More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2180 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_2180  GTPase ObgE  100 
 
 		 350 aa  714    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.236885  normal  0.801258 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2056  GTPase ObgE  60.36 
 
 		 366 aa  396  1e-109  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.520405  normal  0.906933 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2690  GTPase ObgE  57.18 
 
 		 366 aa  382  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.931281  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1378  GTPase ObgE  60.71 
 
 		 368 aa  380  1e-104  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2248  GTPase ObgE  60.59 
 
 		 366 aa  381  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0879905  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3419  GTPase ObgE  57.77 
 
 		 345 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0088  GTP-binding protein Obg/CgtA  52.11 
 
 		 333 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00208899  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2113  GTPase ObgE  50.15 
 
 		 423 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0084934  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14100  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.29 
 
 		 426 aa  302  6.000000000000001e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000264035  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  49.7 
 
 		 346 aa  297  2e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  50 
 
 		 435 aa  293  3e-78  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1010  GTPase ObgE  49.55 
 
 		 338 aa  292  7e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  49.86 
 
 		 435 aa  290  2e-77  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  47.85 
 
 		 427 aa  288  1e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1986  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.41 
 
 		 340 aa  288  1e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0306  GTPase ObgE  50.76 
 
 		 338 aa  287  2e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00590808  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2574  GTPase ObgE  48.25 
 
 		 341 aa  287  2e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5260  GTPase ObgE  48.94 
 
 		 338 aa  287  2e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.281751 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2702  GTPase ObgE  49.4 
 
 		 341 aa  286  2.9999999999999996e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1817  GTPase ObgE  49.85 
 
 		 354 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.389419  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2445  GTPase ObgE  46.94 
 
 		 337 aa  286  4e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0476  GTPase ObgE  48.42 
 
 		 395 aa  286  5e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4115  GTPase ObgE  50.45 
 
 		 352 aa  285  9e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.593697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1027  GTPase ObgE  47.26 
 
 		 440 aa  284  1.0000000000000001e-75  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.25 
 
 		 434 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0157  GTPase ObgE  50.45 
 
 		 349 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.526376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0513  hypothetical protein  49.85 
 
 		 370 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.609745  normal  0.0660512 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2078  GTPase ObgE  50.61 
 
 		 327 aa  283  3.0000000000000004e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0857  GTPase ObgE  48.86 
 
 		 397 aa  283  3.0000000000000004e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.121335  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3213  GTPase ObgE  51.21 
 
 		 338 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59735  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0185  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.65 
 
 		 417 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0252  GTPase ObgE  47.11 
 
 		 337 aa  282  6.000000000000001e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0998753  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2581  GTPase ObgE  51.28 
 
 		 356 aa  282  7.000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.96662e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3197  GTPase ObgE  50.3 
 
 		 338 aa  281  1e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312232  unclonable  1.844e-23 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0959  GTPase ObgE  48.26 
 
 		 343 aa  281  1e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0372  GTPase ObgE  47.37 
 
 		 434 aa  280  3e-74  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1323  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.59 
 
 		 425 aa  280  4e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.010857  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2309  GTPase ObgE  49.09 
 
 		 326 aa  279  4e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000014819  normal  0.214603 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1121  GTPase ObgE  50.72 
 
 		 350 aa  280  4e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.261529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1480  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.96 
 
 		 348 aa  279  6e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3208  GTPase ObgE  49.57 
 
 		 347 aa  279  6e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1631  GTPase ObgE  48.96 
 
 		 397 aa  278  7e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2217  GTPase ObgE  49.14 
 
 		 353 aa  278  8e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000677684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3680  GTPase ObgE  47.83 
 
 		 406 aa  278  1e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.96249 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5206  GTPase ObgE  47.83 
 
 		 406 aa  277  2e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.683682  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2954  GTPase ObgE  48.63 
 
 		 338 aa  277  2e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4056  GTPase ObgE  48.41 
 
 		 343 aa  277  2e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.747306 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3275  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.61 
 
 		 369 aa  276  3e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000381573 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60445  GTPase ObgE  47.54 
 
 		 406 aa  276  3e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233536 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0343  GTPase ObgE  47.99 
 
 		 346 aa  276  4e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000591605  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1525  GTPase ObgE  45.68 
 
 		 357 aa  276  4e-73  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0511  GTPase ObgE  50 
 
 		 329 aa  276  5e-73  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.130161  normal  0.255445 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0157  GTPase ObgE  49.54 
 
 		 353 aa  276  6e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2532  GTP1/OBG domain-containing protein  48.84 
 
 		 422 aa  275  6e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.382744  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3641  small GTP-binding protein  50.57 
 
 		 348 aa  275  7e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.587865  normal  0.516645 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0658  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.2 
 
 		 438 aa  275  9e-73  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000277499  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4390  GTPase ObgE  47.15 
 
 		 329 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3644  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.36 
 
 		 336 aa  275  1.0000000000000001e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0336528  normal  0.0121811 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4453  GTPase ObgE  47.15 
 
 		 329 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.584179 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0164  GTPase ObgE  49.39 
 
 		 338 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000099426  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2537  GTPase ObgE  49.25 
 
 		 428 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53833  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0147  GTPase ObgE  48.79 
 
 		 338 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3472  GTPase ObgE  46.67 
 
 		 363 aa  273  3e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.004996  normal  0.428622 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1582  GTPase ObgE  45.86 
 
 		 357 aa  273  4.0000000000000004e-72  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4918  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.41 
 
 		 344 aa  272  6e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.217297  normal  0.622557 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4873  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.46 
 
 		 344 aa  272  7e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0700899 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4410  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.46 
 
 		 344 aa  272  7e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0584  GTPase ObgE  51.12 
 
 		 353 aa  271  9e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2007  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.73 
 
 		 356 aa  271  1e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.339199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0165  GTPase ObgE  47.13 
 
 		 343 aa  271  1e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.91407 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3280  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.3 
 
 		 346 aa  271  1e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0275403 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0929  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.98 
 
 		 426 aa  271  2e-71  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0009475  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0415  GTP-binding protein Obg/CgtA  50 
 
 		 348 aa  271  2e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.345643 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3952  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.53 
 
 		 350 aa  270  2e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1601  GTPase ObgE  54.21 
 
 		 402 aa  270  2e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000135042  hitchhiker  0.000110073 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1681  GTPase ObgE  49.71 
 
 		 339 aa  270  2.9999999999999997e-71  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00207916  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0251  GTPase ObgE  49.24 
 
 		 353 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0248  GTPase ObgE  45.61 
 
 		 392 aa  270  2.9999999999999997e-71  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1609  spo0B-associated GTP-binding protein  47.99 
 
 		 419 aa  270  2.9999999999999997e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.24468  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1142  GTPase ObgE  48.19 
 
 		 372 aa  270  4e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0642  GTPase ObgE  45.86 
 
 		 336 aa  269  4e-71  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.300395  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0498  GTPase ObgE  49.71 
 
 		 339 aa  269  4e-71  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000072734  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0163  GTP1/OBG subdomain-containing protein  49.07 
 
 		 424 aa  270  4e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1010  GTPase ObgE  45.71 
 
 		 402 aa  269  5e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000125239  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0751  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.93 
 
 		 415 aa  269  5.9999999999999995e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000093637  hitchhiker  0.00586809 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2049  GTPase ObgE  48.57 
 
 		 359 aa  269  5.9999999999999995e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.390946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3350  GTP1/OBG domain-containing protein  46.45 
 
 		 387 aa  269  5.9999999999999995e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2956  GTPase ObgE  50.3 
 
 		 365 aa  268  7e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3487  GTPase ObgE  47.77 
 
 		 372 aa  268  8e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0912  GTPase ObgE  48.5 
 
 		 432 aa  268  8e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1650  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.81 
 
 		 439 aa  268  8.999999999999999e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3524  GTPase ObgE  47.77 
 
 		 372 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3260  GTPase ObgE  47.77 
 
 		 372 aa  268  1e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0444  GTPase ObgE  47.77 
 
 		 372 aa  268  1e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2521  GTPase ObgE  47.77 
 
 		 372 aa  268  1e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.685664  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0423  GTPase ObgE  50.64 
 
 		 356 aa  268  1e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3522  GTPase ObgE  47.77 
 
 		 372 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.091064  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2655  GTPase ObgE  49.55 
 
 		 364 aa  268  1e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.031606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1303  GTPase ObgE  47.77 
 
 		 372 aa  268  1e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2789  small GTP-binding protein  48.52 
 
 		 351 aa  268  1e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>