More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1193 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1193  cytochrome P450  100 
 
 		 390 aa  780    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.577803 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1726  cytochrome P450  63.09 
 
 		 387 aa  452  1.0000000000000001e-126  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.319126 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1816  cytochrome P450  57.29 
 
 		 415 aa  426  1e-118  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.393276  normal  0.302822 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1946  cytochrome P450 hydroxylase  54.31 
 
 		 393 aa  389  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0597  cytochrome P450  54.57 
 
 		 393 aa  390  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.16463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0342  cytochrome P450  54.1 
 
 		 407 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0869  cytochrome P450  45.86 
 
 		 415 aa  328  7e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.610072  normal  0.98941 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1245  cytochrome P450  43.83 
 
 		 414 aa  312  6.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1336  cytochrome P450  43.58 
 
 		 414 aa  310  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.204499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1694  cytochrome P450 hydroxylase  44.44 
 
 		 414 aa  304  2.0000000000000002e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.103657  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  42.86 
 
 		 402 aa  281  1e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1451  cytochrome P450  41.56 
 
 		 405 aa  262  6.999999999999999e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.729337 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  38.99 
 
 		 399 aa  251  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0077  cytochrome P450  38.72 
 
 		 410 aa  245  8e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2064  cytochrome P450  37.78 
 
 		 408 aa  236  6e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.680222 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0642  cytochrome P450  36.56 
 
 		 410 aa  232  1e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0366485 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0944  cytochrome P450  40.62 
 
 		 396 aa  228  1e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.46154 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3536  cytochrome P450  40.15 
 
 		 391 aa  228  1e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00204069  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  37.5 
 
 		 412 aa  223  6e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  37.03 
 
 		 402 aa  213  3.9999999999999995e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6987  putative cytochrome P450  37.34 
 
 		 409 aa  213  5.999999999999999e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0660812 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11908  cytochrome P450 140 cyp140  38.79 
 
 		 438 aa  211  2e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.818643 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  37.02 
 
 		 398 aa  209  7e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  35.86 
 
 		 401 aa  205  9e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0420  cytochrome P450  39.41 
 
 		 447 aa  205  9e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0288  cytochrome P450  39.94 
 
 		 444 aa  205  1e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.0000866708  normal  0.107645 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0433  cytochrome P450  39.09 
 
 		 447 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0443  cytochrome P450  39.09 
 
 		 447 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0122986 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2217  cytochrome P450  35.96 
 
 		 417 aa  203  3e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000207738  decreased coverage  0.000000904548 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1229  cytochrome P450  37.81 
 
 		 405 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  32.5 
 
 		 410 aa  201  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  37.28 
 
 		 407 aa  200  3e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3938  cytochrome P450  38.48 
 
 		 417 aa  200  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0168475 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0600  cytochrome P450  36.15 
 
 		 443 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.441621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  37.04 
 
 		 407 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  37.04 
 
 		 407 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1930  cytochrome P450  37.82 
 
 		 429 aa  195  1e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.708059 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3964  cytochrome P450  37.19 
 
 		 423 aa  195  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403344  normal  0.433493 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1608  cytochrome P450  39.19 
 
 		 416 aa  194  3e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.894041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  38.4 
 
 		 412 aa  194  3e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4666  cytochrome P450  37.65 
 
 		 450 aa  193  3e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  36.41 
 
 		 405 aa  193  5e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  31.87 
 
 		 420 aa  193  5e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8494  cytochrome P450  35.9 
 
 		 409 aa  192  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.880445 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1428  cytochrome P450  33.74 
 
 		 405 aa  191  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5579  cytochrome P450  35 
 
 		 419 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  34.21 
 
 		 410 aa  190  4e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2495  cytochrome P450  35.42 
 
 		 464 aa  190  4e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.209676  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2330  putative cytochrome P450 hydroxylase(monooxygenase)  34.59 
 
 		 417 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.998685  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2480  cytochrome P450  34.35 
 
 		 408 aa  187  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.59505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3880  cytochrome P450  36.59 
 
 		 413 aa  187  3e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123005  normal  0.0220713 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4481  cytochrome P450  35.41 
 
 		 411 aa  186  4e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0557214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0804  cytochrome P450  33.5 
 
 		 407 aa  186  6e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  32.71 
 
 		 411 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  32.71 
 
 		 411 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5447  cytochrome P450  35.73 
 
 		 399 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154914  normal  0.0468411 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4384  cytochrome P450  41.67 
 
 		 400 aa  185  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  32.18 
 
 		 411 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  32.45 
 
 		 411 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  32.45 
 
 		 411 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0979  cytochrome P450  34.26 
 
 		 407 aa  184  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492068  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  32.45 
 
 		 411 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0674  cytochrome P450  34.72 
 
 		 421 aa  183  5.0000000000000004e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.544663  normal  0.200583 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  32.45 
 
 		 411 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1856  cytochrome P450  34.18 
 
 		 417 aa  182  6e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654752  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  35.64 
 
 		 408 aa  182  6e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_003296  RS01740  putative cytochrome P-450-like monooxygenase oxidoreductase protein  34.21 
 
 		 398 aa  182  7e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2115  cytochrome P450  39.15 
 
 		 430 aa  182  7e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4000  cytochrome P450  35.16 
 
 		 412 aa  182  7e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  0.53904 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  35.92 
 
 		 426 aa  182  8.000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2663  cytochrome P450  34.17 
 
 		 408 aa  182  1e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4369  cytochrome P450  34.91 
 
 		 412 aa  182  1e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  37.8 
 
 		 406 aa  182  1e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  32.36 
 
 		 411 aa  181  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0160  cytochrome P450  35.89 
 
 		 413 aa  181  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.486467  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  35.84 
 
 		 400 aa  181  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3940  cytochrome P450  38.36 
 
 		 427 aa  180  4.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0174987 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2531  cytochrome P450  34.18 
 
 		 408 aa  179  8e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4029  cytochrome P450  33.5 
 
 		 422 aa  179  9e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.738217 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1189  cytochrome P450  34.96 
 
 		 404 aa  178  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351372  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1853  cytochrome P450-like enzyme  33.42 
 
 		 402 aa  179  1e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  32.1 
 
 		 411 aa  178  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  31.03 
 
 		 411 aa  178  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  34.21 
 
 		 392 aa  176  6e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  30.83 
 
 		 411 aa  176  7e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2331  cytochrome P450  32.43 
 
 		 417 aa  176  9e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.24175 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1782  cytochrome P450  33.42 
 
 		 402 aa  175  9e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.379724  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2844  putative cytochrome P450  32.39 
 
 		 409 aa  176  9e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.681869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3155  cytochrome P450  30.91 
 
 		 422 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.66527  normal  0.0133276 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3652  cytochrome P450  35.64 
 
 		 406 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  35.88 
 
 		 423 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1426  cytochrome P450  36.73 
 
 		 414 aa  174  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4939  cytochrome P450  34.95 
 
 		 404 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1870  cytochrome P-450 hydroxylase  34.65 
 
 		 400 aa  172  5.999999999999999e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  36.05 
 
 		 411 aa  173  5.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1807  cytochrome P450  33.92 
 
 		 405 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.154982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0067  cytochrome P450  33.74 
 
 		 423 aa  172  7.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.838674 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  38.23 
 
 		 402 aa  172  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6078  cytochrome P450  32.59 
 
 		 414 aa  172  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  32.91 
 
 		 412 aa  171  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>