295  flagellar assembly protein H  29.89 
 
 
300 aa  52.4  0.000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.931717 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2574  flagellar assembly protein H  26.92 
 
 
318 aa  52.4  0.000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.412103  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03160  flagellar assembly protein H  23.35 
 
 
266 aa  52.4  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3428  flagellar assembly protein fliH, putative  33.33 
 
 
250 aa  52  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1715  flagellar assembly protein H  25.15 
 
 
270 aa  52  0.000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2406  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  23.46 
 
 
238 aa  51.6  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04975  flagellar assembly protein H  25.82 
 
 
224 aa  51.6  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1351  flagellar assembly protein H  22.81 
 
 
316 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.143361  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2934  flagellar assembly protein H  25.94 
 
 
338 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1878  flagellar assembly protein FliH  28.57 
 
 
213 aa  50.8  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.479163  normal  0.528624 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1574  flagellar assembly protein H  23.81 
 
 
251 aa  51.2  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2042  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  30.06 
 
 
224 aa  51.2  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3380  flagellar assembly protein H  26.43 
 
 
236 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.972464  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0474  flagellar assembly protein H  22.62 
 
 
264 aa  50.1  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0571  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  25.37 
 
 
242 aa  50.1  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4415  flagellar assembly protein H  28.57 
 
 
230 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.127482 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1542  flagellar assembly protein FliH  22.36 
 
 
231 aa  50.1  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0252  flagellar assembly protein H  25.56 
 
 
236 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0412  flagellar assembly protein fliH, putative  32.54 
 
 
293 aa  49.3  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0496  flagellar assembly protein FliH  26.9 
 
 
307 aa  48.9  0.00007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3066  flagellar assembly protein H  25.47 
 
 
338 aa  48.9  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.934094 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0976  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  28.65 
 
 
220 aa  48.9  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1439  flagellar assembly protein H  25.47 
 
 
338 aa  48.5  0.00009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1368  flagellar assembly protein FliH  24.85 
 
 
339 aa  48.5  0.00009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.981358 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>